45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3779 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3779  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 438 aa  868    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2268  polysaccharide biosynthesis protein  34.2 
 
 		 420 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.199754 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0782  polysaccharide biosynthesis protein  33.65 
 
 		 418 aa  229  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0771  membrane protein  33.1 
 
 		 418 aa  229  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3989  hypothetical protein  33.8 
 
 		 418 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.107923 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3702  polysaccharide exporter, PST family  33.42 
 
 		 420 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0919  polysaccharide biosynthesis protein  34.5 
 
 		 420 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0862  polysaccharide biosynthesis protein  34.36 
 
 		 418 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0892  polysaccharide biosynthesis protein  34.12 
 
 		 418 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.114426  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0413  membrane protein  34.12 
 
 		 418 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2498  polysaccharide biosynthesis protein  33.71 
 
 		 418 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1488  hypothetical protein  32.73 
 
 		 444 aa  192  7e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0185846  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0715  hypothetical protein  33.52 
 
 		 444 aa  190  4e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2192  hypothetical protein  33.52 
 
 		 444 aa  190  4e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.422688  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2549  hypothetical protein  33.52 
 
 		 444 aa  190  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3121  hypothetical protein  33.52 
 
 		 444 aa  190  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.541873  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2065  hypothetical protein  33.52 
 
 		 444 aa  190  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.269552  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3084  hypothetical protein  33.52 
 
 		 419 aa  190  5e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3144  hypothetical protein  33.52 
 
 		 444 aa  190  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0741  putative lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.45 
 
 		 419 aa  184  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2720  polysaccharide biosynthesis protein  31.07 
 
 		 416 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0371691  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0686  putative lipopolysaccharide O-SIDE chain biosynthesis transmembrane protein  29.56 
 
 		 422 aa  144  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.599007  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  27.14 
 
 		 444 aa  106  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1384  polysaccharide biosynthesis protein  30 
 
 		 440 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  26.89 
 
 		 449 aa  101  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4040  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 444 aa  92.8  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.519664  normal  0.589796 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1044  polysaccharide biosynthesis protein  28.65 
 
 		 440 aa  90.9  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.041441  hitchhiker  0.00655602 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1959  polysaccharide biosynthesis protein  23 
 
 		 451 aa  87.8  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1766  polysaccharide biosynthesis protein  26.74 
 
 		 441 aa  81.6  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0744  polysaccharide biosynthesis protein  24.28 
 
 		 436 aa  79.7  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.923042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  27.27 
 
 		 444 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  22.96 
 
 		 444 aa  75.9  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0665  polysaccharide biosynthesis protein  22.85 
 
 		 426 aa  75.9  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2602  polysaccharide biosynthesis protein  24 
 
 		 448 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2285  polysaccharide biosynthesis protein  21.88 
 
 		 449 aa  74.3  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.398242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3189  polysaccharide biosynthesis protein  23.3 
 
 		 446 aa  68.6  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.27784  hitchhiker  0.00540344 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2062  polysaccharide biosynthesis protein  21.35 
 
 		 511 aa  60.1  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.445911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1343  polysaccharide biosynthesis protein  23.82 
 
 		 432 aa  59.3  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1236  polysaccharide biosynthesis protein  24.26 
 
 		 482 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286439 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2278  PST family polysaccharide export protein  42.31 
 
 		 67 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.608743 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3355  polysaccharide biosynthesis protein  23.93 
 
 		 423 aa  49.7  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0727  polysaccharide biosynthesis protein  23.35 
 
 		 478 aa  49.7  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.207142  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2892  polysaccharide biosynthesis protein  24.26 
 
 		 429 aa  48.5  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2983  polysaccharide biosynthesis protein  22.54 
 
 		 427 aa  46.6  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2012  polysaccharide biosynthesis protein  24.18 
 
 		 483 aa  46.2  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.715057 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>