34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_3147 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_3147  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 475 aa  924    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.875944  normal  0.24442 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  22.35 
 
 		 477 aa  70.9  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0391  polysaccharide biosynthesis protein  22.69 
 
 		 476 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0796  polysaccharide biosynthesis protein  21.51 
 
 		 482 aa  58.9  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.733222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0727  polysaccharide biosynthesis protein  22.33 
 
 		 478 aa  56.2  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.207142  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4228  polysaccharide biosynthesis protein  21.89 
 
 		 486 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2285  polysaccharide biosynthesis protein  18.4 
 
 		 449 aa  52.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.398242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2910  polysaccharide biosynthesis protein  18.98 
 
 		 485 aa  51.2  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0234  lipopolysaccharide O-side chain biosynthesis protein (O-antigen transpoter)  24.07 
 
 		 476 aa  50.8  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00421263  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0457  polysaccharide biosynthesis protein  21.07 
 
 		 488 aa  50.1  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0665  polysaccharide biosynthesis protein  23.79 
 
 		 426 aa  49.7  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1353  polysaccharide biosynthesis protein  22.94 
 
 		 486 aa  49.7  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  21.9 
 
 		 517 aa  48.5  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02920  O-antigen transporter  26.17 
 
 		 416 aa  48.5  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00862586  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1522  PST family polysaccharide transporter  22.88 
 
 		 478 aa  47  0.0008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00741299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5396  oligosaccharide translocase  22.03 
 
 		 473 aa  47  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0686  putative lipopolysaccharide O-SIDE chain biosynthesis transmembrane protein  21.99 
 
 		 422 aa  46.6  0.0009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.599007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5060  polysaccharide biosynthesis protein  20.94 
 
 		 478 aa  46.6  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3901  polysaccharide biosynthesis protein  21.48 
 
 		 498 aa  46.2  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1606  polysaccharide biosynthesis protein  20.9 
 
 		 412 aa  45.8  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0714758  normal  0.23948 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0921  polysaccharide biosynthesis protein  20.75 
 
 		 541 aa  45.8  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.190343 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1033  polysaccharide biosynthesis protein  25.85 
 
 		 412 aa  45.1  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0437322  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0123  polysaccharide biosynthesis protein  27.59 
 
 		 476 aa  45.1  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.281108  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3697  polysaccharide biosynthesis protein  20.8 
 
 		 443 aa  45.1  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2745  polysaccharide biosynthesis protein  19.05 
 
 		 412 aa  44.7  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0118  polysaccharide biosynthesis protein  27.59 
 
 		 476 aa  45.1  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0224366  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1274  polysaccharide export protein  22.93 
 
 		 399 aa  45.1  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212391 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2021  polysaccharide biosynthesis protein  21.48 
 
 		 428 aa  44.3  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4201  polysaccharide biosynthesis protein  24.11 
 
 		 487 aa  43.9  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5553  oligosaccharide translocase  22.3 
 
 		 471 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1929  polysaccharide biosynthesis protein  21.91 
 
 		 424 aa  43.9  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.109004  normal  0.370568 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4497  polysaccharide biosynthesis protein  21.65 
 
 		 472 aa  43.5  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0629  lipopolysaccharide/O-antigen transporter, putative  21.25 
 
 		 467 aa  43.1  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0025  hypothetical protein  22.25 
 
 		 439 aa  43.1  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000686013  hitchhiker  0.00952871 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>