63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2229 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A0753  polysaccharide biosynthesis family protein  75.98 
 
 		 488 aa  715    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4609  polysaccharide biosynthesis protein  73.92 
 
 		 488 aa  659    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.286147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2229  polysaccharide transporter  100 
 
 		 488 aa  956    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0925528 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4394  polysaccharide biosynthesis protein  74.33 
 
 		 488 aa  689    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.681509  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3362  polysaccharide biosynthesis protein  74.54 
 
 		 488 aa  670    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3556  polysaccharide biosynthesis protein  74.33 
 
 		 488 aa  688    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.225239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0694  polysaccharide biosynthesis family protein  76.39 
 
 		 488 aa  719    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.731179  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3866  polysaccharide biosynthesis protein  74.33 
 
 		 488 aa  669    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.377761  normal  0.957657 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0545  polysaccharide biosynthesis family protein  75.78 
 
 		 484 aa  706    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2112  polysaccharide biosynthesis protein  74.9 
 
 		 498 aa  676    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.306384 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3973  polysaccharide biosynthesis protein  74.33 
 
 		 488 aa  689    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2289  polysaccharide biosynthesis protein  75.57 
 
 		 484 aa  704    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1073  polysaccharide biosynthesis protein  80.28 
 
 		 492 aa  758    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.610845 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1706  polysaccharide biosynthesis family protein  75.98 
 
 		 488 aa  715    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.974383  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1969  polysaccharide biosynthesis protein  97.34 
 
 		 488 aa  914    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1665  polysaccharide biosynthesis family protein  75.78 
 
 		 484 aa  706    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.702931  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1873  polysaccharide biosynthesis family protein  75.78 
 
 		 484 aa  706    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2428  polysaccharide biosynthesis protein  75.57 
 
 		 484 aa  704    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2518  polysaccharide exporter, (PST) family  53.07 
 
 		 486 aa  475  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0230734 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0079  polysaccharide biosynthesis protein  33.87 
 
 		 499 aa  234  3e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.75242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0076  polysaccharide biosynthesis protein  33.87 
 
 		 499 aa  234  3e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.160586  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3796  polysaccharide biosynthesis protein  34.05 
 
 		 478 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1344  polysaccharide biosynthesis protein  32.37 
 
 		 488 aa  222  9.999999999999999e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3233  polysaccharide biosynthesis protein  29.2 
 
 		 473 aa  198  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3487  polysaccharide biosynthesis protein  30.58 
 
 		 424 aa  141  3e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0265796 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5347  polysaccharide biosynthesis protein  29.48 
 
 		 422 aa  136  8e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.775837  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0743  polysaccharide biosynthesis protein  24.69 
 
 		 509 aa  135  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.197884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1271  polysaccharide biosynthesis protein  28.43 
 
 		 429 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.958308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2731  polysaccharide biosynthesis protein  28.16 
 
 		 419 aa  121  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0750  polysaccharide biosynthesis protein  25.92 
 
 		 468 aa  87.8  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1791  polysaccharide biosynthesis protein  24.93 
 
 		 504 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5012  putative polysaccharide biosynthesis protein  24 
 
 		 499 aa  68.6  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0767  O-antigen transporter-like  23.8 
 
 		 506 aa  63.9  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3995  polysaccharide biosynthesis protein  23.56 
 
 		 497 aa  64.3  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.495687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1637  polysaccharide biosynthesis protein  21.01 
 
 		 504 aa  62  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0645  polysaccharide biosynthesis protein  25.65 
 
 		 533 aa  60.8  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5560  polysaccharide biosynthesis protein, putative  24.76 
 
 		 484 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3181  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  21.37 
 
 		 501 aa  54.3  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0962  virulence factor MviN family protein  23.17 
 
 		 511 aa  52  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0890  polysaccharide biosynthesis protein  24.2 
 
 		 446 aa  52.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.267642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5222  polysaccharide biosynthesis protein  24.68 
 
 		 484 aa  52  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3093  O-antigen and teichoic acid-like export protein  30.43 
 
 		 507 aa  52  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3440  polysaccharide biosynthesis protein, putative  21.57 
 
 		 504 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0552602  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0464  polysaccharide transporter protein, putative  23.65 
 
 		 486 aa  51.2  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000125112  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0604  polysaccharide biosynthesis protein  23.65 
 
 		 483 aa  50.8  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000572815  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3222  polysaccharide biosynthesis protein  21.18 
 
 		 504 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0507176  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0438  transporter of NadC family protein  23.45 
 
 		 516 aa  50.4  0.00007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0809046  normal  0.0220844 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1966  polysaccharide biosynthesis protein  20.71 
 
 		 507 aa  50.4  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1522  PST family polysaccharide transporter  22.9 
 
 		 478 aa  49.7  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00741299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1405  polysaccharide biosynthesis protein  38.57 
 
 		 418 aa  48.9  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000283826  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0590  polysaccharide biosynthesis protein, putative  24.76 
 
 		 483 aa  48.9  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000415804  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1814  polysaccharide biosynthesis protein  25.5 
 
 		 468 aa  48.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3155  polysaccharide biosynthesis protein  37.1 
 
 		 457 aa  48.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.910859  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2555  polysaccharide biosynthesis protein  22.7 
 
 		 513 aa  47  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3859  polysaccharide biosynthesis protein  26.63 
 
 		 461 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0201275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4403  polysaccharide biosynthesis protein  36.26 
 
 		 417 aa  46.6  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.279052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3041  polysaccharide biosynthesis protein  21.41 
 
 		 471 aa  46.6  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1572  polysaccharide biosynthesis protein  23.46 
 
 		 502 aa  46.6  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3059  polysaccharide biosynthesis protein  35.48 
 
 		 454 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1929  polysaccharide biosynthesis protein  23.51 
 
 		 424 aa  45.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.109004  normal  0.370568 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0457  polysaccharide biosynthesis protein  23.68 
 
 		 488 aa  45.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3724  O-antigen exporter/flippase  33.72 
 
 		 496 aa  44.3  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0582  polysaccharide biosynthesis protein  36.84 
 
 		 406 aa  43.9  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224366  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>