44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I1488 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA2192  hypothetical protein  96.4 
 
 
444 aa  709    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.422688  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2268  polysaccharide biosynthesis protein  78.12 
 
 
420 aa  650    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.199754 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0782  polysaccharide biosynthesis protein  80.19 
 
 
418 aa  635    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2065  hypothetical protein  96.4 
 
 
444 aa  709    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.269552  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3121  hypothetical protein  96.4 
 
 
444 aa  709    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.541873  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3084  hypothetical protein  96.18 
 
 
419 aa  655    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2549  hypothetical protein  96.4 
 
 
444 aa  709    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0715  hypothetical protein  96.4 
 
 
444 aa  709    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1488  hypothetical protein  100 
 
 
444 aa  861    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0185846  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3144  hypothetical protein  96.17 
 
 
444 aa  705    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0771  membrane protein  79.95 
 
 
418 aa  633  1e-180  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3989  hypothetical protein  81.62 
 
 
418 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.107923 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3702  polysaccharide exporter, PST family  77.88 
 
 
420 aa  610  1e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0919  polysaccharide biosynthesis protein  78.12 
 
 
420 aa  609  1e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0892  polysaccharide biosynthesis protein  81.82 
 
 
418 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.114426  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0413  membrane protein  81.82 
 
 
418 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0862  polysaccharide biosynthesis protein  81.82 
 
 
418 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2498  polysaccharide biosynthesis protein  81.58 
 
 
418 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3779  polysaccharide biosynthesis protein  33.81 
 
 
438 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0741  putative lipopolysaccharide biosynthesis protein  33 
 
 
419 aa  156  6e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2720  polysaccharide biosynthesis protein  32.66 
 
 
416 aa  141  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0371691  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0686  putative lipopolysaccharide O-SIDE chain biosynthesis transmembrane protein  28.9 
 
 
422 aa  130  6e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.599007  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  26.19 
 
 
444 aa  104  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1044  polysaccharide biosynthesis protein  25.59 
 
 
440 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.041441  hitchhiker  0.00655602 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2278  PST family polysaccharide export protein  80.36 
 
 
67 aa  97.8  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.608743 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  25.52 
 
 
449 aa  98.2  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  24.65 
 
 
444 aa  94.4  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1384  polysaccharide biosynthesis protein  24.71 
 
 
440 aa  89.4  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  25.12 
 
 
444 aa  88.6  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2285  polysaccharide biosynthesis protein  22.14 
 
 
449 aa  79  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.398242  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1236  polysaccharide biosynthesis protein  27.8 
 
 
482 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.286439 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0744  polysaccharide biosynthesis protein  22.04 
 
 
436 aa  77  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.923042  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1959  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 
451 aa  72  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0665  polysaccharide biosynthesis protein  19.71 
 
 
426 aa  66.6  0.0000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3189  polysaccharide biosynthesis protein  20.34 
 
 
446 aa  66.6  0.0000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.27784  hitchhiker  0.00540344 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2602  polysaccharide biosynthesis protein  22.72 
 
 
448 aa  62.8  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1766  polysaccharide biosynthesis protein  25.26 
 
 
441 aa  61.2  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4040  polysaccharide biosynthesis protein  20.64 
 
 
444 aa  57.8  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.519664  normal  0.589796 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2892  polysaccharide biosynthesis protein  21.95 
 
 
429 aa  55.5  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0727  polysaccharide biosynthesis protein  22.12 
 
 
478 aa  50.4  0.00006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.207142  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4497  polysaccharide biosynthesis protein  22.74 
 
 
472 aa  49.3  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3183  polysaccharide biosynthesis protein  24.78 
 
 
424 aa  48.5  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1343  polysaccharide biosynthesis protein  23.53 
 
 
432 aa  43.5  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3876  polysaccharide biosynthesis protein  24.15 
 
 
427 aa  43.1  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>