49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0667 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0667  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 476 aa  919    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.529656 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1525  polysaccharide biosynthesis protein  28.99 
 
 		 475 aa  188  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1714  polysaccharide biosynthesis protein  32.34 
 
 		 483 aa  183  5.0000000000000004e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0396788  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2481  polysaccharide biosynthesis protein  30.3 
 
 		 477 aa  181  2e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206749  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0823  polysaccharide biosynthesis protein  26.33 
 
 		 465 aa  119  9e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.110638  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1684  polysaccharide biosynthesis protein  26.43 
 
 		 483 aa  101  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.821727  normal  0.0388648 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2076  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid-like protein  26.73 
 
 		 470 aa  95.5  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.54804 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2653  polysaccharide biosynthesis protein  24.19 
 
 		 480 aa  90.1  8e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.18747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2862  polysaccharide biosynthesis protein  23.19 
 
 		 500 aa  78.6  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1538  polysaccharide biosynthesis protein  26.7 
 
 		 480 aa  75.9  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5253  O-antigen and teichoic acid-like export protein  25.83 
 
 		 486 aa  71.6  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4624  hypothetical protein  28.15 
 
 		 471 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.187881 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4786  O-antigen and teichoic acid-like export protein  25.56 
 
 		 486 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.315626  normal  0.636766 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2088  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid-like protein  22.84 
 
 		 479 aa  66.6  0.0000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  22.48 
 
 		 488 aa  60.1  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5329  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid-like protein  24.13 
 
 		 486 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4652  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid-like protein  26.42 
 
 		 480 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.541983  normal  0.0587271 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0676  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid-like protein  25.27 
 
 		 479 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2128  polysaccharide biosynthesis protein  23.08 
 
 		 472 aa  55.8  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00415238  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0177  polysaccharide biosynthesis protein  25.34 
 
 		 446 aa  54.3  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1062  multi anti extrusion protein MatE  22.02 
 
 		 464 aa  53.9  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1673  polysaccharide biosynthesis protein  23.6 
 
 		 487 aa  53.5  0.000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0772  polysaccharide biosynthesis protein  21.48 
 
 		 488 aa  53.5  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330011  normal  0.358074 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03555  polysaccharide biosynthesis protein  22.12 
 
 		 461 aa  52.8  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3259  polysaccharide biosynthesis protein  23.54 
 
 		 418 aa  52  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2971  polysaccharide biosynthesis protein  22.72 
 
 		 475 aa  52.4  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.224966  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1959  polysaccharide biosynthesis protein  28.5 
 
 		 451 aa  51.2  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2972  polysaccharide biosynthesis protein  26.09 
 
 		 480 aa  50.4  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1071  polysaccharide biosynthesis protein  23.04 
 
 		 489 aa  50.4  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2947  polysaccharide biosynthesis protein  24.02 
 
 		 484 aa  50.4  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0446  putative polysaccharide export protein  22.87 
 
 		 360 aa  50.1  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0621  polysaccharide biosynthesis protein  22.65 
 
 		 475 aa  48.9  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.914686  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1062  polysaccharide synthase family protein  21.51 
 
 		 506 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000239702  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0787  polysaccharide biosynthesis protein  21.54 
 
 		 506 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0496201  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1772  polysaccharide biosynthesis protein  25.33 
 
 		 496 aa  48.1  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2347  polysaccharide biosynthesis protein  23.33 
 
 		 499 aa  47.8  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0391  polysaccharide biosynthesis protein  20.82 
 
 		 476 aa  47.4  0.0005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0972  polysaccharide synthase family protein  21.54 
 
 		 506 aa  47.4  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0956622 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0883  polysaccharide biosynthesis protein CsaA  21.14 
 
 		 506 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0796  polysaccharide biosynthesis protein  24.71 
 
 		 482 aa  46.6  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.733222  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0839  polysaccharide biosynthesis protein CsaA  21.14 
 
 		 506 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1812  polysaccharide biosynthesis protein  23.38 
 
 		 482 aa  45.8  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1963  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  23.64 
 
 		 518 aa  45.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.876605  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2137  polysaccharide biosynthesis protein  25.38 
 
 		 470 aa  45.4  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0971  polysaccharide biosynthesis protein CsaA  20.23 
 
 		 506 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.931032  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0457  polysaccharide biosynthesis protein  24.71 
 
 		 488 aa  44.3  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0691  polysaccharide biosynthesis protein  24.6 
 
 		 502 aa  44.3  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0890  polysaccharide biosynthesis protein  24.73 
 
 		 446 aa  43.9  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.267642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2892  polysaccharide biosynthesis protein  23.26 
 
 		 429 aa  43.9  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>