90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2062 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2062  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
511 aa  1000    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.445911  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0665  polysaccharide biosynthesis protein  24.02 
 
 
426 aa  105  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0391  polysaccharide biosynthesis protein  21.21 
 
 
476 aa  103  5e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4040  polysaccharide biosynthesis protein  24.35 
 
 
444 aa  99.4  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.519664  normal  0.589796 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1236  polysaccharide biosynthesis protein  24.43 
 
 
482 aa  87.8  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.286439 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2892  polysaccharide biosynthesis protein  26.1 
 
 
429 aa  87  8e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1959  polysaccharide biosynthesis protein  22.19 
 
 
451 aa  87  8e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0234  lipopolysaccharide O-side chain biosynthesis protein (O-antigen transpoter)  21.65 
 
 
476 aa  86.7  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00421263  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  22.83 
 
 
444 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0727  polysaccharide biosynthesis protein  20.82 
 
 
478 aa  86.3  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.207142  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  22.63 
 
 
444 aa  82.8  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1044  polysaccharide biosynthesis protein  22.06 
 
 
440 aa  78.2  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.041441  hitchhiker  0.00655602 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  21.86 
 
 
444 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0921  polysaccharide biosynthesis protein  23.56 
 
 
541 aa  75.9  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.190343 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0744  polysaccharide biosynthesis protein  23.79 
 
 
436 aa  75.5  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.923042  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  20.25 
 
 
477 aa  75.5  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  23.1 
 
 
449 aa  74.7  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1343  polysaccharide biosynthesis protein  21.82 
 
 
432 aa  73.6  0.000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3189  polysaccharide biosynthesis protein  24.47 
 
 
446 aa  72.8  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.27784  hitchhiker  0.00540344 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2285  polysaccharide biosynthesis protein  23.26 
 
 
449 aa  70.9  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.398242  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4119  polysaccharide biosynthesis protein  23.96 
 
 
1103 aa  70.9  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0796  polysaccharide biosynthesis protein  23.92 
 
 
482 aa  70.9  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.733222  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4228  polysaccharide biosynthesis protein  21.09 
 
 
486 aa  70.9  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1407  PST family polysaccharide transporter  23.27 
 
 
481 aa  70.5  0.00000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1766  polysaccharide biosynthesis protein  24.65 
 
 
441 aa  69.3  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0629  lipopolysaccharide/O-antigen transporter, putative  24.92 
 
 
467 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0253  polysaccharide biosynthesis protein  21.43 
 
 
435 aa  69.3  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000123579  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4839  polysaccharide biosynthesis protein  19.76 
 
 
465 aa  67  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.261545  normal  0.0682 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0457  polysaccharide biosynthesis protein  22.22 
 
 
488 aa  66.6  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2602  polysaccharide biosynthesis protein  24.51 
 
 
448 aa  66.2  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5107  oligosaccharide translocase  21.6 
 
 
483 aa  65.5  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1069  polysaccharide biosynthesis protein  25.41 
 
 
488 aa  64.7  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0264507  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0588  polysaccharide biosynthesis protein  24.52 
 
 
410 aa  64.3  0.000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0284636  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1384  polysaccharide biosynthesis protein  19.31 
 
 
440 aa  64.3  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1412  polysaccharide biosynthesis protein  24.58 
 
 
474 aa  63.5  0.000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1828  polysaccharide biosynthesis protein  24.04 
 
 
529 aa  61.2  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  21.61 
 
 
490 aa  61.2  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3790  polysaccharide biosynthesis protein  25.4 
 
 
1103 aa  60.8  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.500629 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3876  polysaccharide biosynthesis protein  29.51 
 
 
427 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6400  polysaccharide biosynthesis protein  20.75 
 
 
431 aa  56.2  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.247838 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2748  polysaccharide biosynthesis protein  23.28 
 
 
526 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.327125  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5611  oligosaccharide translocase  21.56 
 
 
470 aa  56.6  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3041  polysaccharide biosynthesis protein  19.9 
 
 
471 aa  54.7  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5553  oligosaccharide translocase  20.85 
 
 
471 aa  54.7  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1371  polysaccharide biosynthesis protein  24.12 
 
 
472 aa  54.7  0.000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0123  polysaccharide biosynthesis protein  23.26 
 
 
476 aa  54.3  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.281108  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4497  polysaccharide biosynthesis protein  20.18 
 
 
472 aa  54.3  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0118  polysaccharide biosynthesis protein  23.26 
 
 
476 aa  54.3  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0224366  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1081  polysaccharide biosynthesis protein  22.49 
 
 
421 aa  54.3  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3697  polysaccharide biosynthesis protein  25.06 
 
 
443 aa  54.3  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5305  polysaccharide biosynthesis protein  23.4 
 
 
502 aa  54.3  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1353  polysaccharide biosynthesis protein  20.96 
 
 
486 aa  53.9  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5396  oligosaccharide translocase  21.17 
 
 
473 aa  53.9  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2041  polysaccharide biosynthesis protein  20 
 
 
415 aa  53.5  0.000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0334353  normal  0.0804458 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1496  PST family polysaccharide transporter  21.05 
 
 
484 aa  53.5  0.000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.104259  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0604  polysaccharide biosynthesis protein  23.72 
 
 
483 aa  52.8  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000572815  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0464  polysaccharide transporter protein, putative  24.02 
 
 
486 aa  52.4  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000125112  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1929  polysaccharide biosynthesis protein  19.21 
 
 
424 aa  51.2  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.109004  normal  0.370568 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3948  polysaccharide biosynthesis protein  21.06 
 
 
473 aa  51.2  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5060  polysaccharide biosynthesis protein  22.73 
 
 
478 aa  51.2  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0741  putative lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.57 
 
 
419 aa  50.8  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2104  stage V sporulation protein B  23.01 
 
 
529 aa  50.4  0.00008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.624718  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2910  polysaccharide biosynthesis protein  20.92 
 
 
485 aa  49.3  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0469  polysaccharide biosynthesis protein  22.22 
 
 
486 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00384316  hitchhiker  0.000182088 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0952  polysaccharide biosynthesis protein  26.19 
 
 
418 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.489257  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05310  hypothetical protein  28.98 
 
 
433 aa  48.1  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198261  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0934  polysaccharide biosynthesis protein  26.19 
 
 
418 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2947  polysaccharide biosynthesis protein  24.7 
 
 
484 aa  48.5  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2950  glycosyl transferase group 1  24.6 
 
 
899 aa  48.1  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1495  polysaccharide biosynthesis protein  24.21 
 
 
503 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.994963  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2587  polysaccharide biosynthesis protein  26.86 
 
 
508 aa  47  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4125  polysaccharide biosynthesis protein  23.14 
 
 
542 aa  47  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5503  polysaccharide biosynthesis protein  27.78 
 
 
491 aa  47  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0743746  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  21.53 
 
 
488 aa  46.2  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4442  polysaccharide biosynthesis protein  26.84 
 
 
398 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1187  polysaccharide biosynthesis protein  24.15 
 
 
488 aa  45.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3839  polysaccharide biosynthesis protein  27.01 
 
 
507 aa  46.2  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  21.62 
 
 
512 aa  45.8  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1057  PST family polysaccharide transporter  18.99 
 
 
471 aa  45.4  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.140128  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1142  PST family polysaccharide transporter  23.85 
 
 
475 aa  45.4  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000134656  hitchhiker  0.0000175319 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3244  polysaccharide biosynthesis protein  26.67 
 
 
487 aa  44.7  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2756  polysaccharide biosynthesis protein  21.36 
 
 
476 aa  44.7  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.1976  normal  0.927782 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1846  polysaccharide biosynthesis protein  21.64 
 
 
433 aa  44.7  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0220  PST family polysaccharide transporter  20.78 
 
 
472 aa  44.3  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1235  integral membrane protein MviN  30.59 
 
 
526 aa  43.9  0.007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2834  putative virulence factor  26.54 
 
 
534 aa  43.9  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00622591  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0675  integral membrane protein MviN  22.61 
 
 
549 aa  43.9  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.136729  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4360  polysaccharide biosynthesis protein  20.79 
 
 
429 aa  43.5  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.86188 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2007  polysaccharide biosynthesis protein  27.87 
 
 
442 aa  43.9  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0855349 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6729  polysaccharide biosynthesis protein  23.32 
 
 
415 aa  43.9  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>