127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0457 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4228  polysaccharide biosynthesis protein  90.25 
 
 		 486 aa  782    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0457  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 488 aa  933    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0796  polysaccharide biosynthesis protein  68.61 
 
 		 482 aa  604  1.0000000000000001e-171  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.733222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1828  polysaccharide biosynthesis protein  32.81 
 
 		 529 aa  157  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2748  polysaccharide biosynthesis protein  30.08 
 
 		 526 aa  143  6e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.327125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0391  polysaccharide biosynthesis protein  23.37 
 
 		 476 aa  134  5e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4125  polysaccharide biosynthesis protein  27.63 
 
 		 542 aa  116  7.999999999999999e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0921  polysaccharide biosynthesis protein  27.73 
 
 		 541 aa  105  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.190343 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  24.22 
 
 		 477 aa  104  3e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0727  polysaccharide biosynthesis protein  25.3 
 
 		 478 aa  96.7  8e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.207142  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0253  polysaccharide biosynthesis protein  22.64 
 
 		 435 aa  96.3  1e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000123579  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0234  lipopolysaccharide O-side chain biosynthesis protein (O-antigen transpoter)  24.67 
 
 		 476 aa  92  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00421263  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1069  polysaccharide biosynthesis protein  26.51 
 
 		 488 aa  87  7e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0264507  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  26.42 
 
 		 490 aa  83.2  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4497  polysaccharide biosynthesis protein  23.44 
 
 		 472 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5305  polysaccharide biosynthesis protein  26.94 
 
 		 502 aa  79  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2062  polysaccharide biosynthesis protein  22.82 
 
 		 511 aa  79  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.445911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1071  polysaccharide biosynthesis protein  26.56 
 
 		 489 aa  72.4  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  24.32 
 
 		 517 aa  70.5  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5611  oligosaccharide translocase  21.35 
 
 		 470 aa  70.5  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1963  colanic acid exporter  23.98 
 
 		 493 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5107  oligosaccharide translocase  22.73 
 
 		 483 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1274  polysaccharide export protein  26.65 
 
 		 399 aa  66.6  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212391 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4527  polysaccharide biosynthesis protein  24.56 
 
 		 514 aa  65.9  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0212681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1384  polysaccharide biosynthesis protein  25.54 
 
 		 440 aa  63.9  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2971  polysaccharide biosynthesis protein  22.92 
 
 		 475 aa  63.2  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.224966  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0665  polysaccharide biosynthesis protein  22.25 
 
 		 426 aa  63.2  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2504  polysaccharide biosynthesis protein  27.05 
 
 		 486 aa  62.4  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  22.96 
 
 		 483 aa  61.6  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0469  polysaccharide biosynthesis protein  23.83 
 
 		 486 aa  60.8  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00384316  hitchhiker  0.000182088 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0929  polysaccharide biosynthesis protein  23.7 
 
 		 489 aa  60.5  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2892  polysaccharide biosynthesis protein  25.73 
 
 		 429 aa  59.7  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0588  polysaccharide biosynthesis protein  25.67 
 
 		 410 aa  58.9  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0284636  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  21.52 
 
 		 490 aa  58.5  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1735  PST family polysaccharide transporter  25.32 
 
 		 479 aa  57.4  0.0000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3948  polysaccharide biosynthesis protein  21.91 
 
 		 473 aa  57.4  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  24.12 
 
 		 444 aa  57  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2770  polysaccharide biosynthesis protein  24.93 
 
 		 460 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0118  polysaccharide biosynthesis protein  23.48 
 
 		 476 aa  56.2  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0224366  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0123  polysaccharide biosynthesis protein  23.48 
 
 		 476 aa  56.2  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.281108  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  23.35 
 
 		 444 aa  56.2  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3876  polysaccharide biosynthesis protein  29.21 
 
 		 427 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1968  polysaccharide biosynthesis protein  24.64 
 
 		 477 aa  56.2  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.901691  hitchhiker  0.000000136517 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5560  polysaccharide biosynthesis protein, putative  23.93 
 
 		 484 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2260  polysaccharide biosynthesis protein  22.22 
 
 		 482 aa  55.5  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  22.25 
 
 		 444 aa  55.5  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0302  maturase-related protein  21.14 
 
 		 421 aa  54.3  0.000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1593  polysaccharide biosynthesis protein  22.58 
 
 		 504 aa  54.3  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5396  oligosaccharide translocase  21.24 
 
 		 473 aa  53.9  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5553  oligosaccharide translocase  20 
 
 		 471 aa  53.5  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1525  polysaccharide biosynthesis protein  26.63 
 
 		 475 aa  53.1  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1796  polysaccharide biosynthesis protein  26.06 
 
 		 453 aa  53.1  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5222  polysaccharide biosynthesis protein  21.99 
 
 		 484 aa  53.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4839  polysaccharide biosynthesis protein  21.47 
 
 		 465 aa  52.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.261545  normal  0.0682 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2285  polysaccharide biosynthesis protein  22.57 
 
 		 449 aa  52.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.398242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5503  polysaccharide biosynthesis protein  24.44 
 
 		 491 aa  52.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0743746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1608  polysaccharide biosynthesis protein  24.25 
 
 		 492 aa  52.8  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2184  putative polysaccharide biosynthesis protein  20.91 
 
 		 476 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000339542  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2910  polysaccharide biosynthesis protein  24.81 
 
 		 485 aa  52.4  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2947  polysaccharide biosynthesis protein  25.45 
 
 		 484 aa  52  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3355  polysaccharide biosynthesis protein  22.52 
 
 		 423 aa  51.6  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0582  polysaccharide biosynthesis protein  23.37 
 
 		 479 aa  51.2  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1959  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 451 aa  51.2  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0641  polysaccharide biosynthesis protein, putative  25.85 
 
 		 508 aa  51.2  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0506  polysaccharide biosynthesis protein  23.68 
 
 		 583 aa  50.8  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3041  polysaccharide biosynthesis protein  22.14 
 
 		 471 aa  50.8  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0823  polysaccharide biosynthesis protein  27.03 
 
 		 465 aa  50.8  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.110638  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2602  polysaccharide biosynthesis protein  22.68 
 
 		 448 aa  51.2  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3930  polysaccharide biosynthesis protein  23.15 
 
 		 480 aa  50.8  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2139  polysaccharide biosynthesis protein  22.49 
 
 		 482 aa  50.8  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00876576  normal  0.418146 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1044  polysaccharide biosynthesis protein  25.13 
 
 		 440 aa  50.4  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.041441  hitchhiker  0.00655602 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0174  colanic acid exporter  27.24 
 
 		 483 aa  50.4  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  0.572056 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  22.25 
 
 		 449 aa  50.4  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3147  polysaccharide biosynthesis protein  21.07 
 
 		 475 aa  49.7  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.875944  normal  0.24442 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1353  polysaccharide biosynthesis protein  21.19 
 
 		 486 aa  48.9  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1128  polysaccharide biosynthesis protein  24.69 
 
 		 547 aa  49.3  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1766  polysaccharide biosynthesis protein  30.13 
 
 		 441 aa  48.9  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1673  polysaccharide biosynthesis protein  23.48 
 
 		 487 aa  48.5  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2377  polysaccharide biosynthesis protein  24.71 
 
 		 486 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  24.23 
 
 		 488 aa  47.8  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0155  ATPase  22.89 
 
 		 483 aa  47.8  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2823  polysaccharide biosynthesis protein  25.98 
 
 		 472 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4201  polysaccharide biosynthesis protein  23.9 
 
 		 487 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1128  polysaccharide biosynthesis protein  28.23 
 
 		 508 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4040  polysaccharide biosynthesis protein  21.94 
 
 		 444 aa  47.8  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.519664  normal  0.589796 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0744  polysaccharide biosynthesis protein  32.32 
 
 		 436 aa  47.4  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.923042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2481  polysaccharide biosynthesis protein  25.3 
 
 		 477 aa  47.4  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206749  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2872  cell-surface polysaccharide exporter protein PST family  24.78 
 
 		 437 aa  47.4  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4554  polysaccharide biosynthesis protein  24.36 
 
 		 471 aa  47.4  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.184462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0177  polysaccharide biosynthesis protein  22.6 
 
 		 446 aa  47  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2137  polysaccharide biosynthesis protein  24.65 
 
 		 470 aa  47  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5279  polysaccharide biosynthesis protein  21.98 
 
 		 484 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0394078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5676  polysaccharide biosynthesis protein  21.98 
 
 		 484 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0483  polysaccharide biosynthesis protein  22.75 
 
 		 477 aa  46.6  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1637  polysaccharide biosynthesis protein  21.15 
 
 		 504 aa  46.6  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5522  polysaccharide synthase family protein  21.98 
 
 		 484 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0945  multi antimicrobial extrusion protein MatE  27.49 
 
 		 495 aa  46.6  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.903745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0344  polysaccharide biosynthesis protein  30.39 
 
 		 430 aa  45.8  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0233913 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0416  polysaccharide biosynthesis protein  27.44 
 
 		 506 aa  45.8  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.484223  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0061  polysaccharide biosynthesis protein  21.91 
 
 		 523 aa  45.8  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>