19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3133 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3133  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 507 aa  986    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0165717  normal  0.444225 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0361  polysaccharide biosynthesis protein  21.11 
 
 		 482 aa  102  2e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2969  O-antigen and teichoic acid-like export protein  28.32 
 
 		 449 aa  72  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.369206  normal  0.787883 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2606  hypothetical protein  25.51 
 
 		 524 aa  71.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0166267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0334  polysaccharide biosynthesis protein  25.31 
 
 		 492 aa  63.9  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.296717  normal  0.822596 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  27.83 
 
 		 490 aa  58.9  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4090  membrane protein  25.07 
 
 		 481 aa  52.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4214  polysaccharide biosynthesis protein  25.49 
 
 		 493 aa  50.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0929  polysaccharide biosynthesis protein  26.09 
 
 		 489 aa  50.1  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1371  polysaccharide biosynthesis protein  22.22 
 
 		 472 aa  48.9  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4239  polysaccharide biosynthesis protein  25.21 
 
 		 493 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  24.37 
 
 		 483 aa  47.4  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3604  integral membrane protein MviN  28.28 
 
 		 512 aa  46.6  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.277865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2504  polysaccharide biosynthesis protein  26.12 
 
 		 486 aa  47  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0457  integral membrane protein MviN  26.26 
 
 		 513 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00421085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0643  polysaccharide biosynthesis protein  23.86 
 
 		 425 aa  45.8  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.120868 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1810  putative virulence factor, MviN  26.26 
 
 		 513 aa  44.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1591  polysaccharide biosynthesis protein  23.81 
 
 		 479 aa  44.3  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.267568  normal  0.0585541 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0155  ATPase  23.44 
 
 		 483 aa  43.5  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>