95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6400 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6400  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 431 aa  867    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.247838 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4360  polysaccharide biosynthesis protein  41.01 
 
 		 429 aa  340  4e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.86188 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1929  polysaccharide biosynthesis protein  30.56 
 
 		 424 aa  208  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.109004  normal  0.370568 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0849  polysaccharide biosynthesis protein  29.51 
 
 		 419 aa  192  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1620  polysaccharide biosynthesis protein  30.64 
 
 		 415 aa  186  6e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0681626  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2041  polysaccharide biosynthesis protein  30.02 
 
 		 415 aa  177  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0334353  normal  0.0804458 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1405  polysaccharide biosynthesis protein  34.8 
 
 		 418 aa  177  4e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000283826  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4166  polysaccharide biosynthesis protein  28.29 
 
 		 417 aa  166  8e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507145  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4200  polysaccharide biosynthesis protein  28.29 
 
 		 417 aa  166  8e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.404926 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3316  polysaccharide biosynthesis protein  28.29 
 
 		 417 aa  166  8e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0788043  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02920  O-antigen transporter  29.45 
 
 		 416 aa  165  1.0000000000000001e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00862586  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0627  polysaccharide biosynthesis family protein  25.78 
 
 		 422 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0642  polysaccharide transporter  25.78 
 
 		 422 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.21935  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0806  polysaccharide biosynthesis family protein  25.78 
 
 		 422 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2209  polysaccharide transporter  25.78 
 
 		 422 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6729  polysaccharide biosynthesis protein  27.43 
 
 		 415 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2875  polysaccharide transporter  25.78 
 
 		 422 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0027  polysaccharide biosynthesis family protein  25.78 
 
 		 422 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342295  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2497  polysaccharide transporter  25.78 
 
 		 422 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.547808  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1081  polysaccharide biosynthesis protein  28.64 
 
 		 421 aa  163  7e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0520  polysaccharide biosynthesis family protein  25.92 
 
 		 422 aa  163  7e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.203953  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4403  polysaccharide biosynthesis protein  28.99 
 
 		 417 aa  161  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.279052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2025  polysaccharide biosynthesis protein  29.02 
 
 		 424 aa  162  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.997214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3618  polysaccharide biosynthesis protein  27.72 
 
 		 419 aa  157  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.180964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4093  polysaccharide biosynthesis protein  27.72 
 
 		 419 aa  156  7e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1820  polysaccharide biosynthesis protein  27.32 
 
 		 418 aa  137  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.482229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0699  hypothetical protein  24.94 
 
 		 422 aa  129  8.000000000000001e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.786722 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2745  polysaccharide biosynthesis protein  31.13 
 
 		 412 aa  126  6e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1057  PST family polysaccharide transporter  25.88 
 
 		 471 aa  121  3e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.140128  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1104  polysaccharide biosynthesis protein  27.52 
 
 		 429 aa  120  3.9999999999999996e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0573  polysaccharide biosynthesis protein  25.61 
 
 		 477 aa  119  7.999999999999999e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000747167  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2910  polysaccharide biosynthesis protein  25.31 
 
 		 485 aa  117  5e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1197  Wzx  26.04 
 
 		 405 aa  114  3e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.905565  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6018  polysaccharide biosynthesis protein  23.73 
 
 		 433 aa  114  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.203106 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1407  PST family polysaccharide transporter  27.18 
 
 		 481 aa  108  3e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3697  polysaccharide biosynthesis protein  24.26 
 
 		 443 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1353  polysaccharide biosynthesis protein  24.76 
 
 		 486 aa  105  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1412  polysaccharide biosynthesis protein  25.39 
 
 		 474 aa  105  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0582  polysaccharide biosynthesis protein  23.91 
 
 		 406 aa  105  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224366  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2253  lipopolysaccharide (O-antigen)exporter  22.76 
 
 		 444 aa  105  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1371  polysaccharide biosynthesis protein  23.86 
 
 		 472 aa  101  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5060  polysaccharide biosynthesis protein  27.44 
 
 		 478 aa  99.8  8e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3041  polysaccharide biosynthesis protein  25.45 
 
 		 471 aa  99.8  8e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0123  polysaccharide biosynthesis protein  24.01 
 
 		 476 aa  99  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.281108  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0118  polysaccharide biosynthesis protein  24.01 
 
 		 476 aa  99  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0224366  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1142  PST family polysaccharide transporter  24.54 
 
 		 475 aa  99.4  1e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000134656  hitchhiker  0.0000175319 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0220  PST family polysaccharide transporter  25.53 
 
 		 472 aa  95.5  2e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1496  PST family polysaccharide transporter  23.78 
 
 		 484 aa  94.7  3e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.104259  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2419  polysaccharide biosynthesis protein  27.99 
 
 		 431 aa  93.2  7e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0814087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2652  polysaccharide biosynthesis protein  26.04 
 
 		 426 aa  90.1  7e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0561066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0604  polysaccharide biosynthesis protein  23.9 
 
 		 483 aa  87  7e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000572815  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0464  polysaccharide transporter protein, putative  23.35 
 
 		 486 aa  86.3  9e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000125112  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12370  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  24.38 
 
 		 424 aa  85.9  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1606  polysaccharide biosynthesis protein  24.2 
 
 		 412 aa  85.1  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0714758  normal  0.23948 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2854  polysaccharide biosynthesis protein  24.58 
 
 		 423 aa  84.3  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.444695  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1369  polysaccharide biosynthesis protein  25.66 
 
 		 416 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.52788  normal  0.0165485 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3729  polysaccharide biosynthesis protein  22.96 
 
 		 438 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0553833 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1522  PST family polysaccharide transporter  21.94 
 
 		 478 aa  73.2  0.000000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00741299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5222  polysaccharide biosynthesis protein  24.79 
 
 		 484 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0590  polysaccharide biosynthesis protein, putative  24.89 
 
 		 483 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000415804  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5560  polysaccharide biosynthesis protein, putative  24.23 
 
 		 484 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  21.97 
 
 		 449 aa  64.3  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2062  polysaccharide biosynthesis protein  20.9 
 
 		 511 aa  62.4  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.445911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0391  polysaccharide biosynthesis protein  23.59 
 
 		 476 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5305  polysaccharide biosynthesis protein  22.51 
 
 		 502 aa  55.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6750  polysaccharide biosynthesis protein  21.64 
 
 		 429 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3458  polysaccharide biosynthesis protein  23.46 
 
 		 427 aa  55.5  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  23.38 
 
 		 477 aa  54.7  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4497  polysaccharide biosynthesis protein  22.97 
 
 		 472 aa  52.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5123  spore cortex biosynthesis protein  26.62 
 
 		 484 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151446  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5279  polysaccharide biosynthesis protein  26.62 
 
 		 484 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0394078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5676  polysaccharide biosynthesis protein  26.62 
 
 		 484 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5522  polysaccharide synthase family protein  26.62 
 
 		 484 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1675  polysaccharide biosynthesis protein  20.53 
 
 		 430 aa  52  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0104334  normal  0.413628 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2419  polysaccharide biosynthesis protein  24.14 
 
 		 403 aa  51.6  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.182005 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0028  polysaccharide biosynthesis protein  24.68 
 
 		 484 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1384  polysaccharide biosynthesis protein  20.67 
 
 		 440 aa  51.6  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  20 
 
 		 444 aa  50.8  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  19.32 
 
 		 444 aa  49.3  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0727  polysaccharide biosynthesis protein  22.96 
 
 		 478 aa  48.5  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.207142  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1361  polysaccharide biosynthesis protein  26.24 
 
 		 413 aa  46.6  0.0009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483225  unclonable  0.0000000256808 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1033  polysaccharide biosynthesis protein  20.53 
 
 		 412 aa  45.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0437322  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2950  glycosyl transferase group 1  28.24 
 
 		 899 aa  45.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0040  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 435 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000125854  normal  0.0319641 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1120  polysaccharide biosynthesis protein  23.53 
 
 		 478 aa  45.1  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77221  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0234  lipopolysaccharide O-side chain biosynthesis protein (O-antigen transpoter)  23.55 
 
 		 476 aa  45.8  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00421263  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1078  polysaccharide biosynthesis protein  24.04 
 
 		 424 aa  44.7  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3355  polysaccharide biosynthesis protein  26.77 
 
 		 423 aa  45.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  23.5 
 
 		 444 aa  44.7  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0698  polysaccharide biosynthesis protein  26.89 
 
 		 449 aa  43.9  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0788223  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0457  polysaccharide biosynthesis protein  26.02 
 
 		 488 aa  43.9  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0665  polysaccharide biosynthesis protein  19.9 
 
 		 426 aa  43.5  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0691  polysaccharide biosynthesis protein  21.49 
 
 		 502 aa  43.5  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2229  polysaccharide transporter  34.43 
 
 		 488 aa  43.1  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0925528 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1828  polysaccharide biosynthesis protein  24.55 
 
 		 529 aa  43.1  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>