135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0259 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0259  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 498 aa  967    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1862  polysaccharide efflux transporter, putative  58.38 
 
 		 496 aa  517  1.0000000000000001e-145  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0172  polysaccharide efflux transporter, putative  59.14 
 
 		 495 aa  478  1e-133  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.377433 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2438  polysaccharide biosynthesis protein  50.81 
 
 		 495 aa  462  1e-129  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2073  polysaccharide biosynthesis protein  47.55 
 
 		 492 aa  393  1e-108  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2278  polysaccharide biosynthesis protein  45.49 
 
 		 516 aa  366  1e-100  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2304  polysaccharide biosynthesis protein  45.45 
 
 		 494 aa  368  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.298994  normal  0.0362143 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  27.8 
 
 		 512 aa  166  8e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  24.54 
 
 		 499 aa  134  5e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1211  polysaccharide biosynthesis protein  26.06 
 
 		 489 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1767  polysaccharide biosynthesis protein  26.24 
 
 		 447 aa  131  3e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0935149 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  25.68 
 
 		 517 aa  128  3e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2684  polysaccharide biosynthesis protein  25.63 
 
 		 539 aa  125  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2188  polysaccharide biosynthesis protein  26.57 
 
 		 495 aa  118  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1836  polysaccharide biosynthesis protein  28.03 
 
 		 446 aa  99.8  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0777  polysaccharide biosynthesis protein  28.26 
 
 		 441 aa  97.8  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4091  polysaccharide biosynthesis protein  23.57 
 
 		 430 aa  93.2  9e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1796  polysaccharide biosynthesis protein  27.97 
 
 		 453 aa  90.9  5e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3797  polysaccharide biosynthesis protein  25.8 
 
 		 461 aa  87.8  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.683173  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2457  polysaccharide biosynthesis protein  22.16 
 
 		 514 aa  81.3  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.267844  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001317  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsJ Membrane protein export of O-antigen and teichoic acid  23.08 
 
 		 435 aa  80.1  0.00000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.872862  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2139  polysaccharide biosynthesis protein  22.62 
 
 		 482 aa  76.6  0.0000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00876576  normal  0.418146 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0945  multi antimicrobial extrusion protein MatE  27.23 
 
 		 495 aa  73.9  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.903745  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2006  polysaccharide biosynthesis protein  28.44 
 
 		 529 aa  73.6  0.000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.300214  normal  0.433718 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1685  polysaccharide biosynthesis protein  27.16 
 
 		 441 aa  72  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.929392  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0040  polysaccharide biosynthesis protein  23.76 
 
 		 435 aa  71.2  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000125854  normal  0.0319641 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2481  polysaccharide biosynthesis protein  26.95 
 
 		 477 aa  70.1  0.00000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206749  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8594  polysaccharide biosynthesis protein  26.61 
 
 		 434 aa  67.4  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1020  polysaccharide biosynthesis protein  28.1 
 
 		 490 aa  66.6  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2996  polysaccharide biosynthesis protein  25.5 
 
 		 459 aa  66.6  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143417 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1128  polysaccharide biosynthesis protein  24.57 
 
 		 547 aa  62.8  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3272  polysaccharide biosynthesis protein  25.13 
 
 		 546 aa  61.6  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.509561  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1391  polysaccharide biosynthesis protein  25.58 
 
 		 456 aa  61.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0508  polysaccharide biosynthesis protein  24.26 
 
 		 505 aa  61.2  0.00000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3018  polysaccharide biosynthesis protein  24.94 
 
 		 468 aa  60.8  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3553  polysaccharide biosynthesis protein  23.46 
 
 		 458 aa  60.5  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0573  polysaccharide biosynthesis protein  22.53 
 
 		 477 aa  60.5  0.00000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000747167  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2754  polysaccharide biosynthesis protein  24.3 
 
 		 460 aa  60.1  0.00000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.316209  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1074  polysaccharide biosynthesis protein  23.64 
 
 		 476 aa  59.3  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0510405  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  24.8 
 
 		 490 aa  59.3  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0310  polysaccharide biosynthesis protein  22.72 
 
 		 421 aa  59.3  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08851  hypothetical protein  22.7 
 
 		 484 aa  59.3  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.227884  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05198  hypothetical protein  23.08 
 
 		 435 aa  58.5  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0234  lipopolysaccharide O-side chain biosynthesis protein (O-antigen transpoter)  23.88 
 
 		 476 aa  58.2  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00421263  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1920  polysaccharide biosynthesis protein  25.93 
 
 		 484 aa  57.8  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0707623  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3983  polysaccharide biosynthesis associated protein  29.44 
 
 		 467 aa  58.2  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1353  polysaccharide biosynthesis protein  21.12 
 
 		 486 aa  57.8  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3832  polysaccharide biosynthesis protein  24.87 
 
 		 471 aa  57.4  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.431872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1071  polysaccharide biosynthesis protein  25.42 
 
 		 489 aa  57  0.0000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  25.19 
 
 		 490 aa  57.4  0.0000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0929  polysaccharide biosynthesis protein  24.74 
 
 		 489 aa  57  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0177  polysaccharide biosynthesis protein  22.62 
 
 		 446 aa  57  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6968  PST family polysaccharide export protein  26.92 
 
 		 458 aa  57  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.756164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1759  polysaccharide biosynthesis protein  19.35 
 
 		 423 aa  57  0.0000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4001  polysaccharide biosynthesis protein  25.23 
 
 		 455 aa  56.6  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.443077 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1009  polysaccharide biosynthesis protein  30.24 
 
 		 536 aa  56.2  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2504  polysaccharide biosynthesis protein  26.13 
 
 		 486 aa  54.7  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0621  polysaccharide biosynthesis protein  25.11 
 
 		 475 aa  55.1  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.914686  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  20.85 
 
 		 477 aa  54.7  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0704  polysaccharide biosynthesis protein  20.46 
 
 		 423 aa  54.3  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.786824  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3041  polysaccharide biosynthesis protein  21.16 
 
 		 471 aa  54.7  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2015  polysaccharide biosynthesis protein  27.27 
 
 		 466 aa  53.9  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.42395 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  22.11 
 
 		 483 aa  53.9  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0098  O-antigen and teichoic acid-like export protein  26.15 
 
 		 507 aa  53.1  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2783  polysaccharide biosynthesis protein  24.41 
 
 		 494 aa  53.1  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0727  polysaccharide biosynthesis protein  23.23 
 
 		 478 aa  53.1  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.207142  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3541  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 474 aa  53.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3790  polysaccharide biosynthesis protein  29.33 
 
 		 1103 aa  53.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.500629 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1637  polysaccharide biosynthesis protein  22.93 
 
 		 504 aa  52.4  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0890  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 407 aa  52.8  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362175  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0416  polysaccharide biosynthesis protein  24.88 
 
 		 506 aa  51.6  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.484223  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0144  polysaccharide biosynthesis protein  18.18 
 
 		 423 aa  51.6  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.232636  normal  0.0172475 
 
 
-
 
NC_002950  PG0133  hypothetical protein  21.58 
 
 		 501 aa  51.2  0.00004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0569803 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21180  polysaccharide biosynthesis protein  21.1 
 
 		 539 aa  51.2  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.275763  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0987  polysaccharide biosynthesis protein  30.22 
 
 		 458 aa  50.8  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.676741 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1772  polysaccharide biosynthesis protein  25.96 
 
 		 496 aa  50.4  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  24.87 
 
 		 444 aa  50.4  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2873  O-antigen and teichoic acid-like export protein  24.87 
 
 		 508 aa  50.4  0.00008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.793444  normal  0.427284 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0785  polysaccharide biosynthesis protein  20.63 
 
 		 506 aa  49.3  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1411  polysaccharide biosynthesis protein  23.72 
 
 		 456 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  22.54 
 
 		 444 aa  49.3  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1240  polysaccharide biosynthesis protein  28.86 
 
 		 493 aa  49.3  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.554345  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1812  polysaccharide biosynthesis protein  26.57 
 
 		 482 aa  49.3  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0361  polysaccharide biosynthesis protein  20.78 
 
 		 482 aa  48.5  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4119  polysaccharide biosynthesis protein  32.24 
 
 		 1103 aa  49.3  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0897  MATE efflux family protein  25 
 
 		 453 aa  48.5  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000262958  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2910  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 485 aa  48.1  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0506  polysaccharide biosynthesis protein  30.81 
 
 		 583 aa  48.5  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2602  polysaccharide biosynthesis protein  28.24 
 
 		 448 aa  48.1  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1120  polysaccharide biosynthesis protein  24.05 
 
 		 478 aa  47.8  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77221  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2520  polysaccharide biosynthesis protein  29.78 
 
 		 474 aa  47.4  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.889784 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0598  stage V sporulation protein B  21.46 
 
 		 513 aa  47.4  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1307  polysaccharide biosynthesis protein  20.67 
 
 		 483 aa  47.8  0.0005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1107  putative membrane protein involved in export of O-antigen  26.23 
 
 		 450 aa  47.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.361388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0582  polysaccharide biosynthesis protein  20.62 
 
 		 479 aa  47.4  0.0006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0782  polysaccharide biosynthesis protein  21.32 
 
 		 519 aa  47.4  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5327  polysaccharide biosynthesis protein  31.82 
 
 		 445 aa  47.4  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0472551  normal  0.0858273 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4156  polysaccharide biosynthesis protein  34.41 
 
 		 416 aa  47  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1933  polysaccharide biosynthesis protein  37.08 
 
 		 135 aa  47  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.546859 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0344  polysaccharide biosynthesis protein  28.36 
 
 		 430 aa  47  0.0008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0233913 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>