78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2278 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2278  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 516 aa  979    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2438  polysaccharide biosynthesis protein  56.72 
 
 		 495 aa  527  1e-148  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1862  polysaccharide efflux transporter, putative  46.17 
 
 		 496 aa  364  2e-99  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0259  polysaccharide biosynthesis protein  47.05 
 
 		 498 aa  347  3e-94  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0172  polysaccharide efflux transporter, putative  43.48 
 
 		 495 aa  320  3e-86  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.377433 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2304  polysaccharide biosynthesis protein  40.91 
 
 		 494 aa  315  9e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.298994  normal  0.0362143 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2073  polysaccharide biosynthesis protein  39.44 
 
 		 492 aa  309  5.9999999999999995e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  26.95 
 
 		 512 aa  134  5e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  24.26 
 
 		 517 aa  110  8.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2684  polysaccharide biosynthesis protein  26.2 
 
 		 539 aa  89.7  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0777  polysaccharide biosynthesis protein  29.02 
 
 		 441 aa  89.7  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  20.54 
 
 		 499 aa  86.7  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4091  polysaccharide biosynthesis protein  23.76 
 
 		 430 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2188  polysaccharide biosynthesis protein  25.05 
 
 		 495 aa  82.8  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2457  polysaccharide biosynthesis protein  23.19 
 
 		 514 aa  82.4  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.267844  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1211  polysaccharide biosynthesis protein  21.21 
 
 		 489 aa  82.8  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1767  polysaccharide biosynthesis protein  28.27 
 
 		 447 aa  75.5  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0935149 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3018  polysaccharide biosynthesis protein  32.78 
 
 		 468 aa  70.5  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3983  polysaccharide biosynthesis associated protein  30.32 
 
 		 467 aa  69.7  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3797  polysaccharide biosynthesis protein  24.84 
 
 		 461 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.683173  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1796  polysaccharide biosynthesis protein  22.74 
 
 		 453 aa  65.9  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001317  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsJ Membrane protein export of O-antigen and teichoic acid  25.7 
 
 		 435 aa  65.5  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.872862  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0945  multi antimicrobial extrusion protein MatE  31.67 
 
 		 495 aa  63.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.903745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1836  polysaccharide biosynthesis protein  25.37 
 
 		 446 aa  62  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3832  polysaccharide biosynthesis protein  29.19 
 
 		 471 aa  60.1  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.431872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2504  polysaccharide biosynthesis protein  24.64 
 
 		 486 aa  57.4  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1933  polysaccharide biosynthesis protein  31.54 
 
 		 135 aa  57  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.546859 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1965  polysaccharide biosynthesis protein  30.24 
 
 		 463 aa  56.2  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0295315 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3101  polysaccharide biosynthesis protein  28.69 
 
 		 489 aa  56.6  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0405344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3541  polysaccharide biosynthesis protein  28.71 
 
 		 474 aa  55.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2996  polysaccharide biosynthesis protein  28.71 
 
 		 459 aa  55.5  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143417 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1074  polysaccharide biosynthesis protein  22 
 
 		 476 aa  54.7  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0510405  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0177  polysaccharide biosynthesis protein  26.29 
 
 		 446 aa  54.7  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2520  polysaccharide biosynthesis protein  24.43 
 
 		 474 aa  54.3  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.889784 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  28.19 
 
 		 444 aa  53.5  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0987  polysaccharide biosynthesis protein  34.59 
 
 		 458 aa  53.5  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.676741 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1391  polysaccharide biosynthesis protein  25.79 
 
 		 456 aa  52.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  27.03 
 
 		 444 aa  51.6  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4685  polysaccharide biosynthesis protein  28.14 
 
 		 453 aa  52  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  22.95 
 
 		 490 aa  52  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  25.13 
 
 		 444 aa  51.2  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2947  polysaccharide biosynthesis protein  28.57 
 
 		 484 aa  51.2  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  24.59 
 
 		 483 aa  51.2  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2971  polysaccharide biosynthesis protein  24.59 
 
 		 475 aa  50.4  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.224966  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0561  polysaccharide biosynthesis protein  25.99 
 
 		 456 aa  50.1  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0890  polysaccharide biosynthesis protein  31.89 
 
 		 407 aa  50.1  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362175  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3971  polysaccharide biosynthesis protein  27.81 
 
 		 582 aa  50.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.137474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1836  hypothetical protein  27.75 
 
 		 523 aa  49.7  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1961  polysaccharide biosynthesis protein  32.35 
 
 		 431 aa  49.7  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0629938 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0950  polysaccharide biosynthesis protein  33.56 
 
 		 458 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0259794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2139  polysaccharide biosynthesis protein  22.33 
 
 		 482 aa  48.9  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00876576  normal  0.418146 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4001  polysaccharide biosynthesis protein  25.38 
 
 		 455 aa  49.3  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.443077 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6968  PST family polysaccharide export protein  26.51 
 
 		 458 aa  48.9  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.756164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2892  polysaccharide biosynthesis protein  28.97 
 
 		 429 aa  48.9  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2006  polysaccharide biosynthesis protein  28.11 
 
 		 529 aa  48.9  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.300214  normal  0.433718 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2754  polysaccharide biosynthesis protein  25.89 
 
 		 460 aa  48.5  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.316209  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1071  polysaccharide biosynthesis protein  23.16 
 
 		 489 aa  48.1  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0926  polysaccharide biosynthesis protein  27.05 
 
 		 458 aa  48.1  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.287187 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4019  polysaccharide biosynthesis protein  24.73 
 
 		 483 aa  47.4  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0174  colanic acid exporter  29.67 
 
 		 483 aa  47.4  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  0.572056 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2015  polysaccharide biosynthesis protein  26.09 
 
 		 466 aa  47.4  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.42395 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3553  polysaccharide biosynthesis protein  25.79 
 
 		 458 aa  47  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05198  hypothetical protein  28.87 
 
 		 435 aa  46.6  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1772  polysaccharide biosynthesis protein  27.43 
 
 		 496 aa  47  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0929  polysaccharide biosynthesis protein  20.22 
 
 		 489 aa  46.6  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1827  hypothetical protein  27.72 
 
 		 522 aa  45.8  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.356009  normal  0.0154869 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0972  polysaccharide synthase family protein  23.11 
 
 		 506 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0956622 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3876  polysaccharide biosynthesis protein  25.91 
 
 		 427 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0883  polysaccharide biosynthesis protein CsaA  23.11 
 
 		 506 aa  45.1  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0588  polysaccharide biosynthesis protein  23.21 
 
 		 410 aa  45.1  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0284636  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0839  polysaccharide biosynthesis protein CsaA  23.11 
 
 		 506 aa  45.1  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  24.71 
 
 		 490 aa  44.7  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1062  polysaccharide synthase family protein  23.71 
 
 		 506 aa  45.1  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000239702  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0040  polysaccharide biosynthesis protein  21.03 
 
 		 435 aa  44.7  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000125854  normal  0.0319641 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0744  polysaccharide biosynthesis protein  23.24 
 
 		 436 aa  44.7  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.923042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1411  polysaccharide biosynthesis protein  26.63 
 
 		 456 aa  44.3  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0787  polysaccharide biosynthesis protein  22.9 
 
 		 506 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0496201  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0234  lipopolysaccharide O-side chain biosynthesis protein (O-antigen transpoter)  23.17 
 
 		 476 aa  43.5  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00421263  normal  0.454805 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>