33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0952 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0934  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 418 aa  811    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0952  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 418 aa  811    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.489257  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3876  polysaccharide biosynthesis protein  23.68 
 
 		 427 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1929  polysaccharide biosynthesis protein  21.04 
 
 		 424 aa  50.4  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.109004  normal  0.370568 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5553  oligosaccharide translocase  21.64 
 
 		 471 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5107  oligosaccharide translocase  21.84 
 
 		 483 aa  49.3  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2062  polysaccharide biosynthesis protein  26.19 
 
 		 511 aa  47.8  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.445911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5396  oligosaccharide translocase  21.95 
 
 		 473 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0416  polysaccharide biosynthesis protein  26.53 
 
 		 506 aa  47  0.0006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.484223  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1271  polysaccharide biosynthesis protein  25.74 
 
 		 429 aa  45.1  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.958308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2338  colanic acid exporter  22.72 
 
 		 492 aa  45.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2015  polysaccharide biosynthesis protein  24.64 
 
 		 466 aa  45.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.42395 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1611  polysaccharide biosynthesis protein  22.86 
 
 		 492 aa  44.7  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000161996  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1186  colanic acid exporter  22.98 
 
 		 492 aa  45.1  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3948  polysaccharide biosynthesis protein  22.49 
 
 		 473 aa  44.7  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2971  polysaccharide biosynthesis protein  26.03 
 
 		 475 aa  44.7  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.224966  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0174  colanic acid exporter  24.16 
 
 		 483 aa  44.3  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  0.572056 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2745  polysaccharide biosynthesis protein  32.2 
 
 		 412 aa  44.3  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5611  oligosaccharide translocase  22.64 
 
 		 470 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2980  colanic acid exporter  22.98 
 
 		 492 aa  43.9  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.638348  hitchhiker  0.000245488 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1016  colanic acid exporter  22.98 
 
 		 492 aa  43.9  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.6233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2047  polysaccharide biosynthesis protein  24.38 
 
 		 504 aa  43.9  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.82849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2227  colanic acid exporter  21.75 
 
 		 503 aa  43.5  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.125419  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2996  polysaccharide biosynthesis protein  24.1 
 
 		 459 aa  43.9  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143417 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2587  polysaccharide biosynthesis protein  23.45 
 
 		 508 aa  43.9  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1595  colanic acid exporter  22.72 
 
 		 492 aa  43.5  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.14866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2442  colanic acid exporter  21.75 
 
 		 510 aa  43.5  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000846764 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2335  colanic acid exporter  21.75 
 
 		 510 aa  43.1  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.673501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2328  colanic acid exporter  21.75 
 
 		 510 aa  43.5  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.663239  normal  0.0902335 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2284  colanic acid exporter  21.75 
 
 		 510 aa  43.1  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000490639 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3400  polysaccharide biosynthesis protein  28.57 
 
 		 493 aa  43.5  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.46143  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01941  hypothetical protein  22.72 
 
 		 492 aa  43.1  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0074842  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01952  colanic acid exporter  22.72 
 
 		 492 aa  43.1  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0109189  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>