11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2873 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2873  O-antigen and teichoic acid-like export protein  100 
 
 		 508 aa  992    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.793444  normal  0.427284 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0449  polysaccharide biosynthesis protein  60.08 
 
 		 502 aa  538  1e-151  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.757285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2783  polysaccharide biosynthesis protein  54.6 
 
 		 494 aa  480  1e-134  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0098  O-antigen and teichoic acid-like export protein  28.72 
 
 		 507 aa  108  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  21.55 
 
 		 499 aa  72.8  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2438  polysaccharide biosynthesis protein  23.93 
 
 		 495 aa  62.8  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2188  polysaccharide biosynthesis protein  28.12 
 
 		 495 aa  53.5  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0259  polysaccharide biosynthesis protein  23.71 
 
 		 498 aa  52  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3983  polysaccharide biosynthesis associated protein  25.34 
 
 		 467 aa  46.2  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0172  polysaccharide efflux transporter, putative  23.76 
 
 		 495 aa  45.8  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.377433 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3541  polysaccharide biosynthesis protein  24.15 
 
 		 474 aa  43.5  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>