20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2278 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_2278  PST family polysaccharide export protein  100 
 
 
67 aa  136  7.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.608743 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2268  polysaccharide biosynthesis protein  93.33 
 
 
420 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.199754 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0919  polysaccharide biosynthesis protein  85 
 
 
420 aa  106  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3702  polysaccharide exporter, PST family  81.67 
 
 
420 aa  104  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0782  polysaccharide biosynthesis protein  82.76 
 
 
418 aa  103  7e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0771  membrane protein  82.76 
 
 
418 aa  103  8e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2498  polysaccharide biosynthesis protein  82.76 
 
 
418 aa  103  8e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0413  membrane protein  82.76 
 
 
418 aa  103  9e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0892  polysaccharide biosynthesis protein  82.76 
 
 
418 aa  103  9e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.114426  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0862  polysaccharide biosynthesis protein  82.76 
 
 
418 aa  103  9e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3989  hypothetical protein  82.76 
 
 
418 aa  103  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.107923 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2549  hypothetical protein  80.36 
 
 
444 aa  97.4  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2065  hypothetical protein  80.36 
 
 
444 aa  97.4  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.269552  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3121  hypothetical protein  80.36 
 
 
444 aa  97.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.541873  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2192  hypothetical protein  80.36 
 
 
444 aa  97.4  6e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.422688  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0715  hypothetical protein  80.36 
 
 
444 aa  97.4  6e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3144  hypothetical protein  80.36 
 
 
444 aa  97.1  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3084  hypothetical protein  80.36 
 
 
419 aa  97.1  7e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1488  hypothetical protein  80.36 
 
 
444 aa  97.1  7e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0185846  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3779  polysaccharide biosynthesis protein  42.31 
 
 
438 aa  52.8  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>