109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1929 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1929  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 424 aa  828    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.109004  normal  0.370568 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1405  polysaccharide biosynthesis protein  37.97 
 
 		 418 aa  267  2.9999999999999995e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000283826  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02920  O-antigen transporter  37.62 
 
 		 416 aa  234  3e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00862586  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0699  hypothetical protein  29.5 
 
 		 422 aa  211  2e-53  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.786722 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0849  polysaccharide biosynthesis protein  30.07 
 
 		 419 aa  209  9e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6400  polysaccharide biosynthesis protein  30.56 
 
 		 431 aa  205  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.247838 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0520  polysaccharide biosynthesis family protein  28.08 
 
 		 422 aa  203  4e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.203953  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2041  polysaccharide biosynthesis protein  30.58 
 
 		 415 aa  201  1.9999999999999998e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0334353  normal  0.0804458 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4360  polysaccharide biosynthesis protein  27.54 
 
 		 429 aa  193  4e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.86188 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0027  polysaccharide biosynthesis family protein  27.09 
 
 		 422 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342295  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0806  polysaccharide biosynthesis family protein  27.09 
 
 		 422 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2875  polysaccharide transporter  27.09 
 
 		 422 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2209  polysaccharide transporter  27.09 
 
 		 422 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0627  polysaccharide biosynthesis family protein  27.09 
 
 		 422 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0642  polysaccharide transporter  27.09 
 
 		 422 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.21935  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2497  polysaccharide transporter  27.09 
 
 		 422 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.547808  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1620  polysaccharide biosynthesis protein  31.45 
 
 		 415 aa  190  5e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0681626  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4166  polysaccharide biosynthesis protein  27.16 
 
 		 417 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507145  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4200  polysaccharide biosynthesis protein  27.16 
 
 		 417 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.404926 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2025  polysaccharide biosynthesis protein  32.6 
 
 		 424 aa  188  2e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.997214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3316  polysaccharide biosynthesis protein  27.16 
 
 		 417 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0788043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1081  polysaccharide biosynthesis protein  33.33 
 
 		 421 aa  181  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4403  polysaccharide biosynthesis protein  27.21 
 
 		 417 aa  177  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.279052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4093  polysaccharide biosynthesis protein  27.75 
 
 		 419 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3618  polysaccharide biosynthesis protein  27.47 
 
 		 419 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.180964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1820  polysaccharide biosynthesis protein  27.09 
 
 		 418 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.482229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6729  polysaccharide biosynthesis protein  26.42 
 
 		 415 aa  152  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2745  polysaccharide biosynthesis protein  31.09 
 
 		 412 aa  145  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1197  Wzx  30.47 
 
 		 405 aa  144  4e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.905565  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6018  polysaccharide biosynthesis protein  27.34 
 
 		 433 aa  143  6e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.203106 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0582  polysaccharide biosynthesis protein  31.67 
 
 		 406 aa  138  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224366  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12370  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  29.25 
 
 		 424 aa  136  8e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2253  lipopolysaccharide (O-antigen)exporter  26.25 
 
 		 444 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3697  polysaccharide biosynthesis protein  28.12 
 
 		 443 aa  125  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2419  polysaccharide biosynthesis protein  27.21 
 
 		 431 aa  107  4e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0814087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1142  PST family polysaccharide transporter  24.63 
 
 		 475 aa  104  3e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000134656  hitchhiker  0.0000175319 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2910  polysaccharide biosynthesis protein  25.38 
 
 		 485 aa  104  3e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1496  PST family polysaccharide transporter  22.54 
 
 		 484 aa  99  2e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.104259  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1371  polysaccharide biosynthesis protein  24.51 
 
 		 472 aa  97.8  3e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1104  polysaccharide biosynthesis protein  28.31 
 
 		 429 aa  96.7  6e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1057  PST family polysaccharide transporter  23.8 
 
 		 471 aa  96.3  9e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.140128  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1353  polysaccharide biosynthesis protein  23.18 
 
 		 486 aa  93.6  7e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0573  polysaccharide biosynthesis protein  21.83 
 
 		 477 aa  93.2  8e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000747167  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2854  polysaccharide biosynthesis protein  26.34 
 
 		 423 aa  91.7  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.444695  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2652  polysaccharide biosynthesis protein  24.22 
 
 		 426 aa  89.4  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0561066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0220  PST family polysaccharide transporter  24.64 
 
 		 472 aa  86.7  7e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1407  PST family polysaccharide transporter  22.96 
 
 		 481 aa  80.5  0.00000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1606  polysaccharide biosynthesis protein  22.46 
 
 		 412 aa  79.3  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0714758  normal  0.23948 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5060  polysaccharide biosynthesis protein  27.23 
 
 		 478 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1369  polysaccharide biosynthesis protein  26.55 
 
 		 416 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.52788  normal  0.0165485 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0118  polysaccharide biosynthesis protein  21.38 
 
 		 476 aa  73.9  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0224366  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0123  polysaccharide biosynthesis protein  21.38 
 
 		 476 aa  73.9  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.281108  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3041  polysaccharide biosynthesis protein  22.83 
 
 		 471 aa  73.2  0.000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23390  putative polysaccharide biosynthesis protein  22.54 
 
 		 420 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000307585  hitchhiker  0.00805893 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0629  lipopolysaccharide/O-antigen transporter, putative  22.48 
 
 		 467 aa  70.1  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0590  polysaccharide biosynthesis protein, putative  27.09 
 
 		 483 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000415804  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  22.94 
 
 		 477 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1412  polysaccharide biosynthesis protein  23.18 
 
 		 474 aa  68.6  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0464  polysaccharide transporter protein, putative  23.27 
 
 		 486 aa  68.2  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000125112  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0604  polysaccharide biosynthesis protein  23.46 
 
 		 483 aa  67.4  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000572815  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1495  polysaccharide biosynthesis protein  25.83 
 
 		 484 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1467  polysaccharide biosynthesis protein  25.83 
 
 		 484 aa  65.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000343252  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1613  polysaccharide biosynthesis protein  25.83 
 
 		 478 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.294674  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1033  polysaccharide biosynthesis protein  23.89 
 
 		 412 aa  65.9  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0437322  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0391  polysaccharide biosynthesis protein  25.32 
 
 		 476 aa  66.2  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  24.2 
 
 		 449 aa  66.2  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1027  putative polysaccharide biosynthesis protein  25.19 
 
 		 392 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1681  polysaccharide synthase family protein  25.83 
 
 		 478 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5560  polysaccharide biosynthesis protein, putative  23.08 
 
 		 484 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6750  polysaccharide biosynthesis protein  21.53 
 
 		 429 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5222  polysaccharide biosynthesis protein  23.87 
 
 		 484 aa  63.5  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1522  PST family polysaccharide transporter  20.97 
 
 		 478 aa  63.5  0.000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00741299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2504  polysaccharide biosynthesis protein  23.02 
 
 		 486 aa  60.8  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5305  polysaccharide biosynthesis protein  21.96 
 
 		 502 aa  60.5  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3458  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 427 aa  60.1  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5279  polysaccharide biosynthesis protein  22.07 
 
 		 484 aa  57.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0394078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5123  spore cortex biosynthesis protein  22.07 
 
 		 484 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151446  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5676  polysaccharide biosynthesis protein  22.07 
 
 		 484 aa  57.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3729  polysaccharide biosynthesis protein  25.14 
 
 		 438 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0553833 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1649  polysaccharide synthase family protein  24.76 
 
 		 478 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.44301  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5522  polysaccharide synthase family protein  22.07 
 
 		 484 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0691  polysaccharide biosynthesis protein  23.94 
 
 		 502 aa  56.2  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3696  polysaccharide synthase family protein  23.56 
 
 		 478 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1675  polysaccharide biosynthesis protein  21.9 
 
 		 430 aa  54.7  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0104334  normal  0.413628 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0028  polysaccharide biosynthesis protein  26.19 
 
 		 484 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0727  polysaccharide biosynthesis protein  22.43 
 
 		 478 aa  53.1  0.000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.207142  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0302  maturase-related protein  25 
 
 		 421 aa  51.6  0.00003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2062  polysaccharide biosynthesis protein  19.21 
 
 		 511 aa  51.2  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.445911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0934  polysaccharide biosynthesis protein  21.04 
 
 		 418 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0952  polysaccharide biosynthesis protein  21.04 
 
 		 418 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.489257  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1959  polysaccharide biosynthesis protein  19.95 
 
 		 451 aa  49.7  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1791  polysaccharide biosynthesis protein  21.24 
 
 		 504 aa  48.5  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0032  polysaccharide biosynthesis protein  21.76 
 
 		 487 aa  48.9  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.166793 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4091  polysaccharide biosynthesis protein  24.02 
 
 		 430 aa  47.4  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2947  polysaccharide biosynthesis protein  21.05 
 
 		 484 aa  46.6  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5107  oligosaccharide translocase  22.73 
 
 		 483 aa  45.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1044  polysaccharide biosynthesis protein  21.5 
 
 		 440 aa  46.2  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.041441  hitchhiker  0.00655602 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1361  polysaccharide biosynthesis protein  23.46 
 
 		 413 aa  46.2  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483225  unclonable  0.0000000256808 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0588  polysaccharide biosynthesis protein  23.92 
 
 		 410 aa  46.6  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0284636  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2971  polysaccharide biosynthesis protein  23.04 
 
 		 475 aa  45.8  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.224966  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>