36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4321 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4321  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 456 aa  853    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2996  polysaccharide biosynthesis protein  29.12 
 
 		 459 aa  108  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143417 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3018  polysaccharide biosynthesis protein  26.39 
 
 		 468 aa  98.2  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2520  polysaccharide biosynthesis protein  29.9 
 
 		 474 aa  87.8  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.889784 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3335  hypothetical protein  74.14 
 
 		 118 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.359065  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1020  polysaccharide biosynthesis protein  27.29 
 
 		 490 aa  85.1  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3553  polysaccharide biosynthesis protein  25.96 
 
 		 458 aa  80.1  0.00000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3832  polysaccharide biosynthesis protein  27.23 
 
 		 471 aa  78.2  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.431872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1796  polysaccharide biosynthesis protein  23.22 
 
 		 453 aa  77.8  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3541  polysaccharide biosynthesis protein  27.89 
 
 		 474 aa  77  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3983  polysaccharide biosynthesis associated protein  28.35 
 
 		 467 aa  75.1  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4001  polysaccharide biosynthesis protein  24.81 
 
 		 455 aa  74.3  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.443077 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1391  polysaccharide biosynthesis protein  25.19 
 
 		 456 aa  74.3  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2754  polysaccharide biosynthesis protein  24.82 
 
 		 460 aa  72.8  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.316209  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4685  polysaccharide biosynthesis protein  25.13 
 
 		 453 aa  71.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1411  polysaccharide biosynthesis protein  24.09 
 
 		 456 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1836  polysaccharide biosynthesis protein  27.14 
 
 		 446 aa  65.9  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  26.11 
 
 		 499 aa  63.9  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1767  polysaccharide biosynthesis protein  22.65 
 
 		 447 aa  63.2  0.000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0935149 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6968  PST family polysaccharide export protein  24.1 
 
 		 458 aa  61.2  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.756164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2684  polysaccharide biosynthesis protein  26.42 
 
 		 539 aa  57.8  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4091  polysaccharide biosynthesis protein  20.13 
 
 		 430 aa  57  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5327  polysaccharide biosynthesis protein  33.33 
 
 		 445 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0472551  normal  0.0858273 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2947  polysaccharide biosynthesis protein  24.89 
 
 		 484 aa  53.9  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  26.07 
 
 		 512 aa  52.4  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1211  polysaccharide biosynthesis protein  26.94 
 
 		 489 aa  50.8  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1685  polysaccharide biosynthesis protein  23.39 
 
 		 441 aa  50.4  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.929392  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  25.24 
 
 		 444 aa  49.7  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3797  polysaccharide biosynthesis protein  23.61 
 
 		 461 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.683173  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0777  polysaccharide biosynthesis protein  24.68 
 
 		 441 aa  49.3  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0172  polysaccharide efflux transporter, putative  25.87 
 
 		 495 aa  48.1  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.377433 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2373  polysaccharide biosynthesis protein  24.15 
 
 		 446 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.308358  hitchhiker  0.00106477 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08851  hypothetical protein  22.65 
 
 		 484 aa  47.8  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.227884  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2188  polysaccharide biosynthesis protein  23.75 
 
 		 495 aa  47.8  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0890  polysaccharide biosynthesis protein  25.68 
 
 		 407 aa  47.4  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362175  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3971  polysaccharide biosynthesis protein  33.33 
 
 		 582 aa  44.7  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.137474  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>