72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1078 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1078  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 424 aa  841    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3183  polysaccharide biosynthesis protein  87.26 
 
 		 424 aa  729    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2586  polysaccharide biosynthesis protein  43.37 
 
 		 411 aa  291  1e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0344  polysaccharide biosynthesis protein  32.9 
 
 		 430 aa  161  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0233913 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4442  polysaccharide biosynthesis protein  28.54 
 
 		 398 aa  157  4e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3170  polysaccharide biosynthesis protein  28.71 
 
 		 415 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4351  polysaccharide biosynthesis protein  24.77 
 
 		 435 aa  89.7  9e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0736127  normal  0.47272 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2872  cell-surface polysaccharide exporter protein PST family  23.94 
 
 		 437 aa  87.8  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0386  polysaccharide biosynthesis protein  22.47 
 
 		 427 aa  82.8  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0391  polysaccharide biosynthesis protein  22.52 
 
 		 476 aa  79.7  0.00000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4497  polysaccharide biosynthesis protein  26.6 
 
 		 472 aa  75.1  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0234  lipopolysaccharide O-side chain biosynthesis protein (O-antigen transpoter)  25.43 
 
 		 476 aa  71.6  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00421263  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4403  polysaccharide biosynthesis protein  24.67 
 
 		 417 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.279052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0727  polysaccharide biosynthesis protein  25.17 
 
 		 478 aa  64.3  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.207142  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2504  polysaccharide biosynthesis protein  25.19 
 
 		 486 aa  63.9  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6729  polysaccharide biosynthesis protein  25.63 
 
 		 415 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  27.95 
 
 		 483 aa  63.9  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1384  polysaccharide biosynthesis protein  24.06 
 
 		 440 aa  62.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  22.11 
 
 		 477 aa  61.2  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  24.37 
 
 		 490 aa  60.1  0.00000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0929  polysaccharide biosynthesis protein  24.49 
 
 		 489 aa  59.7  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1044  polysaccharide biosynthesis protein  26.79 
 
 		 440 aa  56.6  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.041441  hitchhiker  0.00655602 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4200  polysaccharide biosynthesis protein  25.52 
 
 		 417 aa  54.3  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.404926 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3316  polysaccharide biosynthesis protein  25.52 
 
 		 417 aa  54.3  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0788043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4166  polysaccharide biosynthesis protein  25.52 
 
 		 417 aa  54.3  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507145  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0172  polysaccharide biosynthesis protein  23.3 
 
 		 433 aa  53.9  0.000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.663645  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1361  polysaccharide biosynthesis protein  23.2 
 
 		 413 aa  54.3  0.000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483225  unclonable  0.0000000256808 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  24.34 
 
 		 444 aa  53.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1759  polysaccharide biosynthesis protein  22.45 
 
 		 423 aa  51.6  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2892  polysaccharide biosynthesis protein  24.26 
 
 		 429 aa  51.6  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0849  polysaccharide biosynthesis protein  24.74 
 
 		 419 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2602  polysaccharide biosynthesis protein  25.53 
 
 		 448 aa  50.8  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3797  polysaccharide biosynthesis protein  25.13 
 
 		 461 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.683173  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  24 
 
 		 444 aa  50.1  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0627  polysaccharide biosynthesis family protein  24.06 
 
 		 422 aa  50.1  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0642  polysaccharide transporter  24.06 
 
 		 422 aa  50.1  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.21935  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0806  polysaccharide biosynthesis family protein  24.06 
 
 		 422 aa  50.1  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0027  polysaccharide biosynthesis family protein  23.19 
 
 		 422 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342295  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0024  polysaccharide biosynthesis protein  22.3 
 
 		 429 aa  48.9  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.014677  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4093  polysaccharide biosynthesis protein  23.38 
 
 		 419 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2497  polysaccharide transporter  23.19 
 
 		 422 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.547808  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2209  polysaccharide transporter  23.19 
 
 		 422 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2875  polysaccharide transporter  23.19 
 
 		 422 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  22.66 
 
 		 449 aa  48.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0588  polysaccharide biosynthesis protein  23 
 
 		 410 aa  47.8  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0284636  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3618  polysaccharide biosynthesis protein  23.97 
 
 		 419 aa  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.180964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2176  exporter of O-antigen and teichoic acid  23.77 
 
 		 456 aa  47.8  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.311164 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1407  PST family polysaccharide transporter  24.24 
 
 		 481 aa  47.8  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0520  polysaccharide biosynthesis family protein  23.31 
 
 		 422 aa  47.4  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.203953  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0704  polysaccharide biosynthesis protein  21.33 
 
 		 423 aa  47.4  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.786824  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1959  polysaccharide biosynthesis protein  21.67 
 
 		 451 aa  47  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3355  polysaccharide biosynthesis protein  22.96 
 
 		 423 aa  46.6  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1162  polysaccharide biosynthesis protein CpsL  27.5 
 
 		 466 aa  46.6  0.0009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.333664  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1301  polysaccharide biosynthesis protein  25.12 
 
 		 483 aa  45.8  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1236  polysaccharide biosynthesis protein  23.18 
 
 		 482 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286439 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3948  polysaccharide biosynthesis protein  19.67 
 
 		 473 aa  46.2  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1766  polysaccharide biosynthesis protein  27.27 
 
 		 441 aa  45.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1307  polysaccharide biosynthesis protein  25.12 
 
 		 483 aa  45.8  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1649  polysaccharide synthase family protein  21.2 
 
 		 478 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.44301  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5107  oligosaccharide translocase  20.98 
 
 		 483 aa  44.3  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  23.94 
 
 		 444 aa  43.9  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1820  polysaccharide biosynthesis protein  24.08 
 
 		 418 aa  43.9  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.482229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6018  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 433 aa  43.9  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.203106 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4242  hypothetical protein  24.62 
 
 		 406 aa  43.9  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476664  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0144  polysaccharide biosynthesis protein  21.23 
 
 		 423 aa  43.5  0.006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.232636  normal  0.0172475 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2748  polysaccharide biosynthesis protein  22.43 
 
 		 526 aa  43.5  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.327125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2253  lipopolysaccharide (O-antigen)exporter  26.36 
 
 		 444 aa  43.5  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0665  polysaccharide biosynthesis protein  22.31 
 
 		 426 aa  43.9  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0243  hypothetical protein  24.48 
 
 		 422 aa  43.5  0.008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.436053  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1796  polysaccharide biosynthesis protein  21.84 
 
 		 453 aa  43.1  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5553  oligosaccharide translocase  20.33 
 
 		 471 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2025  polysaccharide biosynthesis protein  26.18 
 
 		 424 aa  43.1  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.997214  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>