33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0302 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0302  maturase-related protein  100 
 
 		 421 aa  818    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1959  polysaccharide biosynthesis protein  21.81 
 
 		 451 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  24.25 
 
 		 449 aa  80.1  0.00000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  19.86 
 
 		 444 aa  76.6  0.0000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  19.9 
 
 		 444 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  25.13 
 
 		 477 aa  70.5  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4040  polysaccharide biosynthesis protein  21.38 
 
 		 444 aa  69.3  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.519664  normal  0.589796 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0665  polysaccharide biosynthesis protein  20.49 
 
 		 426 aa  67.4  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  18.83 
 
 		 444 aa  64.7  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0391  polysaccharide biosynthesis protein  23.76 
 
 		 476 aa  63.2  0.000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1236  polysaccharide biosynthesis protein  17.96 
 
 		 482 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286439 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1384  polysaccharide biosynthesis protein  23.19 
 
 		 440 aa  61.2  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0457  polysaccharide biosynthesis protein  21.14 
 
 		 488 aa  59.7  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0253  polysaccharide biosynthesis protein  23.25 
 
 		 435 aa  57.8  0.0000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000123579  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1929  polysaccharide biosynthesis protein  23.84 
 
 		 424 aa  55.8  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.109004  normal  0.370568 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0727  polysaccharide biosynthesis protein  25.06 
 
 		 478 aa  53.1  0.000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.207142  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0588  polysaccharide biosynthesis protein  22.95 
 
 		 410 aa  50.8  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0284636  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2892  polysaccharide biosynthesis protein  24.12 
 
 		 429 aa  50.1  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0508  polysaccharide biosynthesis protein  25.71 
 
 		 505 aa  48.9  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2602  polysaccharide biosynthesis protein  23.53 
 
 		 448 aa  48.5  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1531  GumJ protein  23.53 
 
 		 510 aa  47  0.0006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.107996  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1475  polysaccharide biosynthesis protein  23.53 
 
 		 510 aa  47  0.0006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.005815  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0573  polysaccharide biosynthesis protein  25.38 
 
 		 477 aa  46.2  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000747167  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2176  exporter of O-antigen and teichoic acid  24.76 
 
 		 456 aa  45.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.311164 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0691  polysaccharide biosynthesis protein  22.86 
 
 		 502 aa  45.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1766  polysaccharide biosynthesis protein  19.4 
 
 		 441 aa  44.3  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0234  lipopolysaccharide O-side chain biosynthesis protein (O-antigen transpoter)  23.08 
 
 		 476 aa  44.3  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00421263  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1968  polysaccharide biosynthesis protein  20.88 
 
 		 477 aa  43.9  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.901691  hitchhiker  0.000000136517 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4228  polysaccharide biosynthesis protein  19.53 
 
 		 486 aa  43.5  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1496  PST family polysaccharide transporter  20.73 
 
 		 484 aa  43.1  0.008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.104259  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1142  PST family polysaccharide transporter  20.54 
 
 		 475 aa  43.1  0.008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000134656  hitchhiker  0.0000175319 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4125  polysaccharide biosynthesis protein  19.15 
 
 		 542 aa  43.1  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0744  polysaccharide biosynthesis protein  21.22 
 
 		 436 aa  43.1  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.923042  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>