64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1969 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1969  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
488 aa  956    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2289  polysaccharide biosynthesis protein  76.19 
 
 
484 aa  708    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2428  polysaccharide biosynthesis protein  76.19 
 
 
484 aa  708    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1873  polysaccharide biosynthesis family protein  76.4 
 
 
484 aa  710    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1665  polysaccharide biosynthesis family protein  76.4 
 
 
484 aa  710    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.702931  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0545  polysaccharide biosynthesis family protein  76.4 
 
 
484 aa  710    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3973  polysaccharide biosynthesis protein  74.54 
 
 
488 aa  690    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3362  polysaccharide biosynthesis protein  74.74 
 
 
488 aa  670    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4394  polysaccharide biosynthesis protein  74.54 
 
 
488 aa  690    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.681509  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2229  polysaccharide transporter  97.34 
 
 
488 aa  889    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0925528 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0694  polysaccharide biosynthesis family protein  77 
 
 
488 aa  724    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.731179  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4609  polysaccharide biosynthesis protein  74.54 
 
 
488 aa  665    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.286147  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2112  polysaccharide biosynthesis protein  75 
 
 
498 aa  677    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.306384 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1073  polysaccharide biosynthesis protein  80.28 
 
 
492 aa  756    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.610845 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3866  polysaccharide biosynthesis protein  74.54 
 
 
488 aa  669    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.377761  normal  0.957657 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1706  polysaccharide biosynthesis family protein  76.59 
 
 
488 aa  720    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.974383  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0753  polysaccharide biosynthesis family protein  76.59 
 
 
488 aa  720    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3556  polysaccharide biosynthesis protein  74.54 
 
 
488 aa  689    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.225239  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2518  polysaccharide exporter, (PST) family  53.07 
 
 
486 aa  475  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0230734 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0079  polysaccharide biosynthesis protein  33.74 
 
 
499 aa  237  3e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.75242  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3796  polysaccharide biosynthesis protein  33.75 
 
 
478 aa  237  3e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0076  polysaccharide biosynthesis protein  33.74 
 
 
499 aa  237  3e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.160586  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1344  polysaccharide biosynthesis protein  32.37 
 
 
488 aa  225  2e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3233  polysaccharide biosynthesis protein  28.36 
 
 
473 aa  194  4e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3487  polysaccharide biosynthesis protein  31.33 
 
 
424 aa  140  6e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0265796 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5347  polysaccharide biosynthesis protein  29.2 
 
 
422 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.775837  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0743  polysaccharide biosynthesis protein  24.82 
 
 
509 aa  137  4e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.197884  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1271  polysaccharide biosynthesis protein  28.67 
 
 
429 aa  131  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.958308  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2731  polysaccharide biosynthesis protein  27.92 
 
 
419 aa  120  7.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0750  polysaccharide biosynthesis protein  24.65 
 
 
468 aa  86.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1791  polysaccharide biosynthesis protein  24.44 
 
 
504 aa  71.2  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5012  putative polysaccharide biosynthesis protein  24 
 
 
499 aa  69.3  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0767  O-antigen transporter-like  23.8 
 
 
506 aa  63.2  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3995  polysaccharide biosynthesis protein  24.47 
 
 
497 aa  63.2  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.495687  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0645  polysaccharide biosynthesis protein  25.36 
 
 
533 aa  60.5  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1637  polysaccharide biosynthesis protein  20.33 
 
 
504 aa  58.5  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5560  polysaccharide biosynthesis protein, putative  24.44 
 
 
484 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3093  O-antigen and teichoic acid-like export protein  30.43 
 
 
507 aa  52  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3181  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  21.08 
 
 
501 aa  52.4  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0890  polysaccharide biosynthesis protein  23.49 
 
 
446 aa  51.6  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.267642  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3440  polysaccharide biosynthesis protein, putative  20.28 
 
 
504 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0552602  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0438  transporter of NadC family protein  23 
 
 
516 aa  50.4  0.00007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0809046  normal  0.0220844 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3222  polysaccharide biosynthesis protein  20.88 
 
 
504 aa  50.4  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0507176  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5222  polysaccharide biosynthesis protein  24.35 
 
 
484 aa  50.1  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0962  virulence factor MviN family protein  22.29 
 
 
511 aa  49.3  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0464  polysaccharide transporter protein, putative  23.35 
 
 
486 aa  49.3  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000125112  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0604  polysaccharide biosynthesis protein  23.35 
 
 
483 aa  49.3  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000572815  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1966  polysaccharide biosynthesis protein  20.16 
 
 
507 aa  48.9  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3155  polysaccharide biosynthesis protein  37.1 
 
 
457 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.910859  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1814  polysaccharide biosynthesis protein  25.5 
 
 
468 aa  48.5  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3859  polysaccharide biosynthesis protein  27.59 
 
 
461 aa  47.4  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0201275  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1522  PST family polysaccharide transporter  22.81 
 
 
478 aa  47.8  0.0005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00741299  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1572  polysaccharide biosynthesis protein  23.82 
 
 
502 aa  47.4  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1405  polysaccharide biosynthesis protein  37.14 
 
 
418 aa  47  0.0007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000283826  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0590  polysaccharide biosynthesis protein, putative  24.12 
 
 
483 aa  47  0.0008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000415804  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3059  polysaccharide biosynthesis protein  35.48 
 
 
454 aa  47  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4403  polysaccharide biosynthesis protein  35.16 
 
 
417 aa  45.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.279052  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0582  polysaccharide biosynthesis protein  38.16 
 
 
406 aa  45.1  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224366  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0457  polysaccharide biosynthesis protein  22.7 
 
 
488 aa  44.3  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3041  polysaccharide biosynthesis protein  22.01 
 
 
471 aa  43.9  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1929  polysaccharide biosynthesis protein  23.13 
 
 
424 aa  43.5  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.109004  normal  0.370568 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4228  polysaccharide biosynthesis protein  22.92 
 
 
486 aa  43.5  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0361  polysaccharide biosynthesis protein  22.49 
 
 
519 aa  43.1  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.602182  normal  0.0588594 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2555  polysaccharide biosynthesis protein  22.66 
 
 
513 aa  43.1  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>