84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1020 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_1020  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
490 aa  975    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3018  polysaccharide biosynthesis protein  51.18 
 
 
468 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2520  polysaccharide biosynthesis protein  49.12 
 
 
474 aa  417  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.889784 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3832  polysaccharide biosynthesis protein  48.91 
 
 
471 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.431872  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3541  polysaccharide biosynthesis protein  48.91 
 
 
474 aa  403  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3983  polysaccharide biosynthesis associated protein  47.31 
 
 
467 aa  392  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2996  polysaccharide biosynthesis protein  40.18 
 
 
459 aa  312  9e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.143417 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4001  polysaccharide biosynthesis protein  40.88 
 
 
455 aa  306  6e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.443077 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3553  polysaccharide biosynthesis protein  35.79 
 
 
458 aa  284  3.0000000000000004e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2754  polysaccharide biosynthesis protein  36.02 
 
 
460 aa  283  4.0000000000000003e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.316209  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1411  polysaccharide biosynthesis protein  37.79 
 
 
456 aa  277  3e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1391  polysaccharide biosynthesis protein  37.79 
 
 
456 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4685  polysaccharide biosynthesis protein  36.79 
 
 
453 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6968  PST family polysaccharide export protein  39.34 
 
 
458 aa  269  8.999999999999999e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.756164  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0987  polysaccharide biosynthesis protein  35.17 
 
 
458 aa  194  3e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.676741 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2373  polysaccharide biosynthesis protein  35.41 
 
 
446 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.308358  hitchhiker  0.00106477 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0926  polysaccharide biosynthesis protein  34.36 
 
 
458 aa  187  3e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.287187 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0950  polysaccharide biosynthesis protein  34.64 
 
 
458 aa  178  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0259794  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5559  polysaccharide biosynthesis protein  36.44 
 
 
442 aa  170  6e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261987  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5327  polysaccharide biosynthesis protein  37.75 
 
 
445 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0472551  normal  0.0858273 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1796  polysaccharide biosynthesis protein  27.74 
 
 
453 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1836  polysaccharide biosynthesis protein  27.36 
 
 
446 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3797  polysaccharide biosynthesis protein  26.52 
 
 
461 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.683173  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1211  polysaccharide biosynthesis protein  34.38 
 
 
489 aa  95.9  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2073  polysaccharide biosynthesis protein  31.69 
 
 
492 aa  83.2  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0890  polysaccharide biosynthesis protein  30.13 
 
 
407 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362175  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  30.06 
 
 
499 aa  81.3  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2304  polysaccharide biosynthesis protein  29.63 
 
 
494 aa  79.7  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.298994  normal  0.0362143 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  23.41 
 
 
423 aa  74.7  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2684  polysaccharide biosynthesis protein  24.22 
 
 
539 aa  73.2  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0639  polysaccharide biosynthesis protein  23.71 
 
 
458 aa  69.3  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.216711  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0172  polysaccharide efflux transporter, putative  29.41 
 
 
495 aa  69.7  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.377433 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0945  multi antimicrobial extrusion protein MatE  28.31 
 
 
495 aa  68.9  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.903745  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  23.62 
 
 
512 aa  68.2  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2438  polysaccharide biosynthesis protein  22.46 
 
 
495 aa  67.8  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  23.5 
 
 
517 aa  65.1  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  29.38 
 
 
444 aa  64.7  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  24.32 
 
 
444 aa  63.5  0.000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1685  polysaccharide biosynthesis protein  24.45 
 
 
441 aa  62.8  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.929392  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4091  polysaccharide biosynthesis protein  21.15 
 
 
430 aa  62  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1965  polysaccharide biosynthesis protein  26.94 
 
 
463 aa  62.4  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0295315 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4321  polysaccharide biosynthesis protein  27.64 
 
 
456 aa  62  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2188  polysaccharide biosynthesis protein  32.04 
 
 
495 aa  62  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2457  polysaccharide biosynthesis protein  23.09 
 
 
514 aa  61.6  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.267844  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1767  polysaccharide biosynthesis protein  25.98 
 
 
447 aa  60.8  0.00000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0935149 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0777  polysaccharide biosynthesis protein  21.67 
 
 
441 aa  61.2  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  26.67 
 
 
444 aa  59.7  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1836  hypothetical protein  30.46 
 
 
523 aa  58.2  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1593  polysaccharide biosynthesis protein  29 
 
 
504 aa  57.4  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1862  polysaccharide efflux transporter, putative  24.94 
 
 
496 aa  57.4  0.0000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8594  polysaccharide biosynthesis protein  27.03 
 
 
434 aa  56.6  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2006  polysaccharide biosynthesis protein  30.99 
 
 
529 aa  56.2  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.300214  normal  0.433718 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1107  putative membrane protein involved in export of O-antigen  20.9 
 
 
450 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.361388  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2602  polysaccharide biosynthesis protein  23.9 
 
 
448 aa  55.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1004  teichoic acid export membrane protein  22.46 
 
 
450 aa  55.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2285  polysaccharide biosynthesis protein  23.17 
 
 
449 aa  55.1  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.398242  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3971  polysaccharide biosynthesis protein  29.13 
 
 
582 aa  54.3  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.137474  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3876  polysaccharide biosynthesis protein  28.02 
 
 
427 aa  53.9  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1827  hypothetical protein  30.46 
 
 
522 aa  53.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.356009  normal  0.0154869 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  25.96 
 
 
483 aa  52.4  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5069  Membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid-like protein  22.48 
 
 
489 aa  50.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.932341  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2947  polysaccharide biosynthesis protein  26.67 
 
 
484 aa  48.9  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2047  polysaccharide biosynthesis protein  30.99 
 
 
504 aa  48.5  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.82849  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1933  polysaccharide biosynthesis protein  32.65 
 
 
135 aa  47.8  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.546859 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0344  polysaccharide biosynthesis protein  28.66 
 
 
430 aa  47.4  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0233913 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2139  polysaccharide biosynthesis protein  29.79 
 
 
482 aa  47.4  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00876576  normal  0.418146 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1608  polysaccharide biosynthesis protein  24.54 
 
 
492 aa  47  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0259  polysaccharide biosynthesis protein  27.32 
 
 
498 aa  47  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1071  polysaccharide biosynthesis protein  26.2 
 
 
489 aa  47  0.0009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001317  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsJ Membrane protein export of O-antigen and teichoic acid  23.71 
 
 
435 aa  47  0.0009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.872862  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1846  polysaccharide biosynthesis protein  22.41 
 
 
433 aa  46.6  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0483  polysaccharide biosynthesis protein  27.66 
 
 
477 aa  45.4  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0744  polysaccharide biosynthesis protein  25.37 
 
 
436 aa  45.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.923042  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2910  polysaccharide biosynthesis protein  29.57 
 
 
485 aa  45.8  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4270  hypothetical protein  32.89 
 
 
499 aa  45.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.796058 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0506  polysaccharide biosynthesis protein  26.19 
 
 
583 aa  45.1  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  25.68 
 
 
490 aa  45.1  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0040  polysaccharide biosynthesis protein  36.14 
 
 
435 aa  44.7  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000125854  normal  0.0319641 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2892  polysaccharide biosynthesis protein  24.89 
 
 
429 aa  44.7  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2455  polysaccharide biosynthesis protein  25.29 
 
 
434 aa  44.3  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2504  polysaccharide biosynthesis protein  27.27 
 
 
486 aa  44.3  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0727  polysaccharide biosynthesis protein  28.43 
 
 
478 aa  44.3  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.207142  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1009  polysaccharide biosynthesis protein  29.84 
 
 
536 aa  43.9  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4418  polysaccharide biosynthesis protein  28.11 
 
 
438 aa  43.9  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>