66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_A2875 on replicon NC_008785
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA0027  polysaccharide biosynthesis family protein  100 
 
 
422 aa  837    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342295  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0806  polysaccharide biosynthesis family protein  99.76 
 
 
422 aa  835    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0520  polysaccharide biosynthesis family protein  96.84 
 
 
422 aa  786    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.203953  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2497  polysaccharide transporter  100 
 
 
422 aa  837    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.547808  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0642  polysaccharide transporter  99.76 
 
 
422 aa  835    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.21935  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0627  polysaccharide biosynthesis family protein  99.76 
 
 
422 aa  835    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2209  polysaccharide transporter  100 
 
 
422 aa  837    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2875  polysaccharide transporter  100 
 
 
422 aa  837    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3316  polysaccharide biosynthesis protein  70.98 
 
 
417 aa  564  1e-160  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0788043  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4403  polysaccharide biosynthesis protein  67.95 
 
 
417 aa  567  1e-160  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.279052  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4166  polysaccharide biosynthesis protein  70.98 
 
 
417 aa  564  1e-160  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507145  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4200  polysaccharide biosynthesis protein  70.98 
 
 
417 aa  564  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.404926 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4093  polysaccharide biosynthesis protein  69.06 
 
 
419 aa  542  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3618  polysaccharide biosynthesis protein  69.71 
 
 
419 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.180964  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1820  polysaccharide biosynthesis protein  69.59 
 
 
418 aa  494  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.482229  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6729  polysaccharide biosynthesis protein  54.17 
 
 
415 aa  434  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0849  polysaccharide biosynthesis protein  37.62 
 
 
419 aa  277  3e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2041  polysaccharide biosynthesis protein  33.17 
 
 
415 aa  254  2.0000000000000002e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0334353  normal  0.0804458 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1929  polysaccharide biosynthesis protein  27.09 
 
 
424 aa  191  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.109004  normal  0.370568 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1620  polysaccharide biosynthesis protein  30.3 
 
 
415 aa  189  1e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0681626  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2025  polysaccharide biosynthesis protein  29.1 
 
 
424 aa  172  1e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.997214  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6400  polysaccharide biosynthesis protein  25.78 
 
 
431 aa  159  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.247838 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1405  polysaccharide biosynthesis protein  30.97 
 
 
418 aa  150  3e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000283826  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6018  polysaccharide biosynthesis protein  29.32 
 
 
433 aa  150  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.203106 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4360  polysaccharide biosynthesis protein  24.19 
 
 
429 aa  140  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.86188 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2745  polysaccharide biosynthesis protein  28.69 
 
 
412 aa  137  5e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2253  lipopolysaccharide (O-antigen)exporter  26.21 
 
 
444 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3697  polysaccharide biosynthesis protein  27.61 
 
 
443 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02920  O-antigen transporter  24.69 
 
 
416 aa  131  2.0000000000000002e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00862586  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1197  Wzx  26.25 
 
 
405 aa  129  7.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.905565  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0699  hypothetical protein  24.62 
 
 
422 aa  125  2e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.786722 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1353  polysaccharide biosynthesis protein  23.62 
 
 
486 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1606  polysaccharide biosynthesis protein  27.19 
 
 
412 aa  115  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0714758  normal  0.23948 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1496  PST family polysaccharide transporter  24.56 
 
 
484 aa  113  7.000000000000001e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.104259  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1057  PST family polysaccharide transporter  23.41 
 
 
471 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.140128  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1142  PST family polysaccharide transporter  23.13 
 
 
475 aa  112  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000134656  hitchhiker  0.0000175319 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1081  polysaccharide biosynthesis protein  22.51 
 
 
421 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0573  polysaccharide biosynthesis protein  21.41 
 
 
477 aa  104  3e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000747167  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1104  polysaccharide biosynthesis protein  25.24 
 
 
429 aa  102  2e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2854  polysaccharide biosynthesis protein  23.36 
 
 
423 aa  101  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.444695  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0220  PST family polysaccharide transporter  26.24 
 
 
472 aa  99.8  7e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2910  polysaccharide biosynthesis protein  26.42 
 
 
485 aa  98.2  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3041  polysaccharide biosynthesis protein  22.17 
 
 
471 aa  94  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2652  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 
426 aa  93.2  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0561066  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0123  polysaccharide biosynthesis protein  22.31 
 
 
476 aa  92  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.281108  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0118  polysaccharide biosynthesis protein  22.31 
 
 
476 aa  92  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0224366  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1412  polysaccharide biosynthesis protein  23.53 
 
 
474 aa  91.7  3e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1371  polysaccharide biosynthesis protein  23.13 
 
 
472 aa  90.9  4e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1407  PST family polysaccharide transporter  21.9 
 
 
481 aa  89.4  1e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23390  putative polysaccharide biosynthesis protein  27.82 
 
 
420 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000307585  hitchhiker  0.00805893 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12370  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  24.14 
 
 
424 aa  80.5  0.00000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0582  polysaccharide biosynthesis protein  22.49 
 
 
406 aa  76.6  0.0000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224366  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5060  polysaccharide biosynthesis protein  21.76 
 
 
478 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3458  polysaccharide biosynthesis protein  26.07 
 
 
427 aa  73.6  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2419  polysaccharide biosynthesis protein  24.66 
 
 
431 aa  73.2  0.000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0814087  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3729  polysaccharide biosynthesis protein  24.75 
 
 
438 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0553833 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1522  PST family polysaccharide transporter  21.61 
 
 
478 aa  65.5  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00741299  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1675  polysaccharide biosynthesis protein  23.51 
 
 
430 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0104334  normal  0.413628 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1033  polysaccharide biosynthesis protein  20.62 
 
 
412 aa  60.8  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0437322  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1369  polysaccharide biosynthesis protein  24.7 
 
 
416 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.52788  normal  0.0165485 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0604  polysaccharide biosynthesis protein  18.78 
 
 
483 aa  56.2  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000572815  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0464  polysaccharide transporter protein, putative  18.78 
 
 
486 aa  55.1  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000125112  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6750  polysaccharide biosynthesis protein  22.7 
 
 
429 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3183  polysaccharide biosynthesis protein  24.44 
 
 
424 aa  50.1  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1078  polysaccharide biosynthesis protein  23.19 
 
 
424 aa  45.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5560  polysaccharide biosynthesis protein, putative  20.26 
 
 
484 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>