12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0639 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_0639  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
458 aa  917    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.216711  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1020  polysaccharide biosynthesis protein  24.86 
 
 
490 aa  67  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3018  polysaccharide biosynthesis protein  23.94 
 
 
468 aa  59.7  0.00000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1796  polysaccharide biosynthesis protein  24.73 
 
 
453 aa  53.1  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2520  polysaccharide biosynthesis protein  20.42 
 
 
474 aa  50.4  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.889784 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1836  polysaccharide biosynthesis protein  37.88 
 
 
446 aa  50.1  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2073  polysaccharide biosynthesis protein  24.65 
 
 
492 aa  49.7  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2996  polysaccharide biosynthesis protein  23.16 
 
 
459 aa  48.9  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.143417 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3797  polysaccharide biosynthesis protein  20.88 
 
 
461 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.683173  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1211  polysaccharide biosynthesis protein  23.81 
 
 
489 aa  47.4  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3983  polysaccharide biosynthesis associated protein  26.02 
 
 
467 aa  46.2  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  27.21 
 
 
444 aa  45.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>