17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0386 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_0386  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
427 aa  849    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4351  polysaccharide biosynthesis protein  56.37 
 
 
435 aa  437  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0736127  normal  0.47272 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2872  cell-surface polysaccharide exporter protein PST family  52.9 
 
 
437 aa  401  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2586  polysaccharide biosynthesis protein  27.51 
 
 
411 aa  90.9  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3183  polysaccharide biosynthesis protein  25.07 
 
 
424 aa  86.7  7e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1078  polysaccharide biosynthesis protein  23.95 
 
 
424 aa  84  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4442  polysaccharide biosynthesis protein  24.07 
 
 
398 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0344  polysaccharide biosynthesis protein  22.38 
 
 
430 aa  54.7  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0233913 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0457  polysaccharide biosynthesis protein  24.04 
 
 
488 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1081  polysaccharide biosynthesis protein  28.57 
 
 
421 aa  49.3  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0796  polysaccharide biosynthesis protein  25.29 
 
 
482 aa  47.8  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.733222  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4228  polysaccharide biosynthesis protein  23.98 
 
 
486 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2025  polysaccharide biosynthesis protein  27.52 
 
 
424 aa  47  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.997214  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1384  polysaccharide biosynthesis protein  24.31 
 
 
440 aa  46.6  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  27.5 
 
 
483 aa  44.7  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2184  putative polysaccharide biosynthesis protein  24.92 
 
 
476 aa  44.3  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000339542  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1649  polysaccharide synthase family protein  20.33 
 
 
478 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.44301  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>