37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3720 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3720  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 470 aa  889    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.293935  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1961  polysaccharide biosynthesis protein  41.05 
 
 		 431 aa  220  3e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0629938 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1767  polysaccharide biosynthesis protein  28.29 
 
 		 447 aa  109  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0935149 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  22.37 
 
 		 499 aa  90.5  6e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0777  polysaccharide biosynthesis protein  26.16 
 
 		 441 aa  88.6  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1836  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 446 aa  84.3  0.000000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1796  polysaccharide biosynthesis protein  24.6 
 
 		 453 aa  84  0.000000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1685  polysaccharide biosynthesis protein  26.65 
 
 		 441 aa  80.9  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.929392  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3018  polysaccharide biosynthesis protein  25.74 
 
 		 468 aa  65.5  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05198  hypothetical protein  27.67 
 
 		 435 aa  64.7  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  26.05 
 
 		 512 aa  62.4  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2996  polysaccharide biosynthesis protein  25.99 
 
 		 459 aa  62  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143417 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4091  polysaccharide biosynthesis protein  20.16 
 
 		 430 aa  61.2  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1942  polysaccharide biosynthesis protein  32.77 
 
 		 464 aa  61.2  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.634447  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2754  polysaccharide biosynthesis protein  21.96 
 
 		 460 aa  58.5  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.316209  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2139  polysaccharide biosynthesis protein  23.66 
 
 		 482 aa  57  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00876576  normal  0.418146 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001317  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsJ Membrane protein export of O-antigen and teichoic acid  28.57 
 
 		 435 aa  56.6  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.872862  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3553  polysaccharide biosynthesis protein  22.2 
 
 		 458 aa  54.3  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2304  polysaccharide biosynthesis protein  29.86 
 
 		 494 aa  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.298994  normal  0.0362143 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6268  polysaccharide biosynthesis protein  25.33 
 
 		 454 aa  51.6  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.455573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1211  polysaccharide biosynthesis protein  25.53 
 
 		 489 aa  51.6  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1020  polysaccharide biosynthesis protein  27.6 
 
 		 490 aa  50.8  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2073  polysaccharide biosynthesis protein  27.83 
 
 		 492 aa  48.9  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8594  polysaccharide biosynthesis protein  30.1 
 
 		 434 aa  48.5  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4418  polysaccharide biosynthesis protein  28.36 
 
 		 438 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4001  polysaccharide biosynthesis protein  22.74 
 
 		 455 aa  47.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.443077 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0945  multi antimicrobial extrusion protein MatE  25.24 
 
 		 495 aa  47  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.903745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2438  polysaccharide biosynthesis protein  26.5 
 
 		 495 aa  47  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2971  polysaccharide biosynthesis protein  24.09 
 
 		 475 aa  45.4  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.224966  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0890  polysaccharide biosynthesis protein  27.51 
 
 		 407 aa  45.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362175  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1411  polysaccharide biosynthesis protein  26.83 
 
 		 456 aa  45.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1391  polysaccharide biosynthesis protein  24.88 
 
 		 456 aa  45.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0172  polysaccharide efflux transporter, putative  25.42 
 
 		 495 aa  44.3  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.377433 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1933  polysaccharide biosynthesis protein  33.06 
 
 		 135 aa  44.3  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.546859 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2684  polysaccharide biosynthesis protein  22.25 
 
 		 539 aa  43.9  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6968  PST family polysaccharide export protein  25.91 
 
 		 458 aa  43.9  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.756164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3112  multidrug efflux protein  31.2 
 
 		 465 aa  43.5  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>