13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_0796 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009727  CBUD_0796  hypothetical membrane associated protein  100 
 
 
436 aa  866    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.610272  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2996  polysaccharide biosynthesis protein  22.33 
 
 
459 aa  67.4  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.143417 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3797  polysaccharide biosynthesis protein  20.66 
 
 
461 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.683173  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4001  polysaccharide biosynthesis protein  23.1 
 
 
455 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.443077 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1836  polysaccharide biosynthesis protein  20.95 
 
 
446 aa  50.8  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3553  polysaccharide biosynthesis protein  23.66 
 
 
458 aa  50.1  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2754  polysaccharide biosynthesis protein  24.29 
 
 
460 aa  49.7  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.316209  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0528  cytosol aminopeptidase  27.32 
 
 
464 aa  48.5  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  23.11 
 
 
512 aa  48.9  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3983  polysaccharide biosynthesis associated protein  23.17 
 
 
467 aa  48.5  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  21.46 
 
 
517 aa  45.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1411  polysaccharide biosynthesis protein  21.99 
 
 
456 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1252  leucine rich repeat variant  29.13 
 
 
320 aa  44.3  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>