73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4685 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3553  polysaccharide biosynthesis protein  77.88 
 
 		 458 aa  674    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2754  polysaccharide biosynthesis protein  77.38 
 
 		 460 aa  668    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.316209  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1391  polysaccharide biosynthesis protein  88.08 
 
 		 456 aa  731    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4001  polysaccharide biosynthesis protein  77.63 
 
 		 455 aa  670    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.443077 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4685  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 453 aa  894    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1411  polysaccharide biosynthesis protein  88.74 
 
 		 456 aa  738    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6968  PST family polysaccharide export protein  78.09 
 
 		 458 aa  598  1e-170  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.756164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1020  polysaccharide biosynthesis protein  36.79 
 
 		 490 aa  288  1e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2520  polysaccharide biosynthesis protein  38.57 
 
 		 474 aa  276  6e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.889784 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3018  polysaccharide biosynthesis protein  35.33 
 
 		 468 aa  269  8e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2996  polysaccharide biosynthesis protein  37.29 
 
 		 459 aa  261  1e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143417 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3541  polysaccharide biosynthesis protein  36.47 
 
 		 474 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3832  polysaccharide biosynthesis protein  36.67 
 
 		 471 aa  251  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.431872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3983  polysaccharide biosynthesis associated protein  36.24 
 
 		 467 aa  248  1e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0926  polysaccharide biosynthesis protein  35.9 
 
 		 458 aa  194  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.287187 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2373  polysaccharide biosynthesis protein  35.99 
 
 		 446 aa  194  3e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.308358  hitchhiker  0.00106477 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0987  polysaccharide biosynthesis protein  35.05 
 
 		 458 aa  193  6e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.676741 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0950  polysaccharide biosynthesis protein  35.11 
 
 		 458 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0259794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5559  polysaccharide biosynthesis protein  37.97 
 
 		 442 aa  171  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261987  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5327  polysaccharide biosynthesis protein  38.07 
 
 		 445 aa  156  9e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0472551  normal  0.0858273 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0890  polysaccharide biosynthesis protein  29.31 
 
 		 407 aa  108  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362175  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1836  polysaccharide biosynthesis protein  24.63 
 
 		 446 aa  95.9  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1796  polysaccharide biosynthesis protein  24.66 
 
 		 453 aa  95.5  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3797  polysaccharide biosynthesis protein  25.54 
 
 		 461 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.683173  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2684  polysaccharide biosynthesis protein  26.02 
 
 		 539 aa  94.7  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2073  polysaccharide biosynthesis protein  24.57 
 
 		 492 aa  84.3  0.000000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  22.2 
 
 		 499 aa  84  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  25.18 
 
 		 512 aa  83.6  0.000000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1211  polysaccharide biosynthesis protein  24.07 
 
 		 489 aa  76.6  0.0000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2304  polysaccharide biosynthesis protein  27.06 
 
 		 494 aa  72  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.298994  normal  0.0362143 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0172  polysaccharide efflux transporter, putative  29.52 
 
 		 495 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.377433 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1767  polysaccharide biosynthesis protein  26.63 
 
 		 447 aa  69.7  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0935149 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  24.7 
 
 		 423 aa  68.9  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0777  polysaccharide biosynthesis protein  23.82 
 
 		 441 aa  67.8  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  23.62 
 
 		 483 aa  63.5  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8594  polysaccharide biosynthesis protein  25.68 
 
 		 434 aa  58.9  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1862  polysaccharide efflux transporter, putative  27.17 
 
 		 496 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2438  polysaccharide biosynthesis protein  25.41 
 
 		 495 aa  55.8  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2457  polysaccharide biosynthesis protein  21.43 
 
 		 514 aa  55.1  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.267844  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1004  teichoic acid export membrane protein  23.94 
 
 		 450 aa  53.5  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0945  multi antimicrobial extrusion protein MatE  25.71 
 
 		 495 aa  52.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.903745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4091  polysaccharide biosynthesis protein  19.35 
 
 		 430 aa  52.8  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1593  polysaccharide biosynthesis protein  25.58 
 
 		 504 aa  52.8  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4321  polysaccharide biosynthesis protein  25.63 
 
 		 456 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1933  polysaccharide biosynthesis protein  31.63 
 
 		 135 aa  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.546859 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1107  putative membrane protein involved in export of O-antigen  23.58 
 
 		 450 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.361388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0561  polysaccharide biosynthesis protein  26.15 
 
 		 456 aa  51.2  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1836  hypothetical protein  28.19 
 
 		 523 aa  51.2  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3272  polysaccharide biosynthesis protein  24.07 
 
 		 546 aa  50.8  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.509561  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2950  glycosyl transferase group 1  24.88 
 
 		 899 aa  50.4  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5069  Membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid-like protein  22.48 
 
 		 489 aa  50.1  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.932341  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2006  polysaccharide biosynthesis protein  32.84 
 
 		 529 aa  50.1  0.00009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.300214  normal  0.433718 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  20.96 
 
 		 517 aa  49.3  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2278  polysaccharide biosynthesis protein  27.06 
 
 		 516 aa  48.9  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1128  polysaccharide biosynthesis protein  24.82 
 
 		 547 aa  48.5  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3720  polysaccharide biosynthesis protein  24.41 
 
 		 470 aa  48.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.293935  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2971  polysaccharide biosynthesis protein  23.03 
 
 		 475 aa  48.1  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.224966  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  23.1 
 
 		 490 aa  48.1  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1608  polysaccharide biosynthesis protein  25.25 
 
 		 492 aa  48.5  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2947  polysaccharide biosynthesis protein  25.41 
 
 		 484 aa  48.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0933  stage V sporulation protein B  24.05 
 
 		 520 aa  47.4  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1942  polysaccharide biosynthesis protein  27.27 
 
 		 464 aa  46.6  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.634447  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0506  polysaccharide biosynthesis protein  23.67 
 
 		 583 aa  46.6  0.0009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0040  polysaccharide biosynthesis protein  17.98 
 
 		 435 aa  46.6  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000125854  normal  0.0319641 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0414  polysaccharide biosynthesis protein  19.71 
 
 		 500 aa  46.6  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37906  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05198  hypothetical protein  23.39 
 
 		 435 aa  46.6  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  21.58 
 
 		 490 aa  45.8  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001317  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsJ Membrane protein export of O-antigen and teichoic acid  23.7 
 
 		 435 aa  45.8  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.872862  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1685  polysaccharide biosynthesis protein  24.52 
 
 		 441 aa  44.7  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.929392  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0259  polysaccharide biosynthesis protein  21.23 
 
 		 498 aa  44.3  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1009  polysaccharide biosynthesis protein  28.38 
 
 		 536 aa  43.9  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1827  hypothetical protein  25.5 
 
 		 522 aa  43.9  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.356009  normal  0.0154869 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  24.6 
 
 		 444 aa  43.5  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>