27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_6017 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_6017  polysaccharide efflux transporter  100 
 
 		 506 aa  990    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3790  polysaccharide biosynthesis protein  48.43 
 
 		 1103 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.500629 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4119  polysaccharide biosynthesis protein  48.04 
 
 		 1103 aa  438  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0869  polysaccharide biosynthesis protein  30.86 
 
 		 509 aa  169  8e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1078  polysaccharide biosynthesis protein  31.75 
 
 		 511 aa  154  4e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0468263  normal  0.981132 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5060  polysaccharide biosynthesis protein  23.23 
 
 		 478 aa  63.9  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2950  glycosyl transferase group 1  24.63 
 
 		 899 aa  59.7  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  23.78 
 
 		 490 aa  60.1  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2748  polysaccharide biosynthesis protein  26.95 
 
 		 526 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.327125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1965  polysaccharide biosynthesis protein  29.38 
 
 		 463 aa  58.2  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0295315 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0665  polysaccharide biosynthesis protein  22.69 
 
 		 426 aa  57.8  0.0000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  29.12 
 
 		 444 aa  56.6  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4228  polysaccharide biosynthesis protein  24.38 
 
 		 486 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1828  polysaccharide biosynthesis protein  26.67 
 
 		 529 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  26.71 
 
 		 483 aa  55.1  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0025  hypothetical protein  24.69 
 
 		 439 aa  53.9  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000686013  hitchhiker  0.00952871 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  25.87 
 
 		 444 aa  49.3  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0929  polysaccharide biosynthesis protein  22.34 
 
 		 489 aa  48.1  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1959  polysaccharide biosynthesis protein  22.02 
 
 		 451 aa  47.8  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0234  lipopolysaccharide O-side chain biosynthesis protein (O-antigen transpoter)  22.29 
 
 		 476 aa  47.4  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00421263  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0457  polysaccharide biosynthesis protein  23.23 
 
 		 488 aa  47  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1142  PST family polysaccharide transporter  23.11 
 
 		 475 aa  47  0.0008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000134656  hitchhiker  0.0000175319 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2062  polysaccharide biosynthesis protein  24.81 
 
 		 511 aa  46.6  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.445911  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  27.57 
 
 		 444 aa  46.6  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3355  polysaccharide biosynthesis protein  23.26 
 
 		 423 aa  46.2  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2304  polysaccharide biosynthesis protein  27.56 
 
 		 494 aa  43.5  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.298994  normal  0.0362143 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1353  polysaccharide biosynthesis protein  20.05 
 
 		 486 aa  43.5  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>