90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_02920 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_02920  O-antigen transporter  100 
 
 		 416 aa  804    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00862586  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1405  polysaccharide biosynthesis protein  37.22 
 
 		 418 aa  256  4e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000283826  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1929  polysaccharide biosynthesis protein  37.62 
 
 		 424 aa  253  3e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.109004  normal  0.370568 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1081  polysaccharide biosynthesis protein  38.35 
 
 		 421 aa  206  5e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6400  polysaccharide biosynthesis protein  29.69 
 
 		 431 aa  176  6e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.247838 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2041  polysaccharide biosynthesis protein  28.75 
 
 		 415 aa  165  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0334353  normal  0.0804458 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4360  polysaccharide biosynthesis protein  26.2 
 
 		 429 aa  160  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.86188 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1620  polysaccharide biosynthesis protein  29.87 
 
 		 415 aa  157  3e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0681626  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0520  polysaccharide biosynthesis family protein  24.88 
 
 		 422 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.203953  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0627  polysaccharide biosynthesis family protein  24.69 
 
 		 422 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0806  polysaccharide biosynthesis family protein  24.69 
 
 		 422 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0642  polysaccharide transporter  24.69 
 
 		 422 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.21935  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1197  Wzx  30.67 
 
 		 405 aa  151  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.905565  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2875  polysaccharide transporter  24.69 
 
 		 422 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2209  polysaccharide transporter  24.69 
 
 		 422 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2497  polysaccharide transporter  24.69 
 
 		 422 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.547808  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0027  polysaccharide biosynthesis family protein  24.69 
 
 		 422 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342295  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0849  polysaccharide biosynthesis protein  27.39 
 
 		 419 aa  149  7e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0582  polysaccharide biosynthesis protein  28.47 
 
 		 406 aa  146  5e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224366  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2025  polysaccharide biosynthesis protein  32.72 
 
 		 424 aa  146  6e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.997214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0699  hypothetical protein  28.07 
 
 		 422 aa  139  1e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.786722 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4403  polysaccharide biosynthesis protein  25.32 
 
 		 417 aa  137  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.279052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6018  polysaccharide biosynthesis protein  24.12 
 
 		 433 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.203106 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4200  polysaccharide biosynthesis protein  24.55 
 
 		 417 aa  133  6e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.404926 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3316  polysaccharide biosynthesis protein  24.55 
 
 		 417 aa  133  6e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0788043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4166  polysaccharide biosynthesis protein  24.55 
 
 		 417 aa  133  6e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507145  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4093  polysaccharide biosynthesis protein  26.8 
 
 		 419 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6729  polysaccharide biosynthesis protein  22.82 
 
 		 415 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3618  polysaccharide biosynthesis protein  26.55 
 
 		 419 aa  130  6e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.180964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1820  polysaccharide biosynthesis protein  26.27 
 
 		 418 aa  124  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.482229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1104  polysaccharide biosynthesis protein  27.36 
 
 		 429 aa  119  9.999999999999999e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2253  lipopolysaccharide (O-antigen)exporter  21.88 
 
 		 444 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12370  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  24.88 
 
 		 424 aa  114  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2419  polysaccharide biosynthesis protein  27.36 
 
 		 431 aa  113  8.000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0814087  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2745  polysaccharide biosynthesis protein  32.33 
 
 		 412 aa  112  9e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1369  polysaccharide biosynthesis protein  27.93 
 
 		 416 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.52788  normal  0.0165485 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0573  polysaccharide biosynthesis protein  25.67 
 
 		 477 aa  108  1e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000747167  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3697  polysaccharide biosynthesis protein  25.06 
 
 		 443 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1606  polysaccharide biosynthesis protein  24.94 
 
 		 412 aa  98.2  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0714758  normal  0.23948 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1057  PST family polysaccharide transporter  24.88 
 
 		 471 aa  97.8  3e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.140128  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1353  polysaccharide biosynthesis protein  25.63 
 
 		 486 aa  96.3  8e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0123  polysaccharide biosynthesis protein  25.51 
 
 		 476 aa  96.3  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.281108  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0118  polysaccharide biosynthesis protein  25.51 
 
 		 476 aa  96.3  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0224366  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3458  polysaccharide biosynthesis protein  29.21 
 
 		 427 aa  94.4  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2854  polysaccharide biosynthesis protein  24.41 
 
 		 423 aa  91.7  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.444695  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23390  putative polysaccharide biosynthesis protein  25.82 
 
 		 420 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000307585  hitchhiker  0.00805893 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1496  PST family polysaccharide transporter  29.54 
 
 		 484 aa  90.9  4e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.104259  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5222  polysaccharide biosynthesis protein  27.79 
 
 		 484 aa  90.5  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5560  polysaccharide biosynthesis protein, putative  27.54 
 
 		 484 aa  89.7  9e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2652  polysaccharide biosynthesis protein  22.92 
 
 		 426 aa  86.7  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0561066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3041  polysaccharide biosynthesis protein  23.41 
 
 		 471 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1407  PST family polysaccharide transporter  23.33 
 
 		 481 aa  82.8  0.00000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5123  spore cortex biosynthesis protein  29.03 
 
 		 484 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151446  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5279  polysaccharide biosynthesis protein  29.03 
 
 		 484 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0394078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5676  polysaccharide biosynthesis protein  29.03 
 
 		 484 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5522  polysaccharide synthase family protein  29.03 
 
 		 484 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2910  polysaccharide biosynthesis protein  22.94 
 
 		 485 aa  80.5  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0604  polysaccharide biosynthesis protein  23.79 
 
 		 483 aa  80.9  0.00000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000572815  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0464  polysaccharide transporter protein, putative  23.54 
 
 		 486 aa  80.1  0.00000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000125112  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1142  PST family polysaccharide transporter  24.74 
 
 		 475 aa  77.8  0.0000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000134656  hitchhiker  0.0000175319 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1522  PST family polysaccharide transporter  24.74 
 
 		 478 aa  76.6  0.0000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00741299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1033  polysaccharide biosynthesis protein  24.15 
 
 		 412 aa  73.9  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0437322  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1371  polysaccharide biosynthesis protein  22.61 
 
 		 472 aa  73.9  0.000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0590  polysaccharide biosynthesis protein, putative  23.89 
 
 		 483 aa  73.9  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000415804  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0028  polysaccharide biosynthesis protein  31.4 
 
 		 484 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1412  polysaccharide biosynthesis protein  25.19 
 
 		 474 aa  71.6  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0220  PST family polysaccharide transporter  23.86 
 
 		 472 aa  66.6  0.0000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3729  polysaccharide biosynthesis protein  26.44 
 
 		 438 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0553833 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0253  polysaccharide biosynthesis protein  27.29 
 
 		 435 aa  65.5  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000123579  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5060  polysaccharide biosynthesis protein  22.91 
 
 		 478 aa  62.8  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0391  polysaccharide biosynthesis protein  24.1 
 
 		 476 aa  61.2  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1027  putative polysaccharide biosynthesis protein  24.63 
 
 		 392 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1361  polysaccharide biosynthesis protein  27.36 
 
 		 413 aa  54.3  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483225  unclonable  0.0000000256808 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  24.3 
 
 		 488 aa  53.9  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0629  lipopolysaccharide/O-antigen transporter, putative  22.09 
 
 		 467 aa  53.5  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3147  polysaccharide biosynthesis protein  26.14 
 
 		 475 aa  50.4  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.875944  normal  0.24442 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6750  polysaccharide biosynthesis protein  22.7 
 
 		 429 aa  50.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1675  polysaccharide biosynthesis protein  21.6 
 
 		 430 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0104334  normal  0.413628 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1271  polysaccharide biosynthesis protein  31.71 
 
 		 429 aa  47.8  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.958308  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5107  oligosaccharide translocase  21.82 
 
 		 483 aa  46.6  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3014  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  24.07 
 
 		 422 aa  46.2  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1044  polysaccharide biosynthesis protein  22.26 
 
 		 440 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.041441  hitchhiker  0.00655602 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  20.7 
 
 		 449 aa  45.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  21.64 
 
 		 444 aa  44.3  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3093  O-antigen and teichoic acid-like export protein  32.47 
 
 		 507 aa  43.9  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0954  polysaccharide biosynthesis protein  31.9 
 
 		 514 aa  43.9  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.861474  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4091  polysaccharide biosynthesis protein  28.11 
 
 		 430 aa  43.5  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1593  polysaccharide biosynthesis protein  22.44 
 
 		 504 aa  43.1  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1120  MATE efflux family protein  27.19 
 
 		 444 aa  43.1  0.009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2675  polysaccharide biosynthesis protein  24.19 
 
 		 426 aa  43.1  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.132079  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>