118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1057 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_1057  PST family polysaccharide transporter  100 
 
 		 471 aa  927    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.140128  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1142  PST family polysaccharide transporter  51.29 
 
 		 475 aa  477  1e-133  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000134656  hitchhiker  0.0000175319 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1371  polysaccharide biosynthesis protein  45.03 
 
 		 472 aa  399  9.999999999999999e-111  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0220  PST family polysaccharide transporter  48.59 
 
 		 472 aa  367  1e-100  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1407  PST family polysaccharide transporter  42.77 
 
 		 481 aa  363  3e-99  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1412  polysaccharide biosynthesis protein  40.6 
 
 		 474 aa  358  9.999999999999999e-98  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1496  PST family polysaccharide transporter  40.72 
 
 		 484 aa  327  3e-88  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.104259  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3041  polysaccharide biosynthesis protein  39.39 
 
 		 471 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2910  polysaccharide biosynthesis protein  36.04 
 
 		 485 aa  286  5e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1353  polysaccharide biosynthesis protein  36.03 
 
 		 486 aa  285  1.0000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0573  polysaccharide biosynthesis protein  35.41 
 
 		 477 aa  277  3e-73  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000747167  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5060  polysaccharide biosynthesis protein  37.22 
 
 		 478 aa  271  2e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0118  polysaccharide biosynthesis protein  31.22 
 
 		 476 aa  235  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0224366  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0123  polysaccharide biosynthesis protein  31.22 
 
 		 476 aa  235  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.281108  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1522  PST family polysaccharide transporter  30.98 
 
 		 478 aa  223  4.9999999999999996e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00741299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0464  polysaccharide transporter protein, putative  25.83 
 
 		 486 aa  155  1e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000125112  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0604  polysaccharide biosynthesis protein  25.95 
 
 		 483 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000572815  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0590  polysaccharide biosynthesis protein, putative  24.68 
 
 		 483 aa  130  7.000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000415804  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5560  polysaccharide biosynthesis protein, putative  27.33 
 
 		 484 aa  127  6e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5222  polysaccharide biosynthesis protein  27.01 
 
 		 484 aa  124  4e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4360  polysaccharide biosynthesis protein  27.13 
 
 		 429 aa  121  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.86188 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6400  polysaccharide biosynthesis protein  25.88 
 
 		 431 aa  121  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.247838 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0849  polysaccharide biosynthesis protein  24.22 
 
 		 419 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4166  polysaccharide biosynthesis protein  22.28 
 
 		 417 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507145  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4200  polysaccharide biosynthesis protein  22.28 
 
 		 417 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.404926 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3316  polysaccharide biosynthesis protein  22.28 
 
 		 417 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0788043  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0027  polysaccharide biosynthesis family protein  23.41 
 
 		 422 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342295  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0806  polysaccharide biosynthesis family protein  23.41 
 
 		 422 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2875  polysaccharide transporter  23.41 
 
 		 422 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2209  polysaccharide transporter  23.41 
 
 		 422 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0627  polysaccharide biosynthesis family protein  23.41 
 
 		 422 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0642  polysaccharide transporter  23.41 
 
 		 422 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.21935  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2497  polysaccharide transporter  23.41 
 
 		 422 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.547808  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5279  polysaccharide biosynthesis protein  25.79 
 
 		 484 aa  104  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0394078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5123  spore cortex biosynthesis protein  25.79 
 
 		 484 aa  104  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151446  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5676  polysaccharide biosynthesis protein  25.79 
 
 		 484 aa  104  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5522  polysaccharide synthase family protein  25.79 
 
 		 484 aa  104  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0520  polysaccharide biosynthesis family protein  22.38 
 
 		 422 aa  103  6e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.203953  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2041  polysaccharide biosynthesis protein  25.94 
 
 		 415 aa  102  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0334353  normal  0.0804458 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1405  polysaccharide biosynthesis protein  23.95 
 
 		 418 aa  98.2  3e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000283826  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3618  polysaccharide biosynthesis protein  21.96 
 
 		 419 aa  97.1  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.180964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0028  polysaccharide biosynthesis protein  24.21 
 
 		 484 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4403  polysaccharide biosynthesis protein  20.05 
 
 		 417 aa  95.9  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.279052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2025  polysaccharide biosynthesis protein  25.32 
 
 		 424 aa  96.3  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.997214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1929  polysaccharide biosynthesis protein  23.8 
 
 		 424 aa  96.3  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.109004  normal  0.370568 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4093  polysaccharide biosynthesis protein  21.71 
 
 		 419 aa  95.1  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1081  polysaccharide biosynthesis protein  22.68 
 
 		 421 aa  94  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1197  Wzx  29.77 
 
 		 405 aa  92.4  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.905565  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3697  polysaccharide biosynthesis protein  21.96 
 
 		 443 aa  92  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6018  polysaccharide biosynthesis protein  21.53 
 
 		 433 aa  89.7  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.203106 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2253  lipopolysaccharide (O-antigen)exporter  21.59 
 
 		 444 aa  88.2  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1104  polysaccharide biosynthesis protein  27.02 
 
 		 429 aa  85.9  0.000000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1820  polysaccharide biosynthesis protein  21.76 
 
 		 418 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.482229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6729  polysaccharide biosynthesis protein  21.37 
 
 		 415 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1620  polysaccharide biosynthesis protein  23.04 
 
 		 415 aa  80.9  0.00000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0681626  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02920  O-antigen transporter  24.88 
 
 		 416 aa  79.3  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00862586  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0699  hypothetical protein  21.25 
 
 		 422 aa  77  0.0000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.786722 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2745  polysaccharide biosynthesis protein  22.67 
 
 		 412 aa  71.2  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  25.2 
 
 		 490 aa  66.2  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  25.6 
 
 		 488 aa  63.9  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0929  polysaccharide biosynthesis protein  23.1 
 
 		 489 aa  63.9  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0234  lipopolysaccharide O-side chain biosynthesis protein (O-antigen transpoter)  25.74 
 
 		 476 aa  60.8  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00421263  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1675  polysaccharide biosynthesis protein  22.98 
 
 		 430 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0104334  normal  0.413628 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3458  polysaccharide biosynthesis protein  22.69 
 
 		 427 aa  58.5  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1606  polysaccharide biosynthesis protein  20.29 
 
 		 412 aa  57.4  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0714758  normal  0.23948 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1369  polysaccharide biosynthesis protein  20.94 
 
 		 416 aa  57  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.52788  normal  0.0165485 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0629  lipopolysaccharide/O-antigen transporter, putative  21.14 
 
 		 467 aa  56.2  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2972  polysaccharide biosynthesis protein  23.76 
 
 		 480 aa  55.5  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0582  polysaccharide biosynthesis protein  20.4 
 
 		 406 aa  54.3  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224366  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1593  polysaccharide biosynthesis protein  25.34 
 
 		 504 aa  53.1  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2885  polysaccharide biosynthesis protein  23.16 
 
 		 404 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.285914  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  23.97 
 
 		 444 aa  53.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0744  polysaccharide biosynthesis protein  23.8 
 
 		 436 aa  52.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.923042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6750  polysaccharide biosynthesis protein  17.97 
 
 		 429 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  22.43 
 
 		 444 aa  51.2  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  25.23 
 
 		 490 aa  50.8  0.00005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2983  polysaccharide biosynthesis protein  27.73 
 
 		 427 aa  50.4  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0869  polysaccharide biosynthesis protein  26.49 
 
 		 509 aa  50.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12370  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  21.68 
 
 		 424 aa  50.1  0.00009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1071  polysaccharide biosynthesis protein  21.43 
 
 		 489 aa  49.7  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1581  polysaccharide biosynthesis protein  19.57 
 
 		 406 aa  49.7  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.769427  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  27.72 
 
 		 444 aa  49.7  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2760  polysaccharide biosynthesis protein  24.43 
 
 		 542 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.874111  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0177  polysaccharide biosynthesis protein  24.73 
 
 		 446 aa  48.9  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2652  polysaccharide biosynthesis protein  21.43 
 
 		 426 aa  48.5  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0561066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2419  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 431 aa  48.5  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0814087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0341  polysaccharide biosynthesis protein  28.19 
 
 		 500 aa  48.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.467363  decreased coverage  0.0000100108 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4040  polysaccharide biosynthesis protein  25.74 
 
 		 444 aa  47.8  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.519664  normal  0.589796 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0142  polysaccharide biosynthesis protein  26.75 
 
 		 513 aa  47.8  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2535  polysaccharide biosynthesis protein  22.58 
 
 		 409 aa  47.8  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2335  polysaccharide biosynthesis protein  23.44 
 
 		 490 aa  47  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000025001  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0526  polysaccharide biosynthesis protein  26.45 
 
 		 508 aa  47  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0539  polysaccharide biosynthesis protein  26.45 
 
 		 508 aa  47  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.41345  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  21.74 
 
 		 483 aa  46.6  0.0009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0361  polysaccharide biosynthesis protein  23.33 
 
 		 482 aa  46.6  0.0009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0414  polysaccharide biosynthesis protein  25.4 
 
 		 500 aa  46.6  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37906  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0172  polysaccharide biosynthesis protein  26.4 
 
 		 433 aa  46.6  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.663645  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0050  polysaccharide biosynthesis protein  25.6 
 
 		 529 aa  46.2  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1495  integral membrane protein MviN  22.78 
 
 		 497 aa  45.8  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2062  polysaccharide biosynthesis protein  20 
 
 		 511 aa  45.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.445911  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>