19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2064 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_2064  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 468 aa  936    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2260  polysaccharide biosynthesis protein  37.2 
 
 		 482 aa  324  2e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0727  polysaccharide biosynthesis protein  19.35 
 
 		 478 aa  72.8  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.207142  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0234  lipopolysaccharide O-side chain biosynthesis protein (O-antigen transpoter)  23.74 
 
 		 476 aa  53.9  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00421263  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0665  polysaccharide biosynthesis protein  23.27 
 
 		 426 aa  53.1  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1384  polysaccharide biosynthesis protein  23.75 
 
 		 440 aa  50.1  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1828  polysaccharide biosynthesis protein  27.17 
 
 		 529 aa  50.1  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0457  polysaccharide biosynthesis protein  23.72 
 
 		 488 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1965  polysaccharide biosynthesis protein  26.96 
 
 		 463 aa  47.8  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0295315 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  28.02 
 
 		 490 aa  45.4  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0391  polysaccharide biosynthesis protein  18.23 
 
 		 476 aa  45.8  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1069  polysaccharide biosynthesis protein  23.34 
 
 		 488 aa  45.1  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0264507  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2748  polysaccharide biosynthesis protein  24.19 
 
 		 526 aa  44.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.327125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  19.2 
 
 		 477 aa  45.1  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0869  polysaccharide biosynthesis protein  23.53 
 
 		 509 aa  44.3  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0469  polysaccharide biosynthesis protein  18.64 
 
 		 486 aa  43.5  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00384316  hitchhiker  0.000182088 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3876  polysaccharide biosynthesis protein  23.5 
 
 		 427 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1735  PST family polysaccharide transporter  20.98 
 
 		 479 aa  43.5  0.008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3790  polysaccharide biosynthesis protein  23.37 
 
 		 1103 aa  43.1  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.500629 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>