167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3189 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3189  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 446 aa  889    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.27784  hitchhiker  0.00540344 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0665  polysaccharide biosynthesis protein  44.84 
 
 		 426 aa  365  1e-100  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  38.52 
 
 		 449 aa  317  3e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1044  polysaccharide biosynthesis protein  41.99 
 
 		 440 aa  306  4.0000000000000004e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.041441  hitchhiker  0.00655602 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1384  polysaccharide biosynthesis protein  36.66 
 
 		 440 aa  285  8e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1959  polysaccharide biosynthesis protein  34.81 
 
 		 451 aa  269  5.9999999999999995e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4040  polysaccharide biosynthesis protein  39.12 
 
 		 444 aa  267  2e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.519664  normal  0.589796 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  30.14 
 
 		 444 aa  248  1e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0744  polysaccharide biosynthesis protein  35.42 
 
 		 436 aa  247  3e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.923042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  31.54 
 
 		 444 aa  239  9e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1766  polysaccharide biosynthesis protein  31.35 
 
 		 441 aa  230  3e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  30.61 
 
 		 444 aa  228  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1236  polysaccharide biosynthesis protein  31.49 
 
 		 482 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286439 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2285  polysaccharide biosynthesis protein  27.76 
 
 		 449 aa  196  6e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.398242  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2602  polysaccharide biosynthesis protein  33.33 
 
 		 448 aa  196  8.000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2983  polysaccharide biosynthesis protein  33.42 
 
 		 427 aa  164  3e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2892  polysaccharide biosynthesis protein  28.22 
 
 		 429 aa  155  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  26.29 
 
 		 477 aa  122  9e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0727  polysaccharide biosynthesis protein  25.52 
 
 		 478 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.207142  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0391  polysaccharide biosynthesis protein  25.84 
 
 		 476 aa  107  3e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0253  polysaccharide biosynthesis protein  25.22 
 
 		 435 aa  95.1  2e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000123579  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0234  lipopolysaccharide O-side chain biosynthesis protein (O-antigen transpoter)  25.37 
 
 		 476 aa  89.7  9e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00421263  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  26.49 
 
 		 499 aa  75.5  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2062  polysaccharide biosynthesis protein  24.47 
 
 		 511 aa  72.8  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.445911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1343  polysaccharide biosynthesis protein  23.06 
 
 		 432 aa  72.8  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2459  polysaccharide biosynthesis protein  26.68 
 
 		 490 aa  71.2  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0919  polysaccharide biosynthesis protein  20 
 
 		 420 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0469  polysaccharide biosynthesis protein  23.23 
 
 		 486 aa  70.1  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00384316  hitchhiker  0.000182088 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3355  polysaccharide biosynthesis protein  24 
 
 		 423 aa  69.3  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  24.81 
 
 		 488 aa  68.6  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0771  membrane protein  21.81 
 
 		 418 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0782  polysaccharide biosynthesis protein  21.58 
 
 		 418 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5107  oligosaccharide translocase  23.24 
 
 		 483 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2021  polysaccharide biosynthesis protein  24.2 
 
 		 428 aa  67.4  0.0000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0621  polysaccharide biosynthesis protein  33.69 
 
 		 475 aa  67.4  0.0000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.914686  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1069  polysaccharide biosynthesis protein  24.27 
 
 		 488 aa  67.4  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0264507  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5611  oligosaccharide translocase  24.7 
 
 		 470 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3948  polysaccharide biosynthesis protein  22.06 
 
 		 473 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3989  hypothetical protein  21.2 
 
 		 418 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.107923 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3702  polysaccharide exporter, PST family  20 
 
 		 420 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4207  polysaccharide biosynthesis protein  23.06 
 
 		 421 aa  66.2  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00266621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2971  polysaccharide biosynthesis protein  24.87 
 
 		 475 aa  63.9  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.224966  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5553  oligosaccharide translocase  23.32 
 
 		 471 aa  63.9  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0588  polysaccharide biosynthesis protein  28.71 
 
 		 410 aa  63.5  0.000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0284636  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1371  polysaccharide biosynthesis protein  24.22 
 
 		 472 aa  62  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3876  polysaccharide biosynthesis protein  27.7 
 
 		 427 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2498  polysaccharide biosynthesis protein  20.75 
 
 		 418 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1488  hypothetical protein  20.34 
 
 		 444 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0185846  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3084  hypothetical protein  19.42 
 
 		 419 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3144  hypothetical protein  19.42 
 
 		 444 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2192  hypothetical protein  19.42 
 
 		 444 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.422688  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0715  hypothetical protein  19.42 
 
 		 444 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2549  hypothetical protein  19.42 
 
 		 444 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3121  hypothetical protein  19.42 
 
 		 444 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.541873  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2065  hypothetical protein  19.42 
 
 		 444 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.269552  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1846  polysaccharide biosynthesis protein  25.56 
 
 		 433 aa  60.1  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0629  lipopolysaccharide/O-antigen transporter, putative  22.75 
 
 		 467 aa  59.3  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0741  putative lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.51 
 
 		 419 aa  59.7  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0413  membrane protein  20.46 
 
 		 418 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3272  polysaccharide biosynthesis protein  23.27 
 
 		 546 aa  58.5  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.509561  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5396  oligosaccharide translocase  23.55 
 
 		 473 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0892  polysaccharide biosynthesis protein  20.46 
 
 		 418 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.114426  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2268  polysaccharide biosynthesis protein  19.21 
 
 		 420 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.199754 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0573  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 477 aa  58.9  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000747167  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0862  polysaccharide biosynthesis protein  20.46 
 
 		 418 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3779  polysaccharide biosynthesis protein  24.54 
 
 		 438 aa  57.4  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1522  PST family polysaccharide transporter  22.85 
 
 		 478 aa  56.6  0.0000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00741299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1062  multi anti extrusion protein MatE  25.54 
 
 		 464 aa  56.6  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1407  PST family polysaccharide transporter  22.8 
 
 		 481 aa  56.2  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0605  polysaccharide biosynthesis protein  25.12 
 
 		 474 aa  55.5  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000992142  hitchhiker  0.0000000137366 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4125  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 542 aa  55.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1405  polysaccharide biosynthesis protein  22.41 
 
 		 418 aa  55.1  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000283826  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  24.58 
 
 		 490 aa  54.7  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0457  polysaccharide biosynthesis protein  23.61 
 
 		 488 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1828  polysaccharide biosynthesis protein  25.48 
 
 		 529 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2862  polysaccharide biosynthesis protein  27.09 
 
 		 500 aa  54.3  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1412  polysaccharide biosynthesis protein  22.47 
 
 		 474 aa  53.5  0.000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2181  polysaccharide biosynthesis protein  28.14 
 
 		 482 aa  53.5  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138361 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2748  polysaccharide biosynthesis protein  25.65 
 
 		 526 aa  53.5  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.327125  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0061  polysaccharide biosynthesis protein  24.73 
 
 		 523 aa  53.1  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3842  polysaccharide biosynthesis protein  22.64 
 
 		 499 aa  52.8  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.289536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2664  hypothetical protein  24.9 
 
 		 485 aa  52.8  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0177  polysaccharide biosynthesis protein  26.13 
 
 		 446 aa  52.8  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1361  polysaccharide biosynthesis protein  26.9 
 
 		 413 aa  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483225  unclonable  0.0000000256808 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5305  polysaccharide biosynthesis protein  20.85 
 
 		 502 aa  52  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0025  hypothetical protein  24.47 
 
 		 439 aa  51.6  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000686013  hitchhiker  0.00952871 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0823  polysaccharide biosynthesis protein  28.33 
 
 		 465 aa  51.6  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.110638  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0172  polysaccharide biosynthesis protein  30.6 
 
 		 433 aa  51.2  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.663645  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0796  polysaccharide biosynthesis protein  22.99 
 
 		 482 aa  51.6  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.733222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1649  polysaccharide synthase family protein  25.48 
 
 		 478 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.44301  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3697  polysaccharide biosynthesis protein  21.91 
 
 		 443 aa  50.8  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21180  polysaccharide biosynthesis protein  23.55 
 
 		 539 aa  50.8  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.275763  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4470  polysaccharide biosynthesis protein  23.27 
 
 		 493 aa  50.4  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6018  polysaccharide biosynthesis protein  21.39 
 
 		 433 aa  50.1  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.203106 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2176  exporter of O-antigen and teichoic acid  26.67 
 
 		 456 aa  50.1  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.311164 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0582  polysaccharide biosynthesis protein  23.26 
 
 		 479 aa  50.1  0.00009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3014  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  24.39 
 
 		 422 aa  50.1  0.00009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1467  polysaccharide biosynthesis protein  23.93 
 
 		 484 aa  49.7  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000343252  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6400  polysaccharide biosynthesis protein  21.96 
 
 		 431 aa  49.7  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.247838 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2041  polysaccharide biosynthesis protein  22.55 
 
 		 415 aa  49.3  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0334353  normal  0.0804458 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>