67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I0520 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009080  BMA10247_2497  polysaccharide transporter  96.45 
 
 
422 aa  804    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.547808  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0027  polysaccharide biosynthesis family protein  96.45 
 
 
422 aa  804    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342295  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0806  polysaccharide biosynthesis family protein  96.68 
 
 
422 aa  805    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0642  polysaccharide transporter  96.68 
 
 
422 aa  805    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.21935  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0520  polysaccharide biosynthesis family protein  100 
 
 
422 aa  834    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.203953  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0627  polysaccharide biosynthesis family protein  96.68 
 
 
422 aa  805    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2209  polysaccharide transporter  96.45 
 
 
422 aa  804    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2875  polysaccharide transporter  96.45 
 
 
422 aa  804    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4403  polysaccharide biosynthesis protein  67.95 
 
 
417 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.279052  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4200  polysaccharide biosynthesis protein  70.49 
 
 
417 aa  559  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.404926 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3316  polysaccharide biosynthesis protein  70.49 
 
 
417 aa  559  1e-158  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0788043  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4166  polysaccharide biosynthesis protein  70.49 
 
 
417 aa  559  1e-158  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507145  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4093  polysaccharide biosynthesis protein  69.54 
 
 
419 aa  550  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3618  polysaccharide biosynthesis protein  68.82 
 
 
419 aa  545  1e-154  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.180964  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1820  polysaccharide biosynthesis protein  69.86 
 
 
418 aa  502  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.482229  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6729  polysaccharide biosynthesis protein  53.92 
 
 
415 aa  438  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0849  polysaccharide biosynthesis protein  37.59 
 
 
419 aa  280  3e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2041  polysaccharide biosynthesis protein  32.68 
 
 
415 aa  250  4e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0334353  normal  0.0804458 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1929  polysaccharide biosynthesis protein  28.08 
 
 
424 aa  203  5e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.109004  normal  0.370568 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1620  polysaccharide biosynthesis protein  30.05 
 
 
415 aa  190  5e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0681626  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2025  polysaccharide biosynthesis protein  30.25 
 
 
424 aa  178  2e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.997214  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6400  polysaccharide biosynthesis protein  25.54 
 
 
431 aa  161  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.247838 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1405  polysaccharide biosynthesis protein  30.6 
 
 
418 aa  154  4e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000283826  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6018  polysaccharide biosynthesis protein  27.96 
 
 
433 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.203106 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4360  polysaccharide biosynthesis protein  24.69 
 
 
429 aa  147  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.86188 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2253  lipopolysaccharide (O-antigen)exporter  26.46 
 
 
444 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2745  polysaccharide biosynthesis protein  28.97 
 
 
412 aa  138  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02920  O-antigen transporter  24.88 
 
 
416 aa  133  6e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00862586  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3697  polysaccharide biosynthesis protein  28.54 
 
 
443 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0699  hypothetical protein  25.38 
 
 
422 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.786722 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1606  polysaccharide biosynthesis protein  26.23 
 
 
412 aa  126  6e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0714758  normal  0.23948 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1197  Wzx  25.5 
 
 
405 aa  125  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.905565  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1353  polysaccharide biosynthesis protein  24.01 
 
 
486 aa  119  7e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1496  PST family polysaccharide transporter  24.81 
 
 
484 aa  117  5e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.104259  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1142  PST family polysaccharide transporter  22.89 
 
 
475 aa  112  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000134656  hitchhiker  0.0000175319 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1081  polysaccharide biosynthesis protein  22.88 
 
 
421 aa  106  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1104  polysaccharide biosynthesis protein  25.55 
 
 
429 aa  106  8e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0220  PST family polysaccharide transporter  25.87 
 
 
472 aa  105  1e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1057  PST family polysaccharide transporter  22.38 
 
 
471 aa  103  6e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.140128  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2854  polysaccharide biosynthesis protein  23.6 
 
 
423 aa  101  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.444695  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0123  polysaccharide biosynthesis protein  22.19 
 
 
476 aa  100  5e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.281108  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0118  polysaccharide biosynthesis protein  22.19 
 
 
476 aa  100  5e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0224366  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2910  polysaccharide biosynthesis protein  26.6 
 
 
485 aa  100  6e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0573  polysaccharide biosynthesis protein  20.44 
 
 
477 aa  99.8  8e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000747167  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2652  polysaccharide biosynthesis protein  25.59 
 
 
426 aa  97.4  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0561066  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23390  putative polysaccharide biosynthesis protein  28.17 
 
 
420 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000307585  hitchhiker  0.00805893 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3041  polysaccharide biosynthesis protein  21.62 
 
 
471 aa  93.6  7e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12370  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  24.47 
 
 
424 aa  92.4  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1407  PST family polysaccharide transporter  21.53 
 
 
481 aa  89.4  1e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1371  polysaccharide biosynthesis protein  21.09 
 
 
472 aa  88.6  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1412  polysaccharide biosynthesis protein  22.73 
 
 
474 aa  87.8  3e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5060  polysaccharide biosynthesis protein  23.2 
 
 
478 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0582  polysaccharide biosynthesis protein  25.18 
 
 
406 aa  77.8  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224366  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2419  polysaccharide biosynthesis protein  24.39 
 
 
431 aa  74.3  0.000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0814087  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3458  polysaccharide biosynthesis protein  26.79 
 
 
427 aa  71.2  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3729  polysaccharide biosynthesis protein  24.81 
 
 
438 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0553833 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1522  PST family polysaccharide transporter  21.88 
 
 
478 aa  68.2  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00741299  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1675  polysaccharide biosynthesis protein  23.51 
 
 
430 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0104334  normal  0.413628 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1369  polysaccharide biosynthesis protein  24.7 
 
 
416 aa  57  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.52788  normal  0.0165485 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0604  polysaccharide biosynthesis protein  19.31 
 
 
483 aa  57  0.0000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000572815  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6750  polysaccharide biosynthesis protein  23.4 
 
 
429 aa  57  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0464  polysaccharide transporter protein, putative  19.31 
 
 
486 aa  55.8  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000125112  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5560  polysaccharide biosynthesis protein, putative  20.1 
 
 
484 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1033  polysaccharide biosynthesis protein  19.85 
 
 
412 aa  51.2  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0437322  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5222  polysaccharide biosynthesis protein  19.32 
 
 
484 aa  48.9  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3183  polysaccharide biosynthesis protein  24.06 
 
 
424 aa  48.9  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1078  polysaccharide biosynthesis protein  23.31 
 
 
424 aa  43.1  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>