15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3724 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3724  O-antigen exporter/flippase  100 
 
 		 496 aa  971    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0767  O-antigen transporter-like  35.55 
 
 		 506 aa  267  4e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3181  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  30.66 
 
 		 501 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3440  polysaccharide biosynthesis protein, putative  30 
 
 		 504 aa  211  4e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0552602  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3222  polysaccharide biosynthesis protein  31.64 
 
 		 504 aa  207  4e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0507176  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3995  polysaccharide biosynthesis protein  29.46 
 
 		 497 aa  166  9e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.495687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1966  polysaccharide biosynthesis protein  26.34 
 
 		 507 aa  158  2e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1791  polysaccharide biosynthesis protein  21.41 
 
 		 504 aa  56.2  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5347  polysaccharide biosynthesis protein  23 
 
 		 422 aa  55.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.775837  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3233  polysaccharide biosynthesis protein  22.39 
 
 		 473 aa  50.1  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3796  polysaccharide biosynthesis protein  20.9 
 
 		 478 aa  47.8  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2731  polysaccharide biosynthesis protein  28.15 
 
 		 419 aa  46.2  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3487  polysaccharide biosynthesis protein  21.45 
 
 		 424 aa  46.6  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0265796 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2518  polysaccharide exporter, (PST) family  31.51 
 
 		 486 aa  44.7  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0230734 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2229  polysaccharide transporter  33.72 
 
 		 488 aa  44.3  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0925528 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>