24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0643 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_0643  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
425 aa  841    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.120868 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0310  polysaccharide biosynthesis protein  34.92 
 
 
421 aa  206  5e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  23.29 
 
 
483 aa  55.5  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1361  polysaccharide biosynthesis protein  21.04 
 
 
413 aa  50.8  0.00005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483225  unclonable  0.0000000256808 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  25.62 
 
 
512 aa  50.1  0.00008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2892  polysaccharide biosynthesis protein  26.09 
 
 
429 aa  49.3  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0588  polysaccharide biosynthesis protein  21.23 
 
 
410 aa  48.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0284636  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0361  polysaccharide biosynthesis protein  25.86 
 
 
482 aa  47.4  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0391  polysaccharide biosynthesis protein  26.47 
 
 
476 aa  47  0.0006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2139  polysaccharide biosynthesis protein  21.78 
 
 
482 aa  46.2  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00876576  normal  0.418146 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2971  polysaccharide biosynthesis protein  24.12 
 
 
475 aa  46.2  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.224966  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  21.05 
 
 
499 aa  45.4  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3272  polysaccharide biosynthesis protein  23.66 
 
 
546 aa  45.1  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.509561  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0172  polysaccharide biosynthesis protein  28.66 
 
 
433 aa  45.8  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.663645  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0929  polysaccharide biosynthesis protein  26.2 
 
 
489 aa  44.3  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  25.13 
 
 
490 aa  44.3  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0727  polysaccharide biosynthesis protein  25.21 
 
 
478 aa  44.7  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.207142  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  31.73 
 
 
517 aa  44.3  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3971  polysaccharide biosynthesis protein  27.33 
 
 
582 aa  44.3  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.137474  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0641  polysaccharide biosynthesis protein, putative  25.3 
 
 
508 aa  43.9  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1128  polysaccharide biosynthesis protein  23.43 
 
 
547 aa  44.3  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1767  polysaccharide biosynthesis protein  23.54 
 
 
447 aa  43.9  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0935149 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3133  polysaccharide biosynthesis protein  27.83 
 
 
507 aa  43.5  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0165717  normal  0.444225 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0040  polysaccharide biosynthesis protein  25.15 
 
 
435 aa  43.1  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000125854  normal  0.0319641 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>