47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05198 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05198  hypothetical protein  100 
 
 		 435 aa  853    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001317  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsJ Membrane protein export of O-antigen and teichoic acid  64.6 
 
 		 435 aa  567  1e-160  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.872862  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1685  polysaccharide biosynthesis protein  46.33 
 
 		 441 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.929392  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1767  polysaccharide biosynthesis protein  27.51 
 
 		 447 aa  133  6e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0935149 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0777  polysaccharide biosynthesis protein  30.57 
 
 		 441 aa  127  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3797  polysaccharide biosynthesis protein  27.05 
 
 		 461 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.683173  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  32.94 
 
 		 499 aa  102  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0890  polysaccharide biosynthesis protein  35.23 
 
 		 407 aa  87.8  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362175  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1862  polysaccharide efflux transporter, putative  27.12 
 
 		 496 aa  86.7  8e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2304  polysaccharide biosynthesis protein  23.82 
 
 		 494 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.298994  normal  0.0362143 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0172  polysaccharide efflux transporter, putative  24.75 
 
 		 495 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.377433 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1836  polysaccharide biosynthesis protein  33.15 
 
 		 446 aa  84  0.000000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1933  polysaccharide biosynthesis protein  46.46 
 
 		 135 aa  84  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.546859 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2438  polysaccharide biosynthesis protein  23.89 
 
 		 495 aa  84  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2073  polysaccharide biosynthesis protein  24.35 
 
 		 492 aa  82.4  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4091  polysaccharide biosynthesis protein  26.57 
 
 		 430 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1796  polysaccharide biosynthesis protein  29.27 
 
 		 453 aa  82  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2996  polysaccharide biosynthesis protein  24.68 
 
 		 459 aa  70.9  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143417 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1961  polysaccharide biosynthesis protein  34.01 
 
 		 431 aa  70.5  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0629938 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1942  polysaccharide biosynthesis protein  30.8 
 
 		 464 aa  69.3  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.634447  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1211  polysaccharide biosynthesis protein  25.89 
 
 		 489 aa  68.6  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2006  polysaccharide biosynthesis protein  26.8 
 
 		 529 aa  66.2  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.300214  normal  0.433718 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0561  polysaccharide biosynthesis protein  30.94 
 
 		 456 aa  65.9  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2684  polysaccharide biosynthesis protein  24.61 
 
 		 539 aa  61.6  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3983  polysaccharide biosynthesis associated protein  23.34 
 
 		 467 aa  58.9  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0259  polysaccharide biosynthesis protein  23.08 
 
 		 498 aa  57.8  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1513  polysaccharide biosynthesis protein  35.51 
 
 		 421 aa  57.4  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3720  polysaccharide biosynthesis protein  29.66 
 
 		 470 aa  56.6  0.0000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.293935  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2754  polysaccharide biosynthesis protein  24.42 
 
 		 460 aa  56.6  0.0000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.316209  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2520  polysaccharide biosynthesis protein  22.22 
 
 		 474 aa  56.2  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.889784 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3018  polysaccharide biosynthesis protein  21.01 
 
 		 468 aa  53.9  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2139  polysaccharide biosynthesis protein  21.9 
 
 		 482 aa  53.5  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00876576  normal  0.418146 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  24.44 
 
 		 512 aa  52.4  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  23.08 
 
 		 517 aa  51.2  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3553  polysaccharide biosynthesis protein  20.42 
 
 		 458 aa  50.8  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  27.17 
 
 		 423 aa  51.2  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2188  polysaccharide biosynthesis protein  26.45 
 
 		 495 aa  50.1  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6968  PST family polysaccharide export protein  25.73 
 
 		 458 aa  48.5  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.756164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1391  polysaccharide biosynthesis protein  23.39 
 
 		 456 aa  47.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6268  polysaccharide biosynthesis protein  24.02 
 
 		 454 aa  47  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.455573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2971  polysaccharide biosynthesis protein  22.77 
 
 		 475 aa  45.8  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.224966  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1522  PST family polysaccharide transporter  27.04 
 
 		 478 aa  45.1  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00741299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1827  hypothetical protein  24.01 
 
 		 522 aa  44.3  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.356009  normal  0.0154869 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3541  polysaccharide biosynthesis protein  21.09 
 
 		 474 aa  43.9  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3832  polysaccharide biosynthesis protein  21.33 
 
 		 471 aa  44.3  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.431872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  25.13 
 
 		 449 aa  43.5  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0827  polysaccharide biosynthesis protein  23.08 
 
 		 522 aa  43.1  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.769454  normal  0.213046 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>