76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1522 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1522  PST family polysaccharide transporter  100 
 
 		 478 aa  959    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00741299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1057  PST family polysaccharide transporter  30.98 
 
 		 471 aa  223  4.9999999999999996e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.140128  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1371  polysaccharide biosynthesis protein  30.32 
 
 		 472 aa  219  1e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1407  PST family polysaccharide transporter  30.47 
 
 		 481 aa  216  5.9999999999999996e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1142  PST family polysaccharide transporter  27.06 
 
 		 475 aa  204  3e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000134656  hitchhiker  0.0000175319 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1412  polysaccharide biosynthesis protein  31.33 
 
 		 474 aa  199  7.999999999999999e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0573  polysaccharide biosynthesis protein  26.81 
 
 		 477 aa  191  2.9999999999999997e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000747167  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3041  polysaccharide biosynthesis protein  28.82 
 
 		 471 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2910  polysaccharide biosynthesis protein  28.04 
 
 		 485 aa  190  5.999999999999999e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1353  polysaccharide biosynthesis protein  28.18 
 
 		 486 aa  183  5.0000000000000004e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0220  PST family polysaccharide transporter  30.04 
 
 		 472 aa  163  5.0000000000000005e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5060  polysaccharide biosynthesis protein  29.59 
 
 		 478 aa  162  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1496  PST family polysaccharide transporter  26.44 
 
 		 484 aa  151  2e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.104259  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0118  polysaccharide biosynthesis protein  26.09 
 
 		 476 aa  150  5e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0224366  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0123  polysaccharide biosynthesis protein  26.09 
 
 		 476 aa  150  5e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.281108  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0604  polysaccharide biosynthesis protein  23.82 
 
 		 483 aa  109  9.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000572815  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0464  polysaccharide transporter protein, putative  24.18 
 
 		 486 aa  107  6e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000125112  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1620  polysaccharide biosynthesis protein  22.66 
 
 		 415 aa  105  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0681626  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0590  polysaccharide biosynthesis protein, putative  24.14 
 
 		 483 aa  100  8e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000415804  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2025  polysaccharide biosynthesis protein  24.16 
 
 		 424 aa  92.8  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.997214  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2745  polysaccharide biosynthesis protein  26.04 
 
 		 412 aa  88.6  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4360  polysaccharide biosynthesis protein  22.6 
 
 		 429 aa  83.6  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.86188 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2041  polysaccharide biosynthesis protein  22.69 
 
 		 415 aa  82.4  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0334353  normal  0.0804458 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0849  polysaccharide biosynthesis protein  22.22 
 
 		 419 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5560  polysaccharide biosynthesis protein, putative  21.24 
 
 		 484 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5222  polysaccharide biosynthesis protein  20.63 
 
 		 484 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0028  polysaccharide biosynthesis protein  20.88 
 
 		 484 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6400  polysaccharide biosynthesis protein  21.94 
 
 		 431 aa  69.3  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.247838 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0520  polysaccharide biosynthesis family protein  21.88 
 
 		 422 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.203953  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3697  polysaccharide biosynthesis protein  22.43 
 
 		 443 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1081  polysaccharide biosynthesis protein  22.96 
 
 		 421 aa  68.2  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2497  polysaccharide transporter  21.61 
 
 		 422 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.547808  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1405  polysaccharide biosynthesis protein  23 
 
 		 418 aa  65.5  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000283826  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0806  polysaccharide biosynthesis family protein  21.61 
 
 		 422 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5676  polysaccharide biosynthesis protein  21.73 
 
 		 484 aa  65.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5522  polysaccharide synthase family protein  21.73 
 
 		 484 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0642  polysaccharide transporter  21.61 
 
 		 422 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.21935  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0627  polysaccharide biosynthesis family protein  21.61 
 
 		 422 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2209  polysaccharide transporter  21.61 
 
 		 422 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2875  polysaccharide transporter  21.61 
 
 		 422 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0027  polysaccharide biosynthesis family protein  21.61 
 
 		 422 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342295  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5279  polysaccharide biosynthesis protein  21.73 
 
 		 484 aa  65.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0394078  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6018  polysaccharide biosynthesis protein  19.95 
 
 		 433 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.203106 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5123  spore cortex biosynthesis protein  21.73 
 
 		 484 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151446  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4200  polysaccharide biosynthesis protein  20.45 
 
 		 417 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.404926 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3316  polysaccharide biosynthesis protein  20.45 
 
 		 417 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0788043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4166  polysaccharide biosynthesis protein  20.45 
 
 		 417 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507145  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1929  polysaccharide biosynthesis protein  20.97 
 
 		 424 aa  63.5  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.109004  normal  0.370568 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6729  polysaccharide biosynthesis protein  20.45 
 
 		 415 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4403  polysaccharide biosynthesis protein  21.23 
 
 		 417 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.279052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  22.22 
 
 		 444 aa  59.7  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2535  polysaccharide biosynthesis protein  22.81 
 
 		 409 aa  59.7  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02920  O-antigen transporter  24.14 
 
 		 416 aa  58.5  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00862586  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  22.57 
 
 		 444 aa  56.6  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3729  polysaccharide biosynthesis protein  19.79 
 
 		 438 aa  52.8  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0553833 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0744  polysaccharide biosynthesis protein  20.68 
 
 		 436 aa  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.923042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2504  polysaccharide biosynthesis protein  23.74 
 
 		 486 aa  51.6  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6750  polysaccharide biosynthesis protein  20.63 
 
 		 429 aa  51.2  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001317  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsJ Membrane protein export of O-antigen and teichoic acid  26.45 
 
 		 435 aa  50.1  0.00009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.872862  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3618  polysaccharide biosynthesis protein  20.14 
 
 		 419 aa  50.1  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.180964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2229  polysaccharide transporter  22.9 
 
 		 488 aa  49.7  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0925528 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4093  polysaccharide biosynthesis protein  20.14 
 
 		 419 aa  49.7  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3458  polysaccharide biosynthesis protein  21.57 
 
 		 427 aa  49.3  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2253  lipopolysaccharide (O-antigen)exporter  20.95 
 
 		 444 aa  49.3  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3189  polysaccharide biosynthesis protein  22.85 
 
 		 446 aa  48.5  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.27784  hitchhiker  0.00540344 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1197  Wzx  20.98 
 
 		 405 aa  48.1  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.905565  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2892  polysaccharide biosynthesis protein  22.28 
 
 		 429 aa  47.4  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1969  polysaccharide biosynthesis protein  22.81 
 
 		 488 aa  47.4  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0361  polysaccharide biosynthesis protein  22.79 
 
 		 482 aa  47  0.0007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3147  polysaccharide biosynthesis protein  22.88 
 
 		 475 aa  47  0.0009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.875944  normal  0.24442 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  20.77 
 
 		 490 aa  45.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0582  polysaccharide biosynthesis protein  20 
 
 		 406 aa  45.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224366  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1104  polysaccharide biosynthesis protein  22.83 
 
 		 429 aa  43.9  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5107  oligosaccharide translocase  22.89 
 
 		 483 aa  43.9  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2854  polysaccharide biosynthesis protein  26.95 
 
 		 423 aa  43.9  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.444695  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  23.2 
 
 		 444 aa  43.9  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>