117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0220 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0220  PST family polysaccharide transporter  100 
 
 		 472 aa  936    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1057  PST family polysaccharide transporter  46.92 
 
 		 471 aa  429  1e-119  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.140128  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1142  PST family polysaccharide transporter  44.7 
 
 		 475 aa  417  9.999999999999999e-116  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000134656  hitchhiker  0.0000175319 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1371  polysaccharide biosynthesis protein  42.53 
 
 		 472 aa  387  1e-106  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1407  PST family polysaccharide transporter  41.01 
 
 		 481 aa  380  1e-104  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1412  polysaccharide biosynthesis protein  43.02 
 
 		 474 aa  362  7.0000000000000005e-99  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1496  PST family polysaccharide transporter  39.04 
 
 		 484 aa  310  4e-83  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.104259  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2910  polysaccharide biosynthesis protein  33.12 
 
 		 485 aa  288  2e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1353  polysaccharide biosynthesis protein  33.33 
 
 		 486 aa  281  1e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0573  polysaccharide biosynthesis protein  35.36 
 
 		 477 aa  276  7e-73  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000747167  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3041  polysaccharide biosynthesis protein  34.29 
 
 		 471 aa  263  6e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5060  polysaccharide biosynthesis protein  38.65 
 
 		 478 aa  259  6e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0118  polysaccharide biosynthesis protein  29.45 
 
 		 476 aa  203  6e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0224366  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0123  polysaccharide biosynthesis protein  29.45 
 
 		 476 aa  203  6e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.281108  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1522  PST family polysaccharide transporter  29.08 
 
 		 478 aa  200  5e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00741299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0520  polysaccharide biosynthesis family protein  25.99 
 
 		 422 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.203953  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0806  polysaccharide biosynthesis family protein  26.6 
 
 		 422 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0627  polysaccharide biosynthesis family protein  26.6 
 
 		 422 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0642  polysaccharide transporter  26.6 
 
 		 422 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.21935  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0027  polysaccharide biosynthesis family protein  26.35 
 
 		 422 aa  126  6e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342295  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0604  polysaccharide biosynthesis protein  23.49 
 
 		 483 aa  127  6e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000572815  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2875  polysaccharide transporter  26.35 
 
 		 422 aa  126  6e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2209  polysaccharide transporter  26.35 
 
 		 422 aa  126  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2497  polysaccharide transporter  26.35 
 
 		 422 aa  126  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.547808  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0464  polysaccharide transporter protein, putative  24.43 
 
 		 486 aa  125  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000125112  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4166  polysaccharide biosynthesis protein  24.82 
 
 		 417 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507145  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4200  polysaccharide biosynthesis protein  24.82 
 
 		 417 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.404926 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3316  polysaccharide biosynthesis protein  24.82 
 
 		 417 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0788043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3618  polysaccharide biosynthesis protein  25.46 
 
 		 419 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.180964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4093  polysaccharide biosynthesis protein  24.93 
 
 		 419 aa  113  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1929  polysaccharide biosynthesis protein  24.64 
 
 		 424 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.109004  normal  0.370568 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5560  polysaccharide biosynthesis protein, putative  25.63 
 
 		 484 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4360  polysaccharide biosynthesis protein  24.35 
 
 		 429 aa  112  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.86188 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5222  polysaccharide biosynthesis protein  25.63 
 
 		 484 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6400  polysaccharide biosynthesis protein  25.58 
 
 		 431 aa  109  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.247838 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2041  polysaccharide biosynthesis protein  28.57 
 
 		 415 aa  105  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0334353  normal  0.0804458 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0849  polysaccharide biosynthesis protein  24.15 
 
 		 419 aa  105  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5279  polysaccharide biosynthesis protein  23.85 
 
 		 484 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0394078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5123  spore cortex biosynthesis protein  23.85 
 
 		 484 aa  102  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151446  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5676  polysaccharide biosynthesis protein  23.85 
 
 		 484 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5522  polysaccharide synthase family protein  23.85 
 
 		 484 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2025  polysaccharide biosynthesis protein  23.83 
 
 		 424 aa  101  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.997214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1405  polysaccharide biosynthesis protein  27.74 
 
 		 418 aa  101  4e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000283826  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0028  polysaccharide biosynthesis protein  23.25 
 
 		 484 aa  99.8  9e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4403  polysaccharide biosynthesis protein  22.58 
 
 		 417 aa  97.4  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.279052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1820  polysaccharide biosynthesis protein  23.72 
 
 		 418 aa  97.1  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.482229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2253  lipopolysaccharide (O-antigen)exporter  21.79 
 
 		 444 aa  93.2  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0590  polysaccharide biosynthesis protein, putative  22.85 
 
 		 483 aa  88.2  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000415804  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6018  polysaccharide biosynthesis protein  21.37 
 
 		 433 aa  87.8  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.203106 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1081  polysaccharide biosynthesis protein  23.23 
 
 		 421 aa  86.7  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6729  polysaccharide biosynthesis protein  22.28 
 
 		 415 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3697  polysaccharide biosynthesis protein  21.78 
 
 		 443 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0699  hypothetical protein  23.06 
 
 		 422 aa  81.3  0.00000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.786722 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1197  Wzx  22.8 
 
 		 405 aa  80.5  0.00000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.905565  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1620  polysaccharide biosynthesis protein  23.47 
 
 		 415 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0681626  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2745  polysaccharide biosynthesis protein  23.44 
 
 		 412 aa  73.2  0.000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02920  O-antigen transporter  23.86 
 
 		 416 aa  72.4  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00862586  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0234  lipopolysaccharide O-side chain biosynthesis protein (O-antigen transpoter)  31.31 
 
 		 476 aa  68.9  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00421263  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3797  polysaccharide biosynthesis protein  24.48 
 
 		 461 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.683173  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1104  polysaccharide biosynthesis protein  21.25 
 
 		 429 aa  65.1  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  25.71 
 
 		 488 aa  64.3  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  22.77 
 
 		 444 aa  61.6  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0582  polysaccharide biosynthesis protein  22.96 
 
 		 406 aa  61.2  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224366  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0929  polysaccharide biosynthesis protein  25.38 
 
 		 489 aa  60.8  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1675  polysaccharide biosynthesis protein  22.14 
 
 		 430 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0104334  normal  0.413628 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  24.87 
 
 		 490 aa  59.3  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1369  polysaccharide biosynthesis protein  20.77 
 
 		 416 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.52788  normal  0.0165485 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2419  polysaccharide biosynthesis protein  23.12 
 
 		 431 aa  57  0.0000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0814087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  22.39 
 
 		 483 aa  57  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1593  polysaccharide biosynthesis protein  27.23 
 
 		 504 aa  56.6  0.0000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1836  polysaccharide biosynthesis protein  30.73 
 
 		 446 aa  56.6  0.0000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1274  integral membrane protein MviN  25.93 
 
 		 506 aa  55.5  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0184214  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  25.56 
 
 		 490 aa  54.7  0.000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2636  integral membrane protein MviN  23.6 
 
 		 512 aa  54.7  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12370  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  21.65 
 
 		 424 aa  52.8  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  26.61 
 
 		 444 aa  52.8  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1384  polysaccharide biosynthesis protein  24.68 
 
 		 440 aa  52.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2652  polysaccharide biosynthesis protein  28.89 
 
 		 426 aa  52.4  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0561066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2892  polysaccharide biosynthesis protein  19.76 
 
 		 429 aa  52.4  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3729  polysaccharide biosynthesis protein  19.79 
 
 		 438 aa  52.8  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0553833 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6750  polysaccharide biosynthesis protein  20.93 
 
 		 429 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2285  polysaccharide biosynthesis protein  24.75 
 
 		 449 aa  51.2  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.398242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4040  polysaccharide biosynthesis protein  24.16 
 
 		 444 aa  50.4  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.519664  normal  0.589796 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1809  polysaccharide biosynthesis protein  22.55 
 
 		 553 aa  49.3  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1844  polysaccharide biosynthesis protein  22.55 
 
 		 553 aa  49.3  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  22.96 
 
 		 449 aa  49.3  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1959  polysaccharide biosynthesis protein  25.76 
 
 		 451 aa  49.3  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0744  polysaccharide biosynthesis protein  22.69 
 
 		 436 aa  47.8  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.923042  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0629  lipopolysaccharide/O-antigen transporter, putative  21.7 
 
 		 467 aa  47  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  23.56 
 
 		 477 aa  47  0.0007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1071  polysaccharide biosynthesis protein  20.8 
 
 		 489 aa  47  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2062  polysaccharide biosynthesis protein  21.07 
 
 		 511 aa  47  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.445911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3064  polysaccharide biosynthesis protein  22.32 
 
 		 535 aa  46.2  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000038595  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2854  polysaccharide biosynthesis protein  20.71 
 
 		 423 aa  46.2  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.444695  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2972  polysaccharide biosynthesis protein  21.81 
 
 		 480 aa  45.8  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1439  polysaccharide biosynthesis protein  25.34 
 
 		 544 aa  45.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.30396  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  25.52 
 
 		 444 aa  45.8  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  26.46 
 
 		 512 aa  45.4  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1313  polysaccharide biosynthesis protein  22.62 
 
 		 553 aa  45.1  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.221909  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2229  polysaccharide transporter  24.5 
 
 		 488 aa  44.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0925528 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>