166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0929 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  73.36 
 
 
490 aa  737    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0929  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
489 aa  963    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  47.19 
 
 
483 aa  447  1.0000000000000001e-124  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2504  polysaccharide biosynthesis protein  34.18 
 
 
486 aa  234  4.0000000000000004e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  22.25 
 
 
488 aa  86.7  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2971  polysaccharide biosynthesis protein  25.12 
 
 
475 aa  84  0.000000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.224966  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  24.68 
 
 
490 aa  82.8  0.00000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0174  colanic acid exporter  23.22 
 
 
483 aa  79.3  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  0.572056 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2586  polysaccharide biosynthesis protein  26.9 
 
 
411 aa  77.8  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0177  polysaccharide biosynthesis protein  25.29 
 
 
446 aa  75.9  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89066  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1071  polysaccharide biosynthesis protein  21.69 
 
 
489 aa  73.6  0.000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0172  polysaccharide biosynthesis protein  22.54 
 
 
433 aa  73.2  0.000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.663645  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2137  polysaccharide biosynthesis protein  24.2 
 
 
470 aa  73.2  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  25.06 
 
 
512 aa  72.4  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3064  polysaccharide biosynthesis protein  22.41 
 
 
535 aa  70.9  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000038595  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  23.41 
 
 
517 aa  69.3  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2555  polysaccharide biosynthesis protein  23.18 
 
 
513 aa  64.7  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1836  polysaccharide biosynthesis protein  24.67 
 
 
446 aa  64.7  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1593  polysaccharide biosynthesis protein  23.97 
 
 
504 aa  64.3  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2481  polysaccharide biosynthesis protein  22.66 
 
 
477 aa  64.3  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206749  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1057  PST family polysaccharide transporter  23.1 
 
 
471 aa  63.9  0.000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.140128  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2335  colanic acid exporter  22.22 
 
 
510 aa  63.9  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.673501  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2328  colanic acid exporter  22.22 
 
 
510 aa  63.9  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.663239  normal  0.0902335 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2442  colanic acid exporter  22.22 
 
 
510 aa  63.9  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000846764 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2284  colanic acid exporter  22.22 
 
 
510 aa  63.9  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000490639 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2227  colanic acid exporter  22.22 
 
 
503 aa  63.5  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.125419  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0506  polysaccharide biosynthesis protein  24.74 
 
 
583 aa  63.2  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0869  polysaccharide biosynthesis protein  22.61 
 
 
509 aa  63.2  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1608  polysaccharide biosynthesis protein  23.13 
 
 
492 aa  62.8  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1016  colanic acid exporter  22.97 
 
 
492 aa  62  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.6233  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2980  colanic acid exporter  22.97 
 
 
492 aa  61.6  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.638348  hitchhiker  0.000245488 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0172  polysaccharide efflux transporter, putative  23.24 
 
 
495 aa  61.6  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.377433 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0604  polysaccharide biosynthesis protein  21.79 
 
 
483 aa  61.6  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000572815  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2338  colanic acid exporter  23.39 
 
 
492 aa  61.6  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1595  colanic acid exporter  22.97 
 
 
492 aa  61.6  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.14866  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1611  polysaccharide biosynthesis protein  23.39 
 
 
492 aa  61.2  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000161996  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0220  PST family polysaccharide transporter  25.38 
 
 
472 aa  61.2  0.00000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1186  colanic acid exporter  22.97 
 
 
492 aa  61.2  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2756  polysaccharide biosynthesis protein  23.13 
 
 
476 aa  60.8  0.00000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.1976  normal  0.927782 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1495  polysaccharide biosynthesis protein  24.71 
 
 
503 aa  60.8  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.994963  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3041  polysaccharide biosynthesis protein  22.75 
 
 
471 aa  59.3  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0573  polysaccharide biosynthesis protein  21.46 
 
 
477 aa  59.7  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000747167  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01952  colanic acid exporter  22.7 
 
 
492 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0109189  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01941  hypothetical protein  22.7 
 
 
492 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0074842  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1525  polysaccharide biosynthesis protein  25.51 
 
 
475 aa  58.9  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2455  polysaccharide biosynthesis protein  23.59 
 
 
434 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4201  polysaccharide biosynthesis protein  20.68 
 
 
487 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0464  polysaccharide transporter protein, putative  22.76 
 
 
486 aa  58.9  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000125112  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0457  polysaccharide biosynthesis protein  22.73 
 
 
488 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1965  polysaccharide biosynthesis protein  24.09 
 
 
463 aa  58.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0295315 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2660  colanic acid exporter  22.43 
 
 
492 aa  58.5  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.267405  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2073  polysaccharide biosynthesis protein  23.83 
 
 
492 aa  58.5  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0673  polysaccharide biosynthesis protein  25.87 
 
 
541 aa  58.2  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2972  polysaccharide biosynthesis protein  24.69 
 
 
480 aa  57.8  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0344  polysaccharide biosynthesis protein  28.42 
 
 
430 aa  57.8  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0233913 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5251  polysaccharide biosynthesis protein  23.77 
 
 
490 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.179793 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0890  polysaccharide biosynthesis protein  26.18 
 
 
407 aa  57.8  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362175  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2438  polysaccharide biosynthesis protein  24.32 
 
 
495 aa  57.4  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0361  polysaccharide biosynthesis protein  22.72 
 
 
482 aa  57.4  0.0000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2892  polysaccharide biosynthesis protein  22.17 
 
 
429 aa  57  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3272  polysaccharide biosynthesis protein  22.53 
 
 
546 aa  56.6  0.0000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.509561  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6501  Membrane protein involved in the export of O- antigen and teichoic acid-like protein  29.76 
 
 
448 aa  56.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0796  polysaccharide biosynthesis protein  22.83 
 
 
482 aa  56.6  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.733222  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2104  stage V sporulation protein B  23.91 
 
 
529 aa  56.2  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.624718  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  20 
 
 
423 aa  55.8  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1371  polysaccharide biosynthesis protein  27.57 
 
 
472 aa  55.8  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1796  polysaccharide biosynthesis protein  19.83 
 
 
453 aa  55.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21180  polysaccharide biosynthesis protein  26.92 
 
 
539 aa  55.8  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.275763  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2039  polysaccharide synthase family protein  22.87 
 
 
459 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2184  putative polysaccharide biosynthesis protein  24.84 
 
 
476 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000339542  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1538  polysaccharide biosynthesis protein  23.97 
 
 
459 aa  54.3  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0542726  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2457  polysaccharide biosynthesis protein  23.7 
 
 
514 aa  53.9  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.267844  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2996  polysaccharide biosynthesis protein  24.08 
 
 
459 aa  53.9  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.143417 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1120  polysaccharide biosynthesis protein  26.3 
 
 
478 aa  53.9  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77221  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1078  polysaccharide biosynthesis protein  26.6 
 
 
424 aa  53.5  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1959  polysaccharide biosynthesis protein  24.35 
 
 
451 aa  53.5  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1211  polysaccharide biosynthesis protein  22.96 
 
 
489 aa  53.5  0.000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2760  polysaccharide biosynthesis protein  24.04 
 
 
542 aa  53.5  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.874111  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1128  polysaccharide biosynthesis protein  22.65 
 
 
547 aa  53.5  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1922  polysaccharide biosynthesis family protein  23.12 
 
 
544 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3270  polysaccharide synthase family protein  22.87 
 
 
459 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1902  polysaccharide biosynthesis family protein  21.74 
 
 
459 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0218585  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1865  export protein for polysaccharides and teichoic acids  21.74 
 
 
459 aa  52.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00212516  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0945  multi antimicrobial extrusion protein MatE  24.88 
 
 
495 aa  53.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.903745  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2049  polysaccharide biosynthesis family protein  21.74 
 
 
459 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.686608  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0727  polysaccharide biosynthesis protein  23.2 
 
 
478 aa  53.1  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.207142  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4228  polysaccharide biosynthesis protein  22.5 
 
 
486 aa  53.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8492  polysaccharide biosynthesis protein  25.94 
 
 
533 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.941649 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0391  polysaccharide biosynthesis protein  24.22 
 
 
476 aa  52.8  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1069  polysaccharide biosynthesis protein  24.87 
 
 
488 aa  52  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0264507  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1681  polysaccharide biosynthesis family protein  23.12 
 
 
544 aa  52.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.960771  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1855  export protein for polysaccharides and teichoic acids  21.74 
 
 
459 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.383858  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2139  polysaccharide biosynthesis protein  20.92 
 
 
482 aa  52.4  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00876576  normal  0.418146 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1490  polysaccharide biosynthesis protein  22.56 
 
 
479 aa  52.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3216  polysaccharide biosynthesis protein  27.57 
 
 
500 aa  52.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2081  polysaccharide synthase family protein  21.5 
 
 
459 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2150  polysaccharide synthase family protein  21.84 
 
 
459 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.230641  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  25.26 
 
 
449 aa  52  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1694  polysaccharide biosynthesis protein  24.02 
 
 
544 aa  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.196134  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2118  polysaccharide biosynthesis family protein  21.5 
 
 
459 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101519  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>