54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2652 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2652  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 426 aa  829    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0561066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1081  polysaccharide biosynthesis protein  24.68 
 
 		 421 aa  122  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1620  polysaccharide biosynthesis protein  24.74 
 
 		 415 aa  114  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0681626  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1405  polysaccharide biosynthesis protein  24.06 
 
 		 418 aa  105  1e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000283826  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6018  polysaccharide biosynthesis protein  26.16 
 
 		 433 aa  98.6  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.203106 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0582  polysaccharide biosynthesis protein  24.44 
 
 		 406 aa  97.1  6e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224366  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0520  polysaccharide biosynthesis family protein  24.02 
 
 		 422 aa  97.1  6e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.203953  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2253  lipopolysaccharide (O-antigen)exporter  26.06 
 
 		 444 aa  95.1  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0027  polysaccharide biosynthesis family protein  25 
 
 		 422 aa  93.2  7e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342295  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2497  polysaccharide transporter  25 
 
 		 422 aa  93.2  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.547808  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2209  polysaccharide transporter  25 
 
 		 422 aa  93.2  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2875  polysaccharide transporter  25 
 
 		 422 aa  93.2  7e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0806  polysaccharide biosynthesis family protein  25 
 
 		 422 aa  93.2  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0642  polysaccharide transporter  25 
 
 		 422 aa  93.2  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.21935  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0627  polysaccharide biosynthesis family protein  25 
 
 		 422 aa  93.2  9e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4093  polysaccharide biosynthesis protein  24.85 
 
 		 419 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4403  polysaccharide biosynthesis protein  24.84 
 
 		 417 aa  90.9  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.279052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3618  polysaccharide biosynthesis protein  25.15 
 
 		 419 aa  91.3  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.180964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1820  polysaccharide biosynthesis protein  27.9 
 
 		 418 aa  91.3  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.482229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6400  polysaccharide biosynthesis protein  26.04 
 
 		 431 aa  90.5  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.247838 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1929  polysaccharide biosynthesis protein  24.22 
 
 		 424 aa  89.7  9e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.109004  normal  0.370568 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0849  polysaccharide biosynthesis protein  24.66 
 
 		 419 aa  89.4  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1606  polysaccharide biosynthesis protein  24.76 
 
 		 412 aa  81.3  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0714758  normal  0.23948 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4360  polysaccharide biosynthesis protein  22.98 
 
 		 429 aa  80.5  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.86188 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4200  polysaccharide biosynthesis protein  24.76 
 
 		 417 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.404926 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4166  polysaccharide biosynthesis protein  24.76 
 
 		 417 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507145  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3316  polysaccharide biosynthesis protein  24.76 
 
 		 417 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0788043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0699  hypothetical protein  21.72 
 
 		 422 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.786722 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2025  polysaccharide biosynthesis protein  24.78 
 
 		 424 aa  72.8  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.997214  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02920  O-antigen transporter  23.33 
 
 		 416 aa  72.4  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00862586  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6729  polysaccharide biosynthesis protein  24.15 
 
 		 415 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12370  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  24.81 
 
 		 424 aa  68.2  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1104  polysaccharide biosynthesis protein  23.56 
 
 		 429 aa  65.5  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2041  polysaccharide biosynthesis protein  21.52 
 
 		 415 aa  64.3  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0334353  normal  0.0804458 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0573  polysaccharide biosynthesis protein  28.42 
 
 		 477 aa  62  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000747167  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2745  polysaccharide biosynthesis protein  25.68 
 
 		 412 aa  61.6  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3697  polysaccharide biosynthesis protein  21.71 
 
 		 443 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1496  PST family polysaccharide transporter  24.28 
 
 		 484 aa  60.8  0.00000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.104259  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3458  polysaccharide biosynthesis protein  27.27 
 
 		 427 aa  60.1  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1197  Wzx  22.96 
 
 		 405 aa  57.8  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.905565  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5560  polysaccharide biosynthesis protein, putative  23.59 
 
 		 484 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2419  polysaccharide biosynthesis protein  22.57 
 
 		 431 aa  52  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0814087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5222  polysaccharide biosynthesis protein  23.08 
 
 		 484 aa  51.6  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1369  polysaccharide biosynthesis protein  22.97 
 
 		 416 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.52788  normal  0.0165485 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23390  putative polysaccharide biosynthesis protein  23.24 
 
 		 420 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000307585  hitchhiker  0.00805893 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1057  PST family polysaccharide transporter  21.43 
 
 		 471 aa  48.5  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.140128  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1142  PST family polysaccharide transporter  20.74 
 
 		 475 aa  47.8  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000134656  hitchhiker  0.0000175319 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2910  polysaccharide biosynthesis protein  29.27 
 
 		 485 aa  46.6  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1407  PST family polysaccharide transporter  21.35 
 
 		 481 aa  45.1  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5060  polysaccharide biosynthesis protein  24.47 
 
 		 478 aa  45.1  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0604  polysaccharide biosynthesis protein  26.11 
 
 		 483 aa  44.3  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000572815  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1412  polysaccharide biosynthesis protein  23.76 
 
 		 474 aa  44.3  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1353  polysaccharide biosynthesis protein  22.12 
 
 		 486 aa  44.3  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0464  polysaccharide transporter protein, putative  26.11 
 
 		 486 aa  43.9  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000125112  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>