30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_5069 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1107  putative membrane protein involved in export of O-antigen  73.56 
 
 		 450 aa  654    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.361388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5069  Membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid-like protein  100 
 
 		 489 aa  978    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.932341  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1004  teichoic acid export membrane protein  74.36 
 
 		 450 aa  610  1e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2996  polysaccharide biosynthesis protein  24.81 
 
 		 459 aa  79.3  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143417 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3797  polysaccharide biosynthesis protein  23.97 
 
 		 461 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.683173  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3018  polysaccharide biosynthesis protein  23.34 
 
 		 468 aa  75.1  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3541  polysaccharide biosynthesis protein  24.19 
 
 		 474 aa  63.2  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3832  polysaccharide biosynthesis protein  23.49 
 
 		 471 aa  61.6  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.431872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2754  polysaccharide biosynthesis protein  22.09 
 
 		 460 aa  58.9  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.316209  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  28.19 
 
 		 499 aa  57.8  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1020  polysaccharide biosynthesis protein  27.33 
 
 		 490 aa  57.8  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3553  polysaccharide biosynthesis protein  20.96 
 
 		 458 aa  56.6  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5327  polysaccharide biosynthesis protein  27.01 
 
 		 445 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0472551  normal  0.0858273 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6968  PST family polysaccharide export protein  21.57 
 
 		 458 aa  55.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.756164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0926  polysaccharide biosynthesis protein  25.49 
 
 		 458 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.287187 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2006  polysaccharide biosynthesis protein  23.68 
 
 		 529 aa  52  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.300214  normal  0.433718 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4091  polysaccharide biosynthesis protein  22.81 
 
 		 430 aa  51.2  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1391  polysaccharide biosynthesis protein  21.99 
 
 		 456 aa  51.2  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4001  polysaccharide biosynthesis protein  21.8 
 
 		 455 aa  50.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.443077 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2373  polysaccharide biosynthesis protein  26.17 
 
 		 446 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.308358  hitchhiker  0.00106477 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0890  polysaccharide biosynthesis protein  25.65 
 
 		 407 aa  49.3  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362175  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3983  polysaccharide biosynthesis associated protein  21.46 
 
 		 467 aa  50.1  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2684  polysaccharide biosynthesis protein  24.1 
 
 		 539 aa  48.9  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4685  polysaccharide biosynthesis protein  21.07 
 
 		 453 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0987  polysaccharide biosynthesis protein  24.77 
 
 		 458 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.676741 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1411  polysaccharide biosynthesis protein  20.88 
 
 		 456 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1211  polysaccharide biosynthesis protein  27.54 
 
 		 489 aa  47  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  22.39 
 
 		 423 aa  46.6  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5559  polysaccharide biosynthesis protein  24.02 
 
 		 442 aa  45.8  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261987  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0950  polysaccharide biosynthesis protein  26.7 
 
 		 458 aa  44.7  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0259794  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>