46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2586 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2586  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
411 aa  806    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3183  polysaccharide biosynthesis protein  43.94 
 
 
424 aa  319  7e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1078  polysaccharide biosynthesis protein  43.37 
 
 
424 aa  316  6e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0344  polysaccharide biosynthesis protein  34.37 
 
 
430 aa  172  6.999999999999999e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0233913 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4442  polysaccharide biosynthesis protein  31.55 
 
 
398 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3170  polysaccharide biosynthesis protein  28.76 
 
 
415 aa  106  6e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0386  polysaccharide biosynthesis protein  26.39 
 
 
427 aa  101  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0929  polysaccharide biosynthesis protein  26.9 
 
 
489 aa  84.7  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2872  cell-surface polysaccharide exporter protein PST family  24.87 
 
 
437 aa  84.7  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4351  polysaccharide biosynthesis protein  27.34 
 
 
435 aa  82.8  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0736127  normal  0.47272 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0391  polysaccharide biosynthesis protein  22.8 
 
 
476 aa  80.9  0.00000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  23.94 
 
 
483 aa  69.7  0.00000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 
490 aa  69.3  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  24.24 
 
 
477 aa  63.2  0.000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0234  lipopolysaccharide O-side chain biosynthesis protein (O-antigen transpoter)  24.68 
 
 
476 aa  58.9  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00421263  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1361  polysaccharide biosynthesis protein  23.66 
 
 
413 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483225  unclonable  0.0000000256808 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0849  polysaccharide biosynthesis protein  25.31 
 
 
419 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5611  oligosaccharide translocase  23.53 
 
 
470 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5107  oligosaccharide translocase  22.64 
 
 
483 aa  53.5  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0665  polysaccharide biosynthesis protein  22.27 
 
 
426 aa  52.8  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3948  polysaccharide biosynthesis protein  23.59 
 
 
473 aa  51.6  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  23.63 
 
 
444 aa  51.2  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1384  polysaccharide biosynthesis protein  28.4 
 
 
440 aa  51.2  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4497  polysaccharide biosynthesis protein  22.87 
 
 
472 aa  50.4  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3618  polysaccharide biosynthesis protein  24.38 
 
 
419 aa  49.7  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.180964  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2064  polysaccharide biosynthesis protein  27.62 
 
 
468 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1820  polysaccharide biosynthesis protein  26.11 
 
 
418 aa  49.3  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.482229  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4093  polysaccharide biosynthesis protein  24.66 
 
 
419 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  22.28 
 
 
423 aa  48.9  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0588  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 
410 aa  48.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0284636  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5553  oligosaccharide translocase  22.88 
 
 
471 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1467  polysaccharide biosynthesis protein  30.29 
 
 
484 aa  47  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000343252  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1681  polysaccharide synthase family protein  30.29 
 
 
478 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1495  polysaccharide biosynthesis protein  30.29 
 
 
484 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5396  oligosaccharide translocase  23.56 
 
 
473 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3041  polysaccharide biosynthesis protein  21.39 
 
 
471 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1613  polysaccharide biosynthesis protein  30.29 
 
 
478 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.294674  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  25.83 
 
 
444 aa  45.8  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0243  hypothetical protein  23.39 
 
 
422 aa  45.1  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.436053  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  21.82 
 
 
449 aa  44.7  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0220  hypothetical protein  23.39 
 
 
422 aa  45.1  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1649  polysaccharide synthase family protein  31.82 
 
 
478 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.44301  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1828  polysaccharide biosynthesis protein  31.2 
 
 
529 aa  44.3  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3797  polysaccharide biosynthesis protein  26.47 
 
 
461 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.683173  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1606  polysaccharide biosynthesis protein  22.17 
 
 
412 aa  43.9  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0714758  normal  0.23948 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0744  polysaccharide biosynthesis protein  22.25 
 
 
436 aa  43.5  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.923042  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>