64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0469 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0469  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 486 aa  937    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00384316  hitchhiker  0.000182088 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0727  polysaccharide biosynthesis protein  24.34 
 
 		 478 aa  91.3  4e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.207142  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  21.47 
 
 		 477 aa  90.5  6e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0665  polysaccharide biosynthesis protein  24.43 
 
 		 426 aa  90.5  7e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0234  lipopolysaccharide O-side chain biosynthesis protein (O-antigen transpoter)  25.3 
 
 		 476 aa  85.9  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00421263  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1766  polysaccharide biosynthesis protein  26.22 
 
 		 441 aa  83.6  0.000000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  25.07 
 
 		 444 aa  80.5  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0391  polysaccharide biosynthesis protein  22.75 
 
 		 476 aa  75.1  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  32.07 
 
 		 449 aa  73.6  0.000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1384  polysaccharide biosynthesis protein  22.69 
 
 		 440 aa  72.4  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  23.93 
 
 		 444 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1236  polysaccharide biosynthesis protein  26.46 
 
 		 482 aa  69.3  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286439 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2602  polysaccharide biosynthesis protein  30.57 
 
 		 448 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  22.11 
 
 		 444 aa  67.8  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4040  polysaccharide biosynthesis protein  24.56 
 
 		 444 aa  67.4  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.519664  normal  0.589796 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2260  polysaccharide biosynthesis protein  21.38 
 
 		 482 aa  67  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0457  polysaccharide biosynthesis protein  23.83 
 
 		 488 aa  67  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4497  polysaccharide biosynthesis protein  20 
 
 		 472 aa  65.9  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2285  polysaccharide biosynthesis protein  23.46 
 
 		 449 aa  65.1  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.398242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1959  polysaccharide biosynthesis protein  26.34 
 
 		 451 aa  64.3  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2176  exporter of O-antigen and teichoic acid  23.4 
 
 		 456 aa  62.8  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.311164 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3189  polysaccharide biosynthesis protein  23.47 
 
 		 446 aa  62.4  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.27784  hitchhiker  0.00540344 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4228  polysaccharide biosynthesis protein  24.57 
 
 		 486 aa  62  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0796  polysaccharide biosynthesis protein  24.22 
 
 		 482 aa  60.8  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.733222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0588  polysaccharide biosynthesis protein  24.68 
 
 		 410 aa  60.8  0.00000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0284636  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0253  polysaccharide biosynthesis protein  23.37 
 
 		 435 aa  59.3  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000123579  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3041  polysaccharide biosynthesis protein  20.79 
 
 		 471 aa  59.3  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0744  polysaccharide biosynthesis protein  24.03 
 
 		 436 aa  59.3  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.923042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4839  polysaccharide biosynthesis protein  21.86 
 
 		 465 aa  55.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.261545  normal  0.0682 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3797  polysaccharide biosynthesis protein  24.1 
 
 		 461 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.683173  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2062  polysaccharide biosynthesis protein  21.33 
 
 		 511 aa  55.1  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.445911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6501  Membrane protein involved in the export of O- antigen and teichoic acid-like protein  24.86 
 
 		 448 aa  53.9  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  25.1 
 
 		 517 aa  53.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0177  polysaccharide biosynthesis protein  26.18 
 
 		 446 aa  52.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1361  polysaccharide biosynthesis protein  25.74 
 
 		 413 aa  52.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483225  unclonable  0.0000000256808 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4091  polysaccharide biosynthesis protein  22.89 
 
 		 430 aa  51.6  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2253  lipopolysaccharide (O-antigen)exporter  24.8 
 
 		 444 aa  50.8  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3876  polysaccharide biosynthesis protein  23.3 
 
 		 427 aa  50.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  21.83 
 
 		 423 aa  50.4  0.00008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0506  polysaccharide biosynthesis protein  27.8 
 
 		 583 aa  48.9  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1846  polysaccharide biosynthesis protein  23.05 
 
 		 433 aa  48.9  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0929  polysaccharide biosynthesis protein  21.91 
 
 		 489 aa  48.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4166  polysaccharide biosynthesis protein  27.27 
 
 		 417 aa  47.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507145  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4200  polysaccharide biosynthesis protein  27.27 
 
 		 417 aa  47.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.404926 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3316  polysaccharide biosynthesis protein  27.27 
 
 		 417 aa  47.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0788043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  23.55 
 
 		 490 aa  48.1  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0849  polysaccharide biosynthesis protein  24.6 
 
 		 419 aa  47.8  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1044  polysaccharide biosynthesis protein  27.03 
 
 		 440 aa  47.8  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.041441  hitchhiker  0.00655602 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2064  polysaccharide biosynthesis protein  18.92 
 
 		 468 aa  47.8  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6018  polysaccharide biosynthesis protein  24.9 
 
 		 433 aa  47  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.203106 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5305  polysaccharide biosynthesis protein  25.58 
 
 		 502 aa  47  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2804  stage V sporulation protein B  24.15 
 
 		 510 aa  46.6  0.0009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2139  polysaccharide biosynthesis protein  21.38 
 
 		 482 aa  46.6  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00876576  normal  0.418146 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0483  polysaccharide biosynthesis protein  28.18 
 
 		 477 aa  45.4  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3832  polysaccharide biosynthesis protein  32.22 
 
 		 471 aa  45.8  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.431872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2457  polysaccharide biosynthesis protein  24.74 
 
 		 514 aa  45.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.267844  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2507  membrane protein  21.18 
 
 		 421 aa  45.1  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4403  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 417 aa  45.1  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.279052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3541  polysaccharide biosynthesis protein  32.53 
 
 		 474 aa  43.9  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1522  PST family polysaccharide transporter  23.17 
 
 		 478 aa  44.3  0.006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00741299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4019  polysaccharide biosynthesis protein  27.75 
 
 		 483 aa  43.9  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2021  polysaccharide biosynthesis protein  20.1 
 
 		 428 aa  43.5  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1920  polysaccharide biosynthesis protein  26.85 
 
 		 484 aa  43.5  0.009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0707623  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4442  polysaccharide biosynthesis protein  22.55 
 
 		 398 aa  43.5  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>