104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2910 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2910  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 485 aa  952    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3041  polysaccharide biosynthesis protein  37.76 
 
 		 471 aa  352  7e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1353  polysaccharide biosynthesis protein  36.4 
 
 		 486 aa  346  7e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1057  PST family polysaccharide transporter  36.04 
 
 		 471 aa  286  5e-76  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.140128  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1371  polysaccharide biosynthesis protein  34.8 
 
 		 472 aa  280  5e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1142  PST family polysaccharide transporter  33.48 
 
 		 475 aa  278  1e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000134656  hitchhiker  0.0000175319 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5060  polysaccharide biosynthesis protein  36.9 
 
 		 478 aa  265  1e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1407  PST family polysaccharide transporter  32.46 
 
 		 481 aa  258  2e-67  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1496  PST family polysaccharide transporter  31.33 
 
 		 484 aa  246  6e-64  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.104259  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0220  PST family polysaccharide transporter  34.68 
 
 		 472 aa  242  9e-63  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1412  polysaccharide biosynthesis protein  33.69 
 
 		 474 aa  241  2e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0573  polysaccharide biosynthesis protein  30.04 
 
 		 477 aa  235  2.0000000000000002e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000747167  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0118  polysaccharide biosynthesis protein  28.36 
 
 		 476 aa  201  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0224366  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0123  polysaccharide biosynthesis protein  28.36 
 
 		 476 aa  201  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.281108  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1522  PST family polysaccharide transporter  28.04 
 
 		 478 aa  190  5.999999999999999e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00741299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0604  polysaccharide biosynthesis protein  24.57 
 
 		 483 aa  137  6.0000000000000005e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000572815  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0464  polysaccharide transporter protein, putative  23.77 
 
 		 486 aa  136  7.000000000000001e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000125112  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5560  polysaccharide biosynthesis protein, putative  23.88 
 
 		 484 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5222  polysaccharide biosynthesis protein  23.62 
 
 		 484 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0028  polysaccharide biosynthesis protein  22.87 
 
 		 484 aa  117  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5279  polysaccharide biosynthesis protein  21.81 
 
 		 484 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0394078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5123  spore cortex biosynthesis protein  21.81 
 
 		 484 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151446  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5676  polysaccharide biosynthesis protein  21.81 
 
 		 484 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5522  polysaccharide synthase family protein  21.81 
 
 		 484 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6400  polysaccharide biosynthesis protein  25.31 
 
 		 431 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.247838 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0590  polysaccharide biosynthesis protein, putative  21.18 
 
 		 483 aa  110  5e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000415804  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2025  polysaccharide biosynthesis protein  26.7 
 
 		 424 aa  108  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.997214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2041  polysaccharide biosynthesis protein  23.12 
 
 		 415 aa  104  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0334353  normal  0.0804458 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1929  polysaccharide biosynthesis protein  25.38 
 
 		 424 aa  104  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.109004  normal  0.370568 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6018  polysaccharide biosynthesis protein  27.25 
 
 		 433 aa  104  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.203106 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3697  polysaccharide biosynthesis protein  25.74 
 
 		 443 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0520  polysaccharide biosynthesis family protein  26.67 
 
 		 422 aa  100  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.203953  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4403  polysaccharide biosynthesis protein  24.69 
 
 		 417 aa  99  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.279052  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0027  polysaccharide biosynthesis family protein  26.42 
 
 		 422 aa  98.2  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342295  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0806  polysaccharide biosynthesis family protein  26.42 
 
 		 422 aa  98.2  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2875  polysaccharide transporter  26.42 
 
 		 422 aa  98.2  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2209  polysaccharide transporter  26.42 
 
 		 422 aa  98.2  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0627  polysaccharide biosynthesis family protein  26.42 
 
 		 422 aa  98.2  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0642  polysaccharide transporter  26.42 
 
 		 422 aa  98.2  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.21935  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2497  polysaccharide transporter  26.42 
 
 		 422 aa  98.2  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.547808  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2745  polysaccharide biosynthesis protein  28.33 
 
 		 412 aa  94.7  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4360  polysaccharide biosynthesis protein  25.44 
 
 		 429 aa  94.4  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.86188 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1104  polysaccharide biosynthesis protein  25.38 
 
 		 429 aa  94  6e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4166  polysaccharide biosynthesis protein  25.3 
 
 		 417 aa  92.8  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507145  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4200  polysaccharide biosynthesis protein  25.3 
 
 		 417 aa  92.8  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.404926 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3316  polysaccharide biosynthesis protein  25.3 
 
 		 417 aa  92.8  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0788043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3618  polysaccharide biosynthesis protein  24.81 
 
 		 419 aa  91.7  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.180964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4093  polysaccharide biosynthesis protein  24.55 
 
 		 419 aa  89.4  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1197  Wzx  23.5 
 
 		 405 aa  85.9  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.905565  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2253  lipopolysaccharide (O-antigen)exporter  26.14 
 
 		 444 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6729  polysaccharide biosynthesis protein  22.87 
 
 		 415 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1405  polysaccharide biosynthesis protein  22.69 
 
 		 418 aa  84.3  0.000000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000283826  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0849  polysaccharide biosynthesis protein  22.53 
 
 		 419 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1820  polysaccharide biosynthesis protein  24.87 
 
 		 418 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.482229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0699  hypothetical protein  22.92 
 
 		 422 aa  76.6  0.0000000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.786722 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1081  polysaccharide biosynthesis protein  24.29 
 
 		 421 aa  75.1  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1620  polysaccharide biosynthesis protein  23.32 
 
 		 415 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0681626  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  25.07 
 
 		 444 aa  72.4  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0582  polysaccharide biosynthesis protein  25.09 
 
 		 406 aa  70.5  0.00000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224366  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1384  polysaccharide biosynthesis protein  23.2 
 
 		 440 aa  69.7  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02920  O-antigen transporter  22.53 
 
 		 416 aa  68.9  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00862586  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0391  polysaccharide biosynthesis protein  21.49 
 
 		 476 aa  67.4  0.0000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  27.01 
 
 		 444 aa  66.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1369  polysaccharide biosynthesis protein  26.1 
 
 		 416 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.52788  normal  0.0165485 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6750  polysaccharide biosynthesis protein  24.23 
 
 		 429 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1120  polysaccharide biosynthesis protein  25.11 
 
 		 478 aa  65.5  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77221  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1675  polysaccharide biosynthesis protein  24.43 
 
 		 430 aa  62  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0104334  normal  0.413628 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2285  polysaccharide biosynthesis protein  22.98 
 
 		 449 aa  62  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.398242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1959  polysaccharide biosynthesis protein  23.14 
 
 		 451 aa  60.5  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3729  polysaccharide biosynthesis protein  23.44 
 
 		 438 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0553833 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  24.95 
 
 		 488 aa  57.8  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2419  polysaccharide biosynthesis protein  27.78 
 
 		 431 aa  57  0.0000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0814087  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2854  polysaccharide biosynthesis protein  23.55 
 
 		 423 aa  54.7  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.444695  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2535  polysaccharide biosynthesis protein  22.92 
 
 		 409 aa  52.8  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0457  polysaccharide biosynthesis protein  24.81 
 
 		 488 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3458  polysaccharide biosynthesis protein  27.81 
 
 		 427 aa  53.1  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  27.03 
 
 		 444 aa  53.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3147  polysaccharide biosynthesis protein  18.98 
 
 		 475 aa  51.2  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.875944  normal  0.24442 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2885  polysaccharide biosynthesis protein  22.83 
 
 		 404 aa  50.8  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.285914  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2062  polysaccharide biosynthesis protein  20.92 
 
 		 511 aa  49.3  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.445911  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0629  lipopolysaccharide/O-antigen transporter, putative  23.04 
 
 		 467 aa  48.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1033  polysaccharide biosynthesis protein  19.8 
 
 		 412 aa  48.5  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0437322  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0172  polysaccharide efflux transporter, putative  25.11 
 
 		 495 aa  47.8  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.377433 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0744  polysaccharide biosynthesis protein  22.48 
 
 		 436 aa  48.1  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.923042  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2602  polysaccharide biosynthesis protein  23.41 
 
 		 448 aa  47.4  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1606  polysaccharide biosynthesis protein  20.6 
 
 		 412 aa  47  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0714758  normal  0.23948 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2014  integral membrane protein MviN  27.06 
 
 		 525 aa  46.2  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00478097 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2652  polysaccharide biosynthesis protein  29.88 
 
 		 426 aa  46.6  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0561066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1020  polysaccharide biosynthesis protein  31.71 
 
 		 490 aa  45.8  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1796  polysaccharide biosynthesis protein  23.67 
 
 		 453 aa  45.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  25 
 
 		 511 aa  45.8  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  25 
 
 		 511 aa  45.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1112  O-antigen translocase  24.39 
 
 		 507 aa  44.7  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0719133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0929  polysaccharide biosynthesis protein  24.52 
 
 		 489 aa  44.7  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1236  polysaccharide biosynthesis protein  22.98 
 
 		 482 aa  44.3  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286439 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2913  polysaccharide biosynthesis protein  28.4 
 
 		 458 aa  43.9  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.953336 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2529  integral membrane protein MviN  27.63 
 
 		 537 aa  43.9  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12370  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  26.9 
 
 		 424 aa  43.9  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1766  polysaccharide biosynthesis protein  30.51 
 
 		 441 aa  43.5  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0796  polysaccharide biosynthesis protein  22.49 
 
 		 482 aa  43.5  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.733222  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>