58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0310 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0310  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 421 aa  823    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0643  polysaccharide biosynthesis protein  35.5 
 
 		 425 aa  223  4.9999999999999996e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.120868 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  22.01 
 
 		 512 aa  76.3  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  23.4 
 
 		 477 aa  72.4  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1963  colanic acid exporter  25.36 
 
 		 493 aa  65.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2139  polysaccharide biosynthesis protein  23.2 
 
 		 482 aa  63.2  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00876576  normal  0.418146 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0040  polysaccharide biosynthesis protein  28.96 
 
 		 435 aa  62.8  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000125854  normal  0.0319641 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0177  polysaccharide biosynthesis protein  22.71 
 
 		 446 aa  60.8  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89066  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  26.9 
 
 		 444 aa  59.7  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2012  polysaccharide biosynthesis protein  24.25 
 
 		 483 aa  59.7  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.715057 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  24.83 
 
 		 444 aa  59.3  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0361  polysaccharide biosynthesis protein  29.89 
 
 		 482 aa  58.9  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0155  ATPase  22.46 
 
 		 483 aa  58.2  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  26.2 
 
 		 483 aa  57.4  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  26.5 
 
 		 423 aa  56.2  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0032  polysaccharide biosynthesis protein  25.82 
 
 		 487 aa  55.1  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.166793 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1211  polysaccharide biosynthesis protein  22.11 
 
 		 489 aa  54.7  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1044  polysaccharide biosynthesis protein  29.33 
 
 		 440 aa  54.7  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.041441  hitchhiker  0.00655602 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  24.59 
 
 		 444 aa  53.5  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  23.73 
 
 		 517 aa  53.1  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1965  polysaccharide biosynthesis protein  25.12 
 
 		 463 aa  52.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0295315 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3385  MATE efflux family protein  24 
 
 		 453 aa  51.6  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  26.4 
 
 		 448 aa  51.2  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  21.53 
 
 		 449 aa  51.2  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0588  polysaccharide biosynthesis protein  28.65 
 
 		 410 aa  51.2  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0284636  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0508  polysaccharide biosynthesis protein  26.26 
 
 		 505 aa  50.8  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2181  polysaccharide biosynthesis protein  23.67 
 
 		 482 aa  50.8  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138361 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  23.15 
 
 		 499 aa  50.4  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4040  polysaccharide biosynthesis protein  22.9 
 
 		 444 aa  50.1  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.519664  normal  0.589796 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0577  polysaccharide biosynthesis protein  25.5 
 
 		 500 aa  49.7  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2457  polysaccharide biosynthesis protein  22.35 
 
 		 514 aa  48.9  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.267844  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4091  polysaccharide biosynthesis protein  23.06 
 
 		 430 aa  49.7  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2047  polysaccharide biosynthesis protein  26.01 
 
 		 504 aa  48.5  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.82849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0174  colanic acid exporter  28.57 
 
 		 483 aa  48.5  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  0.572056 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0744  polysaccharide biosynthesis protein  25.78 
 
 		 436 aa  48.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.923042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2971  polysaccharide biosynthesis protein  25.81 
 
 		 475 aa  47  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.224966  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0665  polysaccharide biosynthesis protein  26.71 
 
 		 426 aa  47  0.0007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1426  polysaccharide biosynthesis protein  21.56 
 
 		 455 aa  46.6  0.0009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0839  polysaccharide biosynthesis protein  23.42 
 
 		 423 aa  46.6  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.305723  normal  0.0285529 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1968  polysaccharide biosynthesis protein  22.54 
 
 		 477 aa  46.6  0.0009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.901691  hitchhiker  0.000000136517 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0604  polysaccharide biosynthesis protein  26.67 
 
 		 483 aa  45.8  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000572815  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2983  polysaccharide biosynthesis protein  27.62 
 
 		 427 aa  46.6  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0464  polysaccharide transporter protein, putative  23.19 
 
 		 486 aa  46.2  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000125112  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1735  PST family polysaccharide transporter  23.56 
 
 		 479 aa  45.8  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1361  polysaccharide biosynthesis protein  26.09 
 
 		 413 aa  46.2  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483225  unclonable  0.0000000256808 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0416  polysaccharide biosynthesis protein  22.71 
 
 		 506 aa  46.2  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.484223  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2438  polysaccharide biosynthesis protein  24.43 
 
 		 495 aa  45.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1384  polysaccharide biosynthesis protein  27.4 
 
 		 440 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  24.26 
 
 		 490 aa  44.7  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2620  polysaccharide biosynthesis protein  23.58 
 
 		 503 aa  44.7  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.509429  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0341  polysaccharide biosynthesis protein  23.55 
 
 		 500 aa  45.1  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.467363  decreased coverage  0.0000100108 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4360  polysaccharide biosynthesis protein  22.06 
 
 		 429 aa  44.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.86188 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0945  multi antimicrobial extrusion protein MatE  22.55 
 
 		 495 aa  44.7  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.903745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1796  polysaccharide biosynthesis protein  22.17 
 
 		 453 aa  44.3  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0846  polysaccharide biosynthesis protein  22.73 
 
 		 421 aa  44.3  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  hitchhiker  0.00594876 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2455  polysaccharide biosynthesis protein  23.02 
 
 		 434 aa  43.9  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3876  polysaccharide biosynthesis protein  26.67 
 
 		 427 aa  43.5  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3796  polysaccharide biosynthesis protein  26.03 
 
 		 478 aa  43.1  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>