75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1104 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1104  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 429 aa  848    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1369  polysaccharide biosynthesis protein  39.65 
 
 		 416 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.52788  normal  0.0165485 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1081  polysaccharide biosynthesis protein  26 
 
 		 421 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1405  polysaccharide biosynthesis protein  29.93 
 
 		 418 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000283826  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1620  polysaccharide biosynthesis protein  26.88 
 
 		 415 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0681626  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0849  polysaccharide biosynthesis protein  25.19 
 
 		 419 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4360  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 429 aa  116  6.9999999999999995e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.86188 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6400  polysaccharide biosynthesis protein  29.46 
 
 		 431 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.247838 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0582  polysaccharide biosynthesis protein  28.36 
 
 		 406 aa  114  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224366  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2041  polysaccharide biosynthesis protein  28.16 
 
 		 415 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0334353  normal  0.0804458 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6018  polysaccharide biosynthesis protein  24.71 
 
 		 433 aa  110  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.203106 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0699  hypothetical protein  26.57 
 
 		 422 aa  109  8.000000000000001e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.786722 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2025  polysaccharide biosynthesis protein  28.66 
 
 		 424 aa  108  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.997214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0520  polysaccharide biosynthesis family protein  25.55 
 
 		 422 aa  106  7e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.203953  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02920  O-antigen transporter  27.69 
 
 		 416 aa  103  6e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00862586  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0806  polysaccharide biosynthesis family protein  25.24 
 
 		 422 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0642  polysaccharide transporter  25.24 
 
 		 422 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.21935  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0627  polysaccharide biosynthesis family protein  25.24 
 
 		 422 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2209  polysaccharide transporter  25.24 
 
 		 422 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2875  polysaccharide transporter  25.24 
 
 		 422 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2497  polysaccharide transporter  25.24 
 
 		 422 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.547808  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0027  polysaccharide biosynthesis family protein  25.24 
 
 		 422 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342295  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1929  polysaccharide biosynthesis protein  28.31 
 
 		 424 aa  96.7  7e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.109004  normal  0.370568 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2253  lipopolysaccharide (O-antigen)exporter  23.84 
 
 		 444 aa  95.5  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3618  polysaccharide biosynthesis protein  23.58 
 
 		 419 aa  94.4  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.180964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4093  polysaccharide biosynthesis protein  22.92 
 
 		 419 aa  94  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2910  polysaccharide biosynthesis protein  25.38 
 
 		 485 aa  94  5e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3041  polysaccharide biosynthesis protein  25.28 
 
 		 471 aa  91.3  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6729  polysaccharide biosynthesis protein  22.32 
 
 		 415 aa  90.5  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2419  polysaccharide biosynthesis protein  23.74 
 
 		 431 aa  89.4  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0814087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1820  polysaccharide biosynthesis protein  23.84 
 
 		 418 aa  88.6  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.482229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1353  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 486 aa  86.7  7e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1057  PST family polysaccharide transporter  27.02 
 
 		 471 aa  85.9  0.000000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.140128  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0118  polysaccharide biosynthesis protein  25.45 
 
 		 476 aa  84.7  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0224366  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0123  polysaccharide biosynthesis protein  25.45 
 
 		 476 aa  84.7  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.281108  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4403  polysaccharide biosynthesis protein  23.03 
 
 		 417 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.279052  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2854  polysaccharide biosynthesis protein  24.26 
 
 		 423 aa  80.5  0.00000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.444695  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1197  Wzx  28.09 
 
 		 405 aa  79.7  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.905565  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4200  polysaccharide biosynthesis protein  22.81 
 
 		 417 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.404926 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4166  polysaccharide biosynthesis protein  22.81 
 
 		 417 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507145  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3316  polysaccharide biosynthesis protein  22.81 
 
 		 417 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0788043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0464  polysaccharide transporter protein, putative  24.39 
 
 		 486 aa  76.3  0.0000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000125112  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12370  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  25.08 
 
 		 424 aa  76.3  0.0000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0604  polysaccharide biosynthesis protein  23.78 
 
 		 483 aa  74.3  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000572815  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1496  PST family polysaccharide transporter  26.37 
 
 		 484 aa  73.6  0.000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.104259  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1142  PST family polysaccharide transporter  28.96 
 
 		 475 aa  73.2  0.000000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000134656  hitchhiker  0.0000175319 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3697  polysaccharide biosynthesis protein  22.11 
 
 		 443 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1606  polysaccharide biosynthesis protein  24.74 
 
 		 412 aa  71.6  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0714758  normal  0.23948 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2745  polysaccharide biosynthesis protein  26.91 
 
 		 412 aa  69.3  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0590  polysaccharide biosynthesis protein, putative  23.88 
 
 		 483 aa  68.2  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000415804  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3458  polysaccharide biosynthesis protein  21.43 
 
 		 427 aa  68.2  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5060  polysaccharide biosynthesis protein  23.24 
 
 		 478 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1407  PST family polysaccharide transporter  23.13 
 
 		 481 aa  66.2  0.0000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2652  polysaccharide biosynthesis protein  23.56 
 
 		 426 aa  65.5  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0561066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2535  polysaccharide biosynthesis protein  25.46 
 
 		 409 aa  63.2  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1412  polysaccharide biosynthesis protein  25.45 
 
 		 474 aa  61.6  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0573  polysaccharide biosynthesis protein  22.57 
 
 		 477 aa  60.8  0.00000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000747167  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5222  polysaccharide biosynthesis protein  23.74 
 
 		 484 aa  60.5  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23390  putative polysaccharide biosynthesis protein  22.07 
 
 		 420 aa  59.7  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000307585  hitchhiker  0.00805893 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5560  polysaccharide biosynthesis protein, putative  22.73 
 
 		 484 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5522  polysaccharide synthase family protein  23.72 
 
 		 484 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5676  polysaccharide biosynthesis protein  23.72 
 
 		 484 aa  58.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5123  spore cortex biosynthesis protein  23.72 
 
 		 484 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151446  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5279  polysaccharide biosynthesis protein  23.72 
 
 		 484 aa  58.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0394078  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1371  polysaccharide biosynthesis protein  20.36 
 
 		 472 aa  52  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1033  polysaccharide biosynthesis protein  24.26 
 
 		 412 aa  50.1  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0437322  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3014  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  24.12 
 
 		 422 aa  49.3  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2515  stage V sporulation protein B  24.92 
 
 		 520 aa  47  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0654527  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1162  polysaccharide biosynthesis protein CpsL  23.56 
 
 		 466 aa  46.6  0.0008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.333664  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5012  putative polysaccharide biosynthesis protein  22.51 
 
 		 499 aa  45.8  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3189  polysaccharide biosynthesis protein  21.45 
 
 		 446 aa  45.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.27784  hitchhiker  0.00540344 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0220  PST family polysaccharide transporter  21.28 
 
 		 472 aa  44.7  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1522  PST family polysaccharide transporter  22.83 
 
 		 478 aa  43.9  0.005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00741299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4091  polysaccharide biosynthesis protein  22.56 
 
 		 430 aa  43.1  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0028  polysaccharide biosynthesis protein  22.87 
 
 		 484 aa  43.1  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>