44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1961 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1961  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 431 aa  831    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0629938 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3720  polysaccharide biosynthesis protein  42.4 
 
 		 470 aa  228  1e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.293935  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1767  polysaccharide biosynthesis protein  25.57 
 
 		 447 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0935149 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0777  polysaccharide biosynthesis protein  27.23 
 
 		 441 aa  88.6  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1796  polysaccharide biosynthesis protein  25.42 
 
 		 453 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2304  polysaccharide biosynthesis protein  31.22 
 
 		 494 aa  74.7  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.298994  normal  0.0362143 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001317  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsJ Membrane protein export of O-antigen and teichoic acid  25.19 
 
 		 435 aa  72.8  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.872862  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05198  hypothetical protein  31.93 
 
 		 435 aa  72.8  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  23.78 
 
 		 512 aa  72  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1836  polysaccharide biosynthesis protein  26.44 
 
 		 446 aa  66.6  0.0000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  19.85 
 
 		 499 aa  66.6  0.0000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1862  polysaccharide efflux transporter, putative  33.67 
 
 		 496 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1685  polysaccharide biosynthesis protein  29.38 
 
 		 441 aa  61.6  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.929392  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4091  polysaccharide biosynthesis protein  18.96 
 
 		 430 aa  61.6  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0172  polysaccharide efflux transporter, putative  30 
 
 		 495 aa  60.1  0.00000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.377433 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1211  polysaccharide biosynthesis protein  25.13 
 
 		 489 aa  57  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2996  polysaccharide biosynthesis protein  31.31 
 
 		 459 aa  57  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143417 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2684  polysaccharide biosynthesis protein  24.35 
 
 		 539 aa  56.6  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2278  polysaccharide biosynthesis protein  26.03 
 
 		 516 aa  55.1  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  25.06 
 
 		 483 aa  54.7  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2438  polysaccharide biosynthesis protein  28.74 
 
 		 495 aa  54.3  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2073  polysaccharide biosynthesis protein  28.57 
 
 		 492 aa  53.9  0.000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3832  polysaccharide biosynthesis protein  27.67 
 
 		 471 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.431872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0796  hypothetical membrane associated protein  24.63 
 
 		 436 aa  52.8  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.610272  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3983  polysaccharide biosynthesis associated protein  27.69 
 
 		 467 aa  51.2  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0945  multi antimicrobial extrusion protein MatE  27.71 
 
 		 495 aa  50.4  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.903745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1391  polysaccharide biosynthesis protein  28.06 
 
 		 456 aa  50.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3018  polysaccharide biosynthesis protein  29.06 
 
 		 468 aa  48.5  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0987  polysaccharide biosynthesis protein  30.6 
 
 		 458 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.676741 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8594  polysaccharide biosynthesis protein  24 
 
 		 434 aa  47.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4418  polysaccharide biosynthesis protein  28.96 
 
 		 438 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2139  polysaccharide biosynthesis protein  21.25 
 
 		 482 aa  47.4  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00876576  normal  0.418146 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6268  polysaccharide biosynthesis protein  23.08 
 
 		 454 aa  46.6  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.455573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0040  polysaccharide biosynthesis protein  26.25 
 
 		 435 aa  46.6  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000125854  normal  0.0319641 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3971  polysaccharide biosynthesis protein  27.75 
 
 		 582 aa  46.6  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.137474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0890  polysaccharide biosynthesis protein  32.92 
 
 		 407 aa  46.6  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362175  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3948  polysaccharide biosynthesis protein  23.02 
 
 		 473 aa  45.8  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  22.73 
 
 		 517 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3797  polysaccharide biosynthesis protein  32.39 
 
 		 461 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.683173  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3541  polysaccharide biosynthesis protein  26.92 
 
 		 474 aa  44.3  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1020  polysaccharide biosynthesis protein  27.68 
 
 		 490 aa  44.7  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0259  polysaccharide biosynthesis protein  30.77 
 
 		 498 aa  43.9  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1933  polysaccharide biosynthesis protein  33.33 
 
 		 135 aa  43.9  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.546859 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2969  O-antigen and teichoic acid-like export protein  23.28 
 
 		 449 aa  43.5  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.369206  normal  0.787883 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>