38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_23390 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_23390  putative polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 420 aa  819    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000307585  hitchhiker  0.00805893 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0520  polysaccharide biosynthesis family protein  28.17 
 
 		 422 aa  94  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.203953  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0849  polysaccharide biosynthesis protein  26.33 
 
 		 419 aa  91.3  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0806  polysaccharide biosynthesis family protein  28.17 
 
 		 422 aa  90.1  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0642  polysaccharide transporter  28.17 
 
 		 422 aa  90.1  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.21935  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0627  polysaccharide biosynthesis family protein  28.17 
 
 		 422 aa  90.1  7e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6018  polysaccharide biosynthesis protein  26.32 
 
 		 433 aa  89.4  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.203106 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2041  polysaccharide biosynthesis protein  24 
 
 		 415 aa  88.6  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0334353  normal  0.0804458 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0027  polysaccharide biosynthesis family protein  27.82 
 
 		 422 aa  88.2  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342295  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2497  polysaccharide transporter  27.82 
 
 		 422 aa  88.2  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.547808  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2209  polysaccharide transporter  27.82 
 
 		 422 aa  88.2  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2875  polysaccharide transporter  27.82 
 
 		 422 aa  88.2  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1620  polysaccharide biosynthesis protein  24.55 
 
 		 415 aa  87.8  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0681626  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4093  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 419 aa  87  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1405  polysaccharide biosynthesis protein  24.59 
 
 		 418 aa  86.7  8e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000283826  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1820  polysaccharide biosynthesis protein  27.04 
 
 		 418 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.482229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3618  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 419 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.180964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4403  polysaccharide biosynthesis protein  24.41 
 
 		 417 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.279052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2253  lipopolysaccharide (O-antigen)exporter  26.81 
 
 		 444 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6729  polysaccharide biosynthesis protein  24.74 
 
 		 415 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2025  polysaccharide biosynthesis protein  25.44 
 
 		 424 aa  73.6  0.000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.997214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1929  polysaccharide biosynthesis protein  22.54 
 
 		 424 aa  72  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.109004  normal  0.370568 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4360  polysaccharide biosynthesis protein  24.07 
 
 		 429 aa  71.2  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.86188 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02920  O-antigen transporter  25.82 
 
 		 416 aa  70.5  0.00000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00862586  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1081  polysaccharide biosynthesis protein  22.22 
 
 		 421 aa  70.5  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3316  polysaccharide biosynthesis protein  26.24 
 
 		 417 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0788043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4200  polysaccharide biosynthesis protein  26.24 
 
 		 417 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.404926 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4166  polysaccharide biosynthesis protein  26.24 
 
 		 417 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507145  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3697  polysaccharide biosynthesis protein  23.64 
 
 		 443 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0699  hypothetical protein  23.42 
 
 		 422 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.786722 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1104  polysaccharide biosynthesis protein  22.07 
 
 		 429 aa  59.7  0.00000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1197  Wzx  22.41 
 
 		 405 aa  58.9  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.905565  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2419  polysaccharide biosynthesis protein  26.21 
 
 		 431 aa  57  0.0000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0814087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1353  polysaccharide biosynthesis protein  20.6 
 
 		 486 aa  55.8  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2652  polysaccharide biosynthesis protein  23.24 
 
 		 426 aa  51.2  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0561066  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2854  polysaccharide biosynthesis protein  24.24 
 
 		 423 aa  48.5  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.444695  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2745  polysaccharide biosynthesis protein  25.19 
 
 		 412 aa  48.5  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3041  polysaccharide biosynthesis protein  19.4 
 
 		 471 aa  47  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>