80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1081 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1081  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 421 aa  846    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0582  polysaccharide biosynthesis protein  40.62 
 
 		 406 aa  256  4e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224366  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1405  polysaccharide biosynthesis protein  31.22 
 
 		 418 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000283826  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02920  O-antigen transporter  38.35 
 
 		 416 aa  187  2e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00862586  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1929  polysaccharide biosynthesis protein  33.33 
 
 		 424 aa  181  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.109004  normal  0.370568 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6400  polysaccharide biosynthesis protein  28.13 
 
 		 431 aa  157  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.247838 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4360  polysaccharide biosynthesis protein  25.66 
 
 		 429 aa  139  8.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.86188 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1620  polysaccharide biosynthesis protein  24.56 
 
 		 415 aa  134  3e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0681626  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0849  polysaccharide biosynthesis protein  26.91 
 
 		 419 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1104  polysaccharide biosynthesis protein  26 
 
 		 429 aa  134  3.9999999999999996e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0699  hypothetical protein  27.61 
 
 		 422 aa  122  9e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.786722 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2041  polysaccharide biosynthesis protein  26.41 
 
 		 415 aa  119  9e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0334353  normal  0.0804458 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6729  polysaccharide biosynthesis protein  24.91 
 
 		 415 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2652  polysaccharide biosynthesis protein  24.92 
 
 		 426 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0561066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0520  polysaccharide biosynthesis family protein  22.88 
 
 		 422 aa  106  8e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.203953  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2025  polysaccharide biosynthesis protein  24.63 
 
 		 424 aa  106  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.997214  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2745  polysaccharide biosynthesis protein  24.7 
 
 		 412 aa  105  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3618  polysaccharide biosynthesis protein  24.26 
 
 		 419 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.180964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0806  polysaccharide biosynthesis family protein  22.51 
 
 		 422 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0573  polysaccharide biosynthesis protein  23.86 
 
 		 477 aa  105  2e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000747167  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0027  polysaccharide biosynthesis family protein  22.51 
 
 		 422 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342295  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2497  polysaccharide transporter  22.51 
 
 		 422 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.547808  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0642  polysaccharide transporter  22.51 
 
 		 422 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.21935  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0627  polysaccharide biosynthesis family protein  22.51 
 
 		 422 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2209  polysaccharide transporter  22.51 
 
 		 422 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2875  polysaccharide transporter  22.51 
 
 		 422 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1197  Wzx  23.02 
 
 		 405 aa  104  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.905565  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1353  polysaccharide biosynthesis protein  25.13 
 
 		 486 aa  104  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4093  polysaccharide biosynthesis protein  24.26 
 
 		 419 aa  103  8e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1369  polysaccharide biosynthesis protein  24.53 
 
 		 416 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.52788  normal  0.0165485 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12370  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  25.71 
 
 		 424 aa  99  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1820  polysaccharide biosynthesis protein  22.92 
 
 		 418 aa  95.1  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.482229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1057  PST family polysaccharide transporter  22.68 
 
 		 471 aa  94  4e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.140128  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4166  polysaccharide biosynthesis protein  22.75 
 
 		 417 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507145  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4200  polysaccharide biosynthesis protein  22.75 
 
 		 417 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.404926 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3316  polysaccharide biosynthesis protein  22.75 
 
 		 417 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0788043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1496  PST family polysaccharide transporter  26.69 
 
 		 484 aa  90.1  6e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.104259  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1407  PST family polysaccharide transporter  23.56 
 
 		 481 aa  89.4  1e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2419  polysaccharide biosynthesis protein  26.69 
 
 		 431 aa  88.2  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0814087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4403  polysaccharide biosynthesis protein  21.96 
 
 		 417 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.279052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1142  PST family polysaccharide transporter  23.47 
 
 		 475 aa  80.1  0.00000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000134656  hitchhiker  0.0000175319 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3458  polysaccharide biosynthesis protein  26.6 
 
 		 427 aa  79.7  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1606  polysaccharide biosynthesis protein  24.65 
 
 		 412 aa  79.7  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0714758  normal  0.23948 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3697  polysaccharide biosynthesis protein  23.61 
 
 		 443 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1033  polysaccharide biosynthesis protein  27.14 
 
 		 412 aa  79  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0437322  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1412  polysaccharide biosynthesis protein  23.69 
 
 		 474 aa  77  0.0000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1371  polysaccharide biosynthesis protein  22.78 
 
 		 472 aa  75.5  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2854  polysaccharide biosynthesis protein  23.43 
 
 		 423 aa  75.1  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.444695  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2910  polysaccharide biosynthesis protein  24.29 
 
 		 485 aa  75.1  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2253  lipopolysaccharide (O-antigen)exporter  18.35 
 
 		 444 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3041  polysaccharide biosynthesis protein  24.17 
 
 		 471 aa  73.6  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23390  putative polysaccharide biosynthesis protein  22.22 
 
 		 420 aa  70.5  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000307585  hitchhiker  0.00805893 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6018  polysaccharide biosynthesis protein  17.48 
 
 		 433 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.203106 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1522  PST family polysaccharide transporter  22.96 
 
 		 478 aa  68.2  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00741299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5222  polysaccharide biosynthesis protein  21.62 
 
 		 484 aa  65.9  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1675  polysaccharide biosynthesis protein  24.3 
 
 		 430 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0104334  normal  0.413628 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5060  polysaccharide biosynthesis protein  23.01 
 
 		 478 aa  64.7  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0123  polysaccharide biosynthesis protein  23.1 
 
 		 476 aa  64.3  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.281108  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3729  polysaccharide biosynthesis protein  23.76 
 
 		 438 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0553833 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0118  polysaccharide biosynthesis protein  23.1 
 
 		 476 aa  64.3  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0224366  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5560  polysaccharide biosynthesis protein, putative  21.96 
 
 		 484 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0464  polysaccharide transporter protein, putative  24.31 
 
 		 486 aa  62  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000125112  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0604  polysaccharide biosynthesis protein  24.02 
 
 		 483 aa  61.2  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000572815  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0028  polysaccharide biosynthesis protein  23.94 
 
 		 484 aa  60.1  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0220  PST family polysaccharide transporter  22.76 
 
 		 472 aa  58.5  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5279  polysaccharide biosynthesis protein  22.54 
 
 		 484 aa  57.4  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0394078  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5522  polysaccharide synthase family protein  22.54 
 
 		 484 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0590  polysaccharide biosynthesis protein, putative  27.38 
 
 		 483 aa  57.4  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000415804  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5123  spore cortex biosynthesis protein  22.54 
 
 		 484 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151446  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5676  polysaccharide biosynthesis protein  22.54 
 
 		 484 aa  57.4  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2062  polysaccharide biosynthesis protein  22.49 
 
 		 511 aa  54.3  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.445911  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0629  lipopolysaccharide/O-antigen transporter, putative  20 
 
 		 467 aa  51.2  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2535  polysaccharide biosynthesis protein  21.52 
 
 		 409 aa  50.8  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0386  polysaccharide biosynthesis protein  28.57 
 
 		 427 aa  49.7  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6750  polysaccharide biosynthesis protein  21.7 
 
 		 429 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2211  polysaccharide biosynthesis protein  21.18 
 
 		 494 aa  44.7  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.167884  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1649  polysaccharide synthase family protein  23.26 
 
 		 478 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.44301  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  20.97 
 
 		 449 aa  43.5  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1681  polysaccharide synthase family protein  23.05 
 
 		 478 aa  43.1  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1495  polysaccharide biosynthesis protein  23.32 
 
 		 484 aa  43.1  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>