33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6268 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6268  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 454 aa  892    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.455573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1767  polysaccharide biosynthesis protein  27.21 
 
 		 447 aa  145  1e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0935149 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0777  polysaccharide biosynthesis protein  27.85 
 
 		 441 aa  137  4e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1796  polysaccharide biosynthesis protein  26.92 
 
 		 453 aa  106  7e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  21.34 
 
 		 499 aa  77  0.0000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1836  polysaccharide biosynthesis protein  30.81 
 
 		 446 aa  75.1  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1685  polysaccharide biosynthesis protein  25.3 
 
 		 441 aa  72  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.929392  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0890  polysaccharide biosynthesis protein  30.85 
 
 		 407 aa  70.5  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362175  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2684  polysaccharide biosynthesis protein  21.85 
 
 		 539 aa  68.9  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3797  polysaccharide biosynthesis protein  23.93 
 
 		 461 aa  67  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.683173  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3018  polysaccharide biosynthesis protein  24.42 
 
 		 468 aa  65.5  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001317  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsJ Membrane protein export of O-antigen and teichoic acid  29.19 
 
 		 435 aa  62.8  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.872862  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3720  polysaccharide biosynthesis protein  26.04 
 
 		 470 aa  59.7  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.293935  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05198  hypothetical protein  28.08 
 
 		 435 aa  58.9  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1933  polysaccharide biosynthesis protein  33.88 
 
 		 135 aa  57.8  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.546859 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3832  polysaccharide biosynthesis protein  29 
 
 		 471 aa  57.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.431872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2996  polysaccharide biosynthesis protein  24.49 
 
 		 459 aa  56.2  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143417 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3541  polysaccharide biosynthesis protein  31.19 
 
 		 474 aa  55.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1020  polysaccharide biosynthesis protein  27.13 
 
 		 490 aa  54.7  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1961  polysaccharide biosynthesis protein  25.67 
 
 		 431 aa  53.5  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0629938 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2438  polysaccharide biosynthesis protein  24.46 
 
 		 495 aa  52.8  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4091  polysaccharide biosynthesis protein  18.38 
 
 		 430 aa  52  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3983  polysaccharide biosynthesis associated protein  29.76 
 
 		 467 aa  50.8  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2139  polysaccharide biosynthesis protein  24.04 
 
 		 482 aa  49.3  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00876576  normal  0.418146 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2073  polysaccharide biosynthesis protein  25.6 
 
 		 492 aa  49.7  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2304  polysaccharide biosynthesis protein  27.53 
 
 		 494 aa  48.9  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.298994  normal  0.0362143 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1384  polysaccharide biosynthesis protein  24.18 
 
 		 440 aa  48.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0172  polysaccharide efflux transporter, putative  24.32 
 
 		 495 aa  47.8  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.377433 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  25.35 
 
 		 517 aa  47.8  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4685  polysaccharide biosynthesis protein  28.84 
 
 		 453 aa  47.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  22.97 
 
 		 512 aa  47.4  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1211  polysaccharide biosynthesis protein  25.58 
 
 		 489 aa  45.8  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1391  polysaccharide biosynthesis protein  26.44 
 
 		 456 aa  44.3  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>