60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1240 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1240  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 493 aa  978    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.554345  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2664  hypothetical protein  30.81 
 
 		 485 aa  204  4e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2459  polysaccharide biosynthesis protein  24.89 
 
 		 490 aa  95.1  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0605  polysaccharide biosynthesis protein  23.93 
 
 		 474 aa  94  5e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000992142  hitchhiker  0.0000000137366 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0528  cytosol aminopeptidase  24.25 
 
 		 464 aa  94  6e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1963  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  21.13 
 
 		 518 aa  84.3  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.876605  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3073  polysaccharide biosynthesis protein  24.39 
 
 		 491 aa  83.2  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0582  polysaccharide biosynthesis protein  24.82 
 
 		 479 aa  82  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0440  polysaccharide biosynthesis protein  23.47 
 
 		 501 aa  81.3  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.830934  normal  0.330866 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0941  polysaccharide biosynthesis protein  23.02 
 
 		 483 aa  77.4  0.0000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0474  putative polysaccharide transporter protein  23.63 
 
 		 488 aa  77.4  0.0000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000432304  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0722  hypothetical protein  24.18 
 
 		 430 aa  75.1  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.443233  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0772  polysaccharide biosynthesis protein  26.18 
 
 		 488 aa  74.7  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330011  normal  0.358074 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1307  polysaccharide biosynthesis protein  22.33 
 
 		 483 aa  74.3  0.000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1301  polysaccharide biosynthesis protein  22.77 
 
 		 483 aa  73.9  0.000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0621  polysaccharide biosynthesis protein  25.88 
 
 		 475 aa  71.6  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.914686  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0243  polysaccharide biosynthesis protein  24.05 
 
 		 472 aa  70.1  0.00000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117195 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03555  polysaccharide biosynthesis protein  22.32 
 
 		 461 aa  69.3  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0403  polysaccharide biosynthesis protein  23.74 
 
 		 504 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.963909  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3254  polysaccharide biosynthesis protein  21.76 
 
 		 482 aa  68.2  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08851  hypothetical protein  23.86 
 
 		 484 aa  63.5  0.000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.227884  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2426  polysaccharide biosynthesis protein  23.93 
 
 		 489 aa  63.5  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  23.97 
 
 		 488 aa  62.8  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3842  polysaccharide biosynthesis protein  21.12 
 
 		 499 aa  62.8  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.289536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1673  polysaccharide biosynthesis protein  24.81 
 
 		 487 aa  63.2  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0018  polysaccharide biosynthesis protein; permease component  22.52 
 
 		 506 aa  62.4  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1812  polysaccharide biosynthesis protein  21.97 
 
 		 482 aa  61.6  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 477 aa  61.2  0.00000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3014  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  21.8 
 
 		 422 aa  61.2  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3259  polysaccharide biosynthesis protein  23.45 
 
 		 418 aa  60.8  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1062  multi anti extrusion protein MatE  21.05 
 
 		 464 aa  60.1  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2139  polysaccharide biosynthesis protein  28.1 
 
 		 482 aa  58.9  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00876576  normal  0.418146 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2100  putative polysaccharide biosynthesis protein  23.58 
 
 		 415 aa  58.5  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30181  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3964  polysaccharide biosynthesis protein  19.91 
 
 		 500 aa  56.6  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.865833 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0196  polysaccharide biosynthesis protein  26.6 
 
 		 471 aa  55.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0256028  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0093  polysaccharide biosynthesis protein  21.75 
 
 		 496 aa  55.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0306  polysaccharide biosynthesis protein  20.7 
 
 		 467 aa  55.1  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0336  polysaccharide biosynthesis protein  21.94 
 
 		 504 aa  55.1  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0637  polysaccharide biosynthesis protein  24.82 
 
 		 468 aa  52.8  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0469  polysaccharide biosynthesis protein  20.09 
 
 		 511 aa  52.4  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1772  polysaccharide biosynthesis protein  20.75 
 
 		 496 aa  51.6  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  24.3 
 
 		 490 aa  51.2  0.00004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1959  polysaccharide biosynthesis protein  23.37 
 
 		 451 aa  50.8  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  27.91 
 
 		 499 aa  50.8  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0438  polysaccharide biosynthesis protein  21.93 
 
 		 504 aa  50.4  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1608  polysaccharide biosynthesis protein  23.58 
 
 		 492 aa  50.1  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2124  hypothetical protein  22.91 
 
 		 461 aa  49.7  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.553505 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1162  polysaccharide biosynthesis protein CpsL  22.43 
 
 		 466 aa  48.9  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.333664  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2862  polysaccharide biosynthesis protein  22.57 
 
 		 500 aa  48.5  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1745  polysaccharide biosynthesis protein  20.77 
 
 		 507 aa  49.3  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.183747 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2971  polysaccharide biosynthesis protein  26.05 
 
 		 475 aa  48.5  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.224966  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2128  polysaccharide biosynthesis protein  20.19 
 
 		 472 aa  47.4  0.0006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00415238  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1476  polysaccharide biosynthesis protein  27.88 
 
 		 478 aa  47  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.41524 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0508  polysaccharide biosynthesis protein  26.38 
 
 		 505 aa  47  0.0008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3026  polysaccharide biosynthesis protein  25.19 
 
 		 406 aa  47  0.0009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1532  hypothetical protein  35.29 
 
 		 493 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1071  polysaccharide biosynthesis protein  23.59 
 
 		 489 aa  45.8  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1120  polysaccharide biosynthesis protein  24.27 
 
 		 478 aa  45.1  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77221  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0202  polysaccharide biosynthesis protein  28.71 
 
 		 538 aa  44.7  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1684  polysaccharide biosynthesis protein  21.93 
 
 		 483 aa  44.3  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.821727  normal  0.0388648 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>